基因页:CIAO1
概括?
基因 | 9391 |
象征 | CIAO1 |
同义词 | CIA1 | WDR39 |
描述 | 胞质铁硫组件1 |
参考 | MIM:604333|HGNC:HGNC:14280|HPRD:16057| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q11.2 |
Pascal P值 | 2.108E-5 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0004 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CIAO1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ptprr | 0.77 | 0.78 |
arl1 | 0.74 | 0.82 |
OXCT1 | 0.74 | 0.72 |
阿斯夫 | 0.72 | 0.76 |
ATP6AP2 | 0.72 | 0.75 |
HPCAL4 | 0.72 | 0.72 |
myrip | 0.72 | 0.69 |
nkiras1 | 0.72 | 0.77 |
BNIP3 | 0.72 | 0.77 |
Gabra5 | 0.72 | 0.71 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SH2D2A | -0.43 | -0.48 |
透明2 | -0.39 | -0.42 |
SH3BP2 | -0.38 | -0.42 |
SMTN | -0.38 | -0.44 |
SLC16A13 | -0.37 | -0.40 |
AC132872.1 | -0.36 | -0.42 |
ZNF814 | -0.36 | -0.44 |
AF347015.18 | -0.35 | -0.12 |
SH2B2 | -0.34 | -0.36 |
SEMA4B | -0.34 | -0.35 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006357 | 调节RNA聚合酶II启动子的转录 | 塔斯 | 9556563 | |
去:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 塔斯 | 9556563 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CCDC7 | biot2-a |biot2-b |biot2-c |DKFZP686N0559 |FLJ32762 |RP11-479G22.1 | 包含7个 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
FAM96A | FLJ22875 | 具有序列相似性96的家庭,成员a | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
FAM96B | CGI-128 | 具有序列相似性的家庭96,成员b | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
GAS8 | GAS11 |MGC138326 | 特定于增长逮捕的8 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
HeaTr2 | FLJ20397 |FLJ25564 |FLJ31671 |FLJ39381 | 加热重复包含2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
KIAA1967 | DBC-1 |DBC1 | KIAA1967 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MCM5 | cdc46 |MGC5315 |P1-CDC46 | 微型鲜体维护复杂组件5 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MLF2 | NTN4 | 髓样白血病因子2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
myo1c | FLJ23903 |mmi-beta |mmib |NMI |myr2 | 肌球蛋白IC | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
USP11 | UHX1 | 泛素特异性肽酶11 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
WT1 | gud |Wagr |wit-2 |WT33 | 威尔姆斯肿瘤1 | - | HPRD | 9556563 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
障碍结肠癌复发 | 42 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jechlinger上皮到间充质转变DN | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |