基因页：cacna2d4
概括？
| 基因 | 93589 |
| 象征 | cacna2d4 |
| 同义词 | RCD4 |
| 描述 | 钙电压门控通道辅助亚基Alpha2delta 4 |
| 参考 | MIM：608171|HGNC：HGNC：20202|ENSEMBL：ENSG00000151062|HPRD：12182|Vega：Otthumg00000168111 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12p13.33 |
| Pascal P值 | 6.269E-4 |
| 胎儿β | 0.325 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | canabinoid 多巴胺 兴奋性 代谢性谷氨酸受体 5-羟色胺 COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24105081 | 12 | 1947479 | cacna2d4 | 1.212E-4 | 0.797 | 0.029 | DMG：Wockner_2014 |
| CG06937491 | 12 | 1943722 | lrtm2; cacna2d4 | 3.233E-4 | 0.671 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6666913 | CHR1 | 237092144 | cacna2d4 | 93589 | 0.03 | 反式 | ||
| RS16865199 | CHR2 | 6621910 | cacna2d4 | 93589 | 0.18 | 反式 | ||
| RS16865228 | CHR2 | 6629622 | cacna2d4 | 93589 | 0.17 | 反式 | ||
| RS16865230 | CHR2 | 6630187 | cacna2d4 | 93589 | 0.17 | 反式 | ||
| RS11691188 | CHR2 | 6631799 | cacna2d4 | 93589 | 0.17 | 反式 | ||
| RS7609917 | CHR3 | 76094301 | cacna2d4 | 93589 | 0.1 | 反式 | ||
| RS2324466 | CHR3 | 76100753 | cacna2d4 | 93589 | 0.04 | 反式 | ||
| RS17013713 | CHR3 | 76105150 | cacna2d4 | 93589 | 0.08 | 反式 | ||
| RS17013722 | CHR3 | 76107656 | cacna2d4 | 93589 | 0.04 | 反式 | ||
| RS17013724 | CHR3 | 76107684 | cacna2d4 | 93589 | 0.04 | 反式 | ||
| RS11734196 | CHR4 | 102796071 | cacna2d4 | 93589 | 0.04 | 反式 | ||
| RS10212684 | CHR4 | 102822506 | cacna2d4 | 93589 | 0.01 | 反式 | ||
| RS9986296 | CHR5 | 3199318 | cacna2d4 | 93589 | 0.08 | 反式 | ||
| RS16896683 | CHR6 | 43687846 | cacna2d4 | 93589 | 0.17 | 反式 | ||
| RS1017329 | CHR8 | 40281396 | cacna2d4 | 93589 | 0.13 | 反式 | ||
| RS16920368 | CHR8 | 55392852 | cacna2d4 | 93589 | 0.05 | 反式 | ||
| RS2069410 | CHR12 | 56364644 | cacna2d4 | 93589 | 9.923E-4 | 反式 | ||
| RS11115597 | CHR12 | 83509142 | cacna2d4 | 93589 | 0.05 | 反式 | ||
| RS11105124 | CHR12 | 89375908 | cacna2d4 | 93589 | 0.14 | 反式 | ||
| RS4770243 | CHR13 | 22662276 | cacna2d4 | 93589 | 0.1 | 反式 | ||
| RS17834315 | CHR13 | 37991091 | cacna2d4 | 93589 | 0.01 | 反式 | ||
| RS9542625 | CHR13 | 71811344 | cacna2d4 | 93589 | 0.05 | 反式 | ||
| RS16939821 | CHR15 | 58449860 | cacna2d4 | 93589 | 0.19 | 反式 | ||
| RS16946329 | CHR15 | 63324362 | cacna2d4 | 93589 | 0.11 | 反式 | ||
| RS17142983 | CHR16 | 7294508 | cacna2d4 | 93589 | 0.04 | 反式 | ||
| RS6514759 | 0 | cacna2d4 | 93589 | 0.17 | 反式 | |||
| RS12811035 | 12 | 1901546 | cacna2d4 | ENSG00000151062.10 | 3.008e-6 | 0 | 126456 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6489330 | 12 | 1907853 | cacna2d4 | ENSG00000151062.10 | 1.418E-7 | 0 | 120149 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2286378 | 12 | 1909979 | cacna2d4 | ENSG00000151062.10 | 1.218E-7 | 0 | 118023 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg心肌收缩 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG肥厚性心肌病HCM | 85 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG心律失常右心肌病ARVC | 76 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG扩张心肌病 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MariaDason对丁酸酯Sulindac 4的反应 | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |