基因页:猪
概括?
基因 | 94005 |
象征 | 猪 |
同义词 | - |
描述 | 磷脂酰肌醇聚糖锚固生物合成类S |
参考 | MIM:610271|HGNC:HGNC:14937|Ensembl:ENSG00000087111|HPRD:15135|Vega:Otthumg00000132604 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.2 |
Pascal P值 | 0.529 |
Sherlock P值 | 0.895 |
胎儿β | -0.379 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10521963 | Chrx | 31174993 | 猪 | 94005 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PIGS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZFP62 | 0.85 | 0.82 |
C2CD3 | 0.84 | 0.83 |
SECISBP2 | 0.84 | 0.83 |
PHF21A | 0.84 | 0.81 |
KIAA1267 | 0.84 | 0.83 |
施舍1 | 0.84 | 0.78 |
IGF2BP2 | 0.84 | 0.68 |
DDX17 | 0.84 | 0.83 |
Med12 | 0.83 | 0.78 |
C4orf8 | 0.83 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.76 |
AF347015.27 | -0.62 | -0.75 |
AIFM3 | -0.61 | -0.70 |
C5orf53 | -0.61 | -0.68 |
ifi27 | -0.61 | -0.77 |
MT-CO2 | -0.61 | -0.74 |
FXYD1 | -0.60 | -0.75 |
HLA-F | -0.60 | -0.65 |
AF347015.33 | -0.60 | -0.72 |
S100B | -0.59 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG糖基磷脂酰肌醇GPI锚固生物合成 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的翻译后修饰合成GPI锚定蛋白 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 | 167 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 | 94 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wong IFNA2电阻DN | 34 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |