基因页：SLIT2

Summary？
基因 9353
象征 SLIT2
Synonyms SLIL3|Slit-2
Description 缝指导配体2
参考erence MIM：603746|HGNC：HGNC：11086|Ensembl:ENSG00000145147|HPRD：04776|Vega：Otthumg00000128551
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P15.2
Pascal P值 0.081
Sherlock p-value 0.144
TADA P值 0.022
胎儿β -0.905
主持人 Myers' cis & trans
支持 Ascano FMRP目标
潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：7

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
SLIT2 CHR4 20530671 一个 C NM_004787 p.521n> t missense Schizophrenia DNM：Gulsuner_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17014160 CHR1 206855799 SLIT2 9353 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TPX2 0.99 0.88
bub1b 0.99 0.83
BUB1 0.99 0.80
梅尔克 0.98 0.81
PRC1 0.98 0.81
KIF15 0.98 0.80
CDCA2 0.98 0.77
exo1 0.98 0.79
CEP55 0.98 0.80
MCM10 0.98 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.38 -0.72
FBXO2 -0.38 -0.60
pth1r -0.38 -0.65
C5orf53 -0.38 -0.65
SLC9A3R2 -0.38 -0.41
AF347015.27 -0.37 -0.80
AIFM3 -0.37 -0.68
AF347015.31 -0.37 -0.80
TNFSF12 -0.37 -0.61
aldoc -0.37 -0.65

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005102 受体结合 TAS 神经递质（GO期限：4） 10102268
去：0005509 calcium ion binding IEA -
GO:0004963 卵泡刺激激素受体活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0031290 视网膜神经节细胞轴突指导 IEA 轴突，大脑（GO期限：14） -
GO:0008045 电机轴突指导 TAS 神经元，轴突（GO术语级别：14） 10102268
去：0008038 神经元识别 TAS 神经元（GO期限：4） 10432110
去：0008347 神经胶质细胞迁移 IMP 神经元，神经胶（GO期限：8） 10102268
GO：0050772 轴突发生的阳性调控 TAS 轴突，神经发生（GO期限：14） 10197527
去：0007399 nervous system development TAS 神经突（GO期限：5） 9813312
GO:0001657 ureteric bud development IMP 15130495
去：0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 IEA -
去：0007509 mesoderm migration IMP 10102268
去：0007608 气味的感官感知 TAS 10102269
去：0006935 chemotaxis IEA -
去：0007275 multicellular organismal development IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
GO:0050929 induction of negative chemotaxis 艾达 10197527
GO:0050929 induction of negative chemotaxis IMP 10102268
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 艾达 10102268
去：0005615 细胞外空间 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG轴突指导 129 103 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Glypican 1 Pathway 27 20 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME DEVELOPMENTAL BIOLOGY 396 292 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Axon指导 251 188 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
RAC的反应组激活 14 11 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Robo受体的反应组信号传导 30 26 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Netrin1信号传导 41 30 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
GAL LEUKEMIC STEM CELL UP 133 78 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Vecchi胃癌先进与早期 175 120 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY DN 367 220 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 DN 67 43 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌变性DN 537 339 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌DN 77 52 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP63目标 355 243 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53和TP63目标 205 145 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Seitz肿瘤转化通过8p删除 73 47 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER SOX9 TARGETS IN PROSTATE DEVELOPMENT DN 45 33 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath PRC2目标 652 441 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Frasor对雌二醇DN的反应 82 52 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染16小时DN 86 62 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Delaserna Myod目标DN 57 42 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血干细胞 254 164 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2向上 428 266 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
外邦紫外线低剂量DN 67 46 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR UP 430 288 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞向上 260 174 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
woo肝癌复发 105 75 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
钱德兰转移DN 306 191 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标增长 243 155 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN 505 328 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标1 DN 63 39 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
棕熊UVC响应迟到 1137 655 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
PLASARI NFIC TARGETS BASAL DN 18 13 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang MLL目标 289 188 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞向上 489 314 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM糖蛋白 196 99 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA CORE MATRISOME 275 148 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA MATRISOME 1028 559 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway