概括
基因 9391
象征 CIAO1
同义词 CIA1 | WDR39
描述 胞质铁硫组件1
参考 MIM:604333|HGNC:HGNC:14280|HPRD:16057|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q11.2
Pascal P值 2.108E-5
主持人 尾状基底神经节
小脑
皮质
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0033

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ptprr 0.77 0.78
arl1 0.74 0.82
OXCT1 0.74 0.72
阿斯夫 0.72 0.76
ATP6AP2 0.72 0.75
HPCAL4 0.72 0.72
myrip 0.72 0.69
nkiras1 0.72 0.77
BNIP3 0.72 0.77
Gabra5 0.72 0.71
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SH2D2A -0.43 -0.48
透明2 -0.39 -0.42
SH3BP2 -0.38 -0.42
SMTN -0.38 -0.44
SLC16A13 -0.37 -0.40
AC132872.1 -0.36 -0.42
ZNF814 -0.36 -0.44
AF347015.18 -0.35 -0.12
SH2B2 -0.34 -0.36
SEMA4B -0.34 -0.35

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 9556563
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 塔斯 9556563
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CCDC7 biot2-a |biot2-b |biot2-c |DKFZP686N0559 |FLJ32762 |RP11-479G22.1 包含7个 两个杂交 Biogrid 16189514
FAM96A FLJ22875 具有序列相似性96的家庭,成员a 两个杂交 Biogrid 16189514
FAM96B CGI-128 具有序列相似性的家庭96,成员b 两个杂交 Biogrid 16189514
GAS8 GAS11 |MGC138326 特定于增长逮捕的8 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
HeaTr2 FLJ20397 |FLJ25564 |FLJ31671 |FLJ39381 加热重复包含2 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
KIAA1967 DBC-1 |DBC1 KIAA1967 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MCM5 cdc46 |MGC5315 |P1-CDC46 微型鲜体维护复杂组件5 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MLF2 NTN4 髓样白血病因子2 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
myo1c FLJ23903 |mmi-beta |mmib |NMI |myr2 肌球蛋白IC 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
USP11 UHX1 泛素特异性肽酶11 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
WT1 gud |Wagr |wit-2 |WT33 威尔姆斯肿瘤1 - HPRD 9556563


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
障碍结肠癌复发 42 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jechlinger上皮到间充质转变DN 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因