基因页:ube4a
概括?
基因 | 9354 |
象征 | ube4a |
同义词 | e4 | ubox2 | ufd2 |
描述 | 泛素化因子E4A |
参考 | MIM:603753|HGNC:HGNC:12499|ENSEMBL:ENSG00000110344|HPRD:06793|Vega:Otthumg00000168100 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q23.3 |
Pascal P值 | 0.005 |
Sherlock P值 | 0.28 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UBE4A_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
钩1 | 0.88 | 0.87 |
C9orf4 | 0.86 | 0.82 |
NRXN3 | 0.86 | 0.88 |
MKL2 | 0.86 | 0.86 |
WDR17 | 0.85 | 0.81 |
RIMS2 | 0.85 | 0.85 |
DNAJC27 | 0.84 | 0.86 |
KCTD16 | 0.84 | 0.79 |
park2 | 0.84 | 0.89 |
CHM | 0.84 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EFEMP2 | -0.40 | -0.44 |
nudt8 | -0.38 | -0.41 |
AP003068.3 | -0.37 | -0.35 |
SLC38A5 | -0.36 | -0.43 |
EIF4EBP3 | -0.35 | -0.36 |
DBI | -0.34 | -0.40 |
Bcl7c | -0.34 | -0.41 |
C1orf61 | -0.34 | -0.46 |
Rhoc | -0.34 | -0.41 |
HEBP2 | -0.34 | -0.39 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
去:0004842 | 泛素 - 蛋白连接酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | 塔斯 | 10089879 | |
GO:0016567 | 蛋白质泛素化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000151 | 泛素连接酶复合物 | 塔斯 | 10089879 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发12小时 | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 | 151 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haslinger B Cll,带有11q23删除 | 23 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yokoe Cancer testis抗原 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
停放APL发病机理 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 2685 | 2692 | 1A,M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-124/506 | 2043 | 2049 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-128 | 3 | 9 | 1a | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
mir-142-5p | 2477 | 2483 | M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-144 | 1 | 7 | M8 | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
mir-21 | 1664年 | 1670年 | M8 | HSA-MIR-21脑 | uagcuuaucagacugauguuga |
HSA-MIR-590 | gagcuuauucauaaaaagugcag | ||||
mir-214 | 1965年 | 1971年 | 1a | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
mir-224 | 2762 | 2768 | 1a | HSA-MIR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
mir-27 | 3 | 10 | 1A,M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-381 | 2739 | 2745 | M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |