基因页:ARHGAP18
概括?
基因 | 93663 |
象征 | ARHGAP18 |
同义词 | MacGap | Senex | BA307O14.2 |
描述 | Rho GTPase激活蛋白18 |
参考 | MIM:613351|HGNC:HGNC:21035|Ensembl:ENSG00000146376|HPRD:12474|Vega:Otthumg0000000015547 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q22.33 |
Pascal P值 | 0.536 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID:COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005096 | GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP靶向DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2向上 | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化肾脏无血液DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kras Pten DN的Iwanaga癌变 | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9Me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer存活DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤PR DN | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP,带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞差异化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向 | 135 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 133 | 139 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |