概括
基因 9371
象征 kif3b
同义词 FLA8 | HH0048 | KLP-11
描述 动机家庭成员3B
参考 MIM:603754|HGNC:HGNC:6320|Ensembl:ENSG00000101350|HPRD:04781|Vega:Otthumg0000000032214
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q11.21
Pascal P值 0.115
Sherlock P值 0.594
胎儿β 0.322
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02729805 20 30865674 kif3b 6.93e-8 -0.009 1.68e-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
COPS3 0.92 0.88
DRG1 0.91 0.89
MRPS35 0.91 0.88
UQCRC2 0.91 0.87
PPA1 0.90 0.89
eapp 0.90 0.88
PSMA1 0.90 0.87
GTF2B 0.90 0.88
CIRH1A 0.89 0.88
ECD 0.89 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.2 -0.73 -0.67
mt-cyb -0.73 -0.68
AF347015.8 -0.72 -0.68
MT-CO2 -0.72 -0.67
AF347015.26 -0.72 -0.70
AF347015.15 -0.71 -0.68
AF347015.31 -0.69 -0.66
AF347015.33 -0.68 -0.65
AF347015.27 -0.68 -0.66
AF347015.18 -0.66 -0.71

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0008574 加上定向的微管运动活动 塔斯 7559760
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008089 顺行轴突货运运输 塔斯 轴突(GO术语级别:9) 7559760
去:0007368 确定左/右对称性 塔斯 9865700
去:0007018 基于微管的运动 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005873 加末端动力蛋白复合物 塔斯 7559760
去:0005874 微管 IEA -
去:0005875 微管相关的复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome MHC II类抗原表现 91 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 132 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome驱动力 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer PTHLH靶向DN 73 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCL1扩增靶向DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUMATA CSF3通过STAT3发出信号传导 22 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin IL2响应foxp3靶向 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshioka肝癌早期复发DN 65 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 3022 3028 M8 HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-127 2586 2593 1A,M8 HSA-MIR-127 ucggauccgugugagcuuggcu
mir-137 659 665 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-143 210 216 1a HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 789 795 1a HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-181 2885 2891 1a HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-24 2665 2671 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-29 2563 2569 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-378 1610 1616年 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-496 3627 3633 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 2969 2975 M8 HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu