基因页：LONP1
概括？
| 基因 | 9361 |
| 象征 | LONP1 |
| 同义词 | 鳕鱼| lon | lonp | lonhs | pim1 | prss15 | hlon |
| 描述 | LON肽酶1，线粒体 |
| 参考 | MIM：605490|HGNC：HGNC：9479|ENSEMBL：ENSG00000196365|HPRD：05689|Vega：Otthumg00000180504 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13.2 |
| Pascal P值 | 0.113 |
| Sherlock P值 | 0.407 |
| 胎儿β | -0.392 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LONP1 | CHR19 | 5696708 | C | 一个 | NM_001276479 NM_001276480 NM_004793 NR_076392 |
。 。 。 。 |
沉默的 沉默的 沉默的 npcrna |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG09964670 | 19 | 5720572 | TMEM146; LONP1 | 4.983E-4 | -0.18 | 0.047 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11748625 | CHR5 | 141184445 | LONP1 | 9361 | 0.13 | 反式 | ||
| RS160436 | CHR8 | 90681454 | LONP1 | 9361 | 0.01 | 反式 | ||
| RS708691 | 19 | 5615670 | LONP1 | ENSG00000196365.7 | 1.37154E-6 | 0.01 | 104913 | gtex_brain_ba24 |
| RS806707 | 19 | 5615734 | LONP1 | ENSG00000196365.7 | 1.10517E-6 | 0.01 | 104849 | gtex_brain_ba24 |
| RS35832694 | 19 | 5684775 | LONP1 | ENSG00000196365.7 | 2.63504E-7 | 0.01 | 35808 | gtex_brain_ba24 |
| RS3892355 | 19 | 5696962 | LONP1 | ENSG00000196365.7 | 3.98215E-8 | 0.01 | 23621 | gtex_brain_ba24 |
| RS806707 | 19 | 5615734 | LONP1 | ENSG00000196365.7 | 7.86464E-7 | 0.02 | 104849 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10424357 | 19 | 5672663 | LONP1 | ENSG00000196365.7 | 2.14026E-6 | 0.02 | 47920 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：7） | - |
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| 去：0004176 | ATP依赖性肽酶活性 | IEA | - | |
| 去：0004176 | ATP依赖性肽酶活性 | 塔斯 | 8248235 | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0017111 | 核苷 - 三磷酸酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006510 | ATP依赖性蛋白水解 | IEA | - | |
| 去：0006952 | 国防反应 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
| 去：0005739 | 线粒体 | 塔斯 | 8248235 | |
| 去：0005759 | 线粒体基质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU血管生成DN | 37 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heidenblad Amplicon 8Q24 UP | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王HCP前列腺癌 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Marciniak ER应力响应通过CHOP | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee衰老的肌肉DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成年时期峰值2小时 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群T7 | 98 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| iritani mad1靶向DN | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |