基因页：TJAP1
概括？
| 基因 | 93643 |
| 象征 | TJAP1 |
| 同义词 | PILT | TJP4 |
| 描述 | 紧密连接相关蛋白1 |
| 参考 | MIM：612658|HGNC：HGNC：17949|ENSEMBL：ENSG00000137221|HPRD：10269|Vega：Otthumg0000000014736 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.1 |
| Pascal P值 | 4.853e-5 |
| Sherlock P值 | 0.37 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04433 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS3095798 | Chr10 | 103299266 | TJAP1 | 93643 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15263016 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005923 | 紧密连接 | IEA | 大脑（GO期限：10） | - |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN | 180 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-132/212 | 624 | 631 | 1A，M8 | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
| HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
| mir-194 | 626 | 632 | M8 | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |