概括
基因 9354
象征 ube4a
同义词 e4 | ubox2 | ufd2
描述 泛素化因子E4A
参考 MIM:603753|HGNC:HGNC:12499|ENSEMBL:ENSG00000110344|HPRD:06793|Vega:Otthumg00000168100
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.3
Pascal P值 0.005
Sherlock P值 0.28

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
钩1 0.88 0.87
C9orf4 0.86 0.82
NRXN3 0.86 0.88
MKL2 0.86 0.86
WDR17 0.85 0.81
RIMS2 0.85 0.85
DNAJC27 0.84 0.86
KCTD16 0.84 0.79
park2 0.84 0.89
CHM 0.84 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EFEMP2 -0.40 -0.44
nudt8 -0.38 -0.41
AP003068.3 -0.37 -0.35
SLC38A5 -0.36 -0.43
EIF4EBP3 -0.35 -0.36
DBI -0.34 -0.40
Bcl7c -0.34 -0.41
C1orf61 -0.34 -0.46
Rhoc -0.34 -0.41
HEBP2 -0.34 -0.39

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0004842 泛素 - 蛋白连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 塔斯 10089879
GO:0016567 蛋白质泛素化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000151 泛素连接酶复合物 塔斯 10089879

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haslinger B Cll,带有11q23删除 23 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yokoe Cancer testis抗原 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
停放APL发病机理 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 2685 2692 1A,M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-124/506 2043 2049 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 3 9 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-142-5p 2477 2483 M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-144 1 7 M8 HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-21 1664年 1670年 M8 HSA-MIR-21 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-214 1965年 1971年 1a HSA-MIR-214 acagcaggcacagacaggcag
mir-224 2762 2768 1a HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-27 3 10 1A,M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-381 2739 2745 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu