基因页面:FOXP2基因
总结吗?
GeneID | 93986年 |
象征 | FOXP2基因 |
同义词 | CAGH44 | SPCH1 | TNRC10 |
描述 | P2 forkhead框 |
参考 | MIM: 605317|HGNC: HGNC: 13875|运用:ENSG00000128573|HPRD: 05611|织女:OTTHUMG00000023131 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 7问 |
帕斯卡假定值 | 0.062 |
胎儿β | 0.175 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 2 | 链接到SZGene |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,分裂型神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FOXP2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0042803 | 蛋白质homodimerization活动 | 艾达 | 16407075 | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043565 | sequence-specific DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0021758 | 核发展 | 小鬼 | 大脑(术语层面:12) | 11872605 |
去:0021757 | 尾状核发展 | 小鬼 | 神经元,大脑(术语层面:12) | 11872605 |
去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
开回应前列腺素E2 DN | 391年 | 222年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
森古普塔和LMP1鼻咽癌 | 408年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应生活 | 485年 | 293年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应有限合伙人 | 431年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GC PASQUALUCCI淋巴瘤的阶段 | 283年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY过于重视公关在导致乳腺癌 | 22 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOCHKIS FOXA2目标 | 425年 | 261年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PLASARI TGFB1目标10人力资源DN | 244年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO DN FGFR1在前列腺癌的目标模型 | 308年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 122 | 54 | 60 | 1 | hsa - mir - 122 a | UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU |
mir - 128 | 87年 | 93年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
mir - 190 | 32 | 39 | 1、m8 | hsa - mir - 190 | UGAUAUGUUUGAUAUAUUAGGU |
miR-27 | 87年 | 93年 | m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC |