Summary
基因ID 9402
Symbol grap2
同义词 GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38
描述 与GRB2相关的衔接蛋白2
参考 MIM:604518|HGNC:HGNC:4563|ENSEMBL:ENSG00000100351|HPRD:05156|Vega:Otthumg00000151097
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.2
Pascal P值 0.157
胎儿β 0.134

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.0078

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1305 0.94 0.92
ADAMTS7 0.94 0.91
DCHS1 0.93 0.93
DNMT3B 0.93 0.87
LPAR2 0.93 0.85
PLXNB2 0.92 0.93
尼尔 0.92 0.92
AC145098.2 0.92 0.85
mical1 0.92 0.88
PLXNA3 0.91 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.65 -0.74
FBXO2 -0.64 -0.64
HLA-F -0.64 -0.66
ACOT13 -0.63 -0.72
aldoc -0.63 -0.61
FAM162A -0.62 -0.73
ACYP2 -0.62 -0.70
LDHD -0.62 -0.58
AIFM3 -0.62 -0.58
CA4 -0.62 -0.70

第三节。基因本体论注释

Molecular function 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005070 SH3/SH2适配器活动 TAS 9878555
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12359715
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007267 细胞细胞信号传导 TAS 9878555
去:0007265 RAS蛋白信号转导 TAS 9878555
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0005829 细胞质 EXP 11048639|11607830|17652306
去:0005634 艾达 18029348
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005737 cytoplasm TAS 9878555

Section IV. Protein-protein interaction annotation

Interactors 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
BEND5 C1orf165 | FLJ11588 包含5的本域 Two-hybrid Biogrid 16189514
CCNDBP1 dip1 |GCIP cyclin D-type binding-protein 1 - HPRD,Biogrid 10801854
CD28 MGC138290 |TP44 CD28molecule - HPRD,Biogrid 10820259
CD28 MGC138290 |TP44 CD28molecule grap2(网格)与CD28相互作用。 绑定 10820259
CSF1R C-FMS |CD115 |CSFR |fim2 |FMS 菌落刺激因子1受体 重构的复合物 Biogrid 9857184
DNM2 cmtdi1 |cmtdib |di-cmtb |dyn2 |dynii Dynamin 2 DYN2的未指定同工型与GAD相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的人类Dyn2与GAD之间的相互作用进行建模的。 绑定 15696170
FASLG APT1LG1 |CD178 |CD95L |fasl |TNFSF6 FAS配体(TNF超家族,成员6) - HPRD,Biogrid 11741599
GAB1 - GRB2相关的结合蛋白1 - HPRD,Biogrid 9878555
GAB2 KIAA0571 GRB2相关的结合蛋白2 - HPRD 11997510
GAB3 - GRB2相关的结合蛋白3 - HPRD 11997510
GFAP FLJ45472 胶质原纤维酸性蛋白 Two-hybrid Biogrid 16189514
GNB2L1 Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 grap2(网格)与GNB2L1(RACK-1)相互作用。 绑定 10820259
GNB2L1 Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 - HPRD,Biogrid 10820259
hnrnpk CSBP |FLJ41122 |hnrpk |隧道 异质核核糖核蛋白K Two-hybrid Biogrid 16189514
KHDRBS1 FLJ34027 | Sam68 | p62 KH结构域含有RNA结合,信号转导相关1 grap2(网格)与KHDRBS1(SAM68)相互作用。 绑定 10820259
KHDRBS1 FLJ34027 | Sam68 | p62 KH结构域含有RNA结合,信号转导相关1 - HPRD,Biogrid 9872323|10820259
成套工具 c-kit |CD117 |PBT |scfr v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog - HPRD 9872323
KRTAP4-12 kap4.12 |KRTAP4.12 角蛋白相关蛋白4-12 Two-hybrid Biogrid 16189514
拉特 拉特1 | pp36 linker for activation of T cells - HPRD,Biogrid 10021361
LAX1 FLJ20340 |宽松 淋巴细胞跨膜适配器1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12359715
LCP2 SLP-76 |SLP76 淋巴细胞胞质蛋白2 (SH2域包含ing leukocyte protein of 76kDa) - HPRD,Biogrid 10021361|10224278
LCP2 SLP-76 |SLP76 淋巴细胞胞质蛋白2 (SH2域包含ing leukocyte protein of 76kDa) SLP-76与GADS相互作用。 绑定 10021361
MAP4K1 HPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 grap2,一种造血,GRB2相关的衔接蛋白与HPK1相互作用,HPK1是Ste20与Ste20相关的丝氨酸/苏氨酸激酶 绑定 11313918
MAP4K1 HPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 - HPRD,Biogrid 11313918
PRPH2 AOFMD | AVMD | PRPH | RDS | RP7 | TSPAN22 | rd2 外围蛋白2(视网膜变性,慢) - HPRD 11641407
rbpms 爱马仕 RNA结合蛋白具有多个剪接 Two-hybrid Biogrid 16189514
SHB RP11-3J10.8 |BA3J10.2 SRC同源性2含有衔接蛋白B的结构域 - HPRD 12084069
SHC1 FLJ26504 |SHC |SHCA SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 - HPRD 9872323
SOS2 FLJ25596 七个无果2(果蝇)的儿子 - HPRD,Biogrid 10820259
SOS2 FLJ25596 七个无果2(果蝇)的儿子 grap2(网格)与SOS2相互作用。 绑定 10820259
斯坦普 AMSH | MGC126516 | MGC126518 Stam结合蛋白 - HPRD,Biogrid 10224278
是的 14-3-3e |FLJ45465 |KCIP-1 |MDCR |MDS 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,epsilon多肽 Two-hybrid Biogrid 16189514
ZBTB7B DKFZp686G01254 | THPOK | ZBTB15 | ZFP67 | ZNF857B | c-Krox | hcKrox 锌指和包含7B的BTB结构域 Two-hybrid Biogrid 16189514


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg t细胞受体信号通路 108 89 All SZGR 2.0 genes in this pathway
St T细胞信号转导 45 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID TCR途径 66 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID CD8 TCR PATHWAY 53 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID TCR JNK途径 14 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID套件途径 52 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCF套件的Reactome信号传导 78 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME TCR SIGNALING 54 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME GENERATION OF SECOND MESSENGER MOLECULES 27 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome CD28 CO刺激 32 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CD28家族的Reactome共刺激 63 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统 933 616 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome适应性免疫系统 539 350 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BORCZUK MALIGNANT MESOTHELIOMA DN 104 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUI MAPK14靶向 21 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 All SZGR 2.0 genes in this pathway
松本自然杀手差分 475 313 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HAN SATB1 TARGETS DN 442 275 All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn 88 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway