概括
基因 939
象征 CD27
同义词 S152 | S152。LPFS2 | T14 | TNFRSF7 | TP55
描述 CD27分子
参考 MIM:186711|HGNC:HGNC:11922|Ensembl:ENSG00000139193|HPRD:01723|Vega:Otthumg00000168316
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p13
Pascal P值 0.928
DEG P值 DEG:SANDERS_2014:DS1_P = -0.159:DS1_BETA = 0.013300:DS2_P = 7.01E-01:DS2_BETA = 0.017:DS2_FDR = 8.57E-011
胎儿β -0.163
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DEG:Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08519905 12 6308774 CD27 8.17e-7 7.229 DMG:Vaneijk_2014
CG15784615 12 6493767 CD27 4.85e-5 6.637 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Korkola Seminoma UP 44 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC和TFRC的Odonnell目标 83 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dirmeier LMP1响应晚期DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 108 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱因原发性积液淋巴瘤DN 58 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang由Hoxa9和Meis1 DN永生 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD2 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索CD40信号传导DN 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 DN 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ehrlich ICF综合症DN 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴维斯多发性骨髓瘤与MGUS DN 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee早期T淋巴细胞DN 57 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因