基因页:kif3b
概括?
基因 | 9371 |
象征 | kif3b |
同义词 | FLA8 | HH0048 | KLP-11 |
描述 | 动机家庭成员3B |
参考 | MIM:603754|HGNC:HGNC:6320|Ensembl:ENSG00000101350|HPRD:04781|Vega:Otthumg0000000032214 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q11.21 |
Pascal P值 | 0.115 |
Sherlock P值 | 0.594 |
胎儿β | 0.322 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02729805 | 20 | 30865674 | kif3b | 6.93e-8 | -0.009 | 1.68e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KIF3B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
COPS3 | 0.92 | 0.88 |
DRG1 | 0.91 | 0.89 |
MRPS35 | 0.91 | 0.88 |
UQCRC2 | 0.91 | 0.87 |
PPA1 | 0.90 | 0.89 |
eapp | 0.90 | 0.88 |
PSMA1 | 0.90 | 0.87 |
GTF2B | 0.90 | 0.88 |
CIRH1A | 0.89 | 0.88 |
ECD | 0.89 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.2 | -0.73 | -0.67 |
mt-cyb | -0.73 | -0.68 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.68 |
MT-CO2 | -0.72 | -0.67 |
AF347015.26 | -0.72 | -0.70 |
AF347015.15 | -0.71 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.65 |
AF347015.27 | -0.68 | -0.66 |
AF347015.18 | -0.66 | -0.71 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0008574 | 加上定向的微管运动活动 | 塔斯 | 7559760 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008089 | 顺行轴突货运运输 | 塔斯 | 轴突(GO术语级别:9) | 7559760 |
去:0007368 | 确定左/右对称性 | 塔斯 | 9865700 | |
去:0007018 | 基于微管的运动 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005873 | 加末端动力蛋白复合物 | 塔斯 | 7559760 | |
去:0005874 | 微管 | IEA | - | |
去:0005875 | 微管相关的复合物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome MHC II类抗原表现 | 91 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome驱动力 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer PTHLH靶向DN | 73 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM MYCL1扩增靶向DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌转移 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUMATA CSF3通过STAT3发出信号传导 | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin IL2响应foxp3靶向 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向 | 93 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshioka肝癌早期复发DN | 65 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-103/107 | 3022 | 3028 | M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-127 | 2586 | 2593 | 1A,M8 | HSA-MIR-127脑 | ucggauccgugugagcuuggcu |
mir-137 | 659 | 665 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-143 | 210 | 216 | 1a | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 789 | 795 | 1a | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu | ||||
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-181 | 2885 | 2891 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-24 | 2665 | 2671 | 1a | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
mir-29 | 2563 | 2569 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
mir-378 | 1610 | 1616年 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
mir-496 | 3627 | 3633 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 2969 | 2975 | M8 | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu |