概括
基因 94005
象征
同义词 -
描述 磷脂酰肌醇聚糖锚固生物合成类S
参考 MIM:610271|HGNC:HGNC:14937|Ensembl:ENSG00000087111|HPRD:15135|Vega:Otthumg00000132604
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.2
Pascal P值 0.529
Sherlock P值 0.895
胎儿β -0.379
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10521963 Chrx 31174993 94005 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZFP62 0.85 0.82
C2CD3 0.84 0.83
SECISBP2 0.84 0.83
PHF21A 0.84 0.81
KIAA1267 0.84 0.83
施舍1 0.84 0.78
IGF2BP2 0.84 0.68
DDX17 0.84 0.83
Med12 0.83 0.78
C4orf8 0.83 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.63 -0.76
AF347015.27 -0.62 -0.75
AIFM3 -0.61 -0.70
C5orf53 -0.61 -0.68
ifi27 -0.61 -0.77
MT-CO2 -0.61 -0.74
FXYD1 -0.60 -0.75
HLA-F -0.60 -0.65
AF347015.33 -0.60 -0.72
S100B -0.59 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖基磷脂酰肌醇GPI锚固生物合成 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的翻译后修饰合成GPI锚定蛋白 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 94 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wong IFNA2电阻DN 34 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因