基因页：NRXN2

概括？
基因 9379
象征 NRXN2
同义词 -
描述 Neurexin 2
参考 MIM：600566|HGNC：HGNC：8009|Ensembl：ENSG00000110076|HPRD：11859|Vega：Otthumg0000000045214
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13
Pascal P值 0.062
胎儿β -0.493
DMG 2（＃研究）
支持 细胞粘附和透射信号传导
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 4
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 4
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
NRXN2 Chr11 64435116 C t NM_015080
NM_138732		 。
。		 沉默的
沉默的		 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG27243166 11 64479496 NRXN2 1.26E-6 0.48 0.007 DMG：Wockner_2014
CG03035661 11 64409932 NRXN2 2.27E-5 0.894 0.017 DMG：Wockner_2014
CG26388730 11 64405764 NRXN2 8.96e-5 0.348 0.027 DMG：Wockner_2014
CG21996761 11 64428434 NRXN2 2.96E-8 0.017 9.1E-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rad23b 0.94 0.93
CS 0.94 0.94
EHBP1 0.93 0.94
PDXDC1 0.93 0.93
IARS 0.93 0.93
C4ORF41 0.93 0.93
AP1G1 0.93 0.94
Rabgef1 0.93 0.92
WDR47 0.93 0.95
Cul1 0.93 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.83 -0.85
MT-CO2 -0.83 -0.85
AF347015.8 -0.81 -0.84
AF347015.33 -0.79 -0.82
AF347015.21 -0.79 -0.84
AF347015.27 -0.79 -0.83
FXYD1 -0.79 -0.83
mt-cyb -0.79 -0.81
higd1b -0.79 -0.83
AF347015.2 -0.78 -0.83

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对高清MTX DN的响应 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因