基因页:grap2
Summary?
基因ID | 9402 |
Symbol | grap2 |
同义词 | GADS|GRAP-2|GRB2L|GRBLG|GRID|GRPL|GrbX|Grf40|Mona|P38 |
描述 | 与GRB2相关的衔接蛋白2 |
参考 | MIM:604518|HGNC:HGNC:4563|ENSEMBL:ENSG00000100351|HPRD:05156|Vega:Otthumg00000151097 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.2 |
Pascal P值 | 0.157 |
胎儿β | 0.134 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.0078 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GRAP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA1305 | 0.94 | 0.92 |
ADAMTS7 | 0.94 | 0.91 |
DCHS1 | 0.93 | 0.93 |
DNMT3B | 0.93 | 0.87 |
LPAR2 | 0.93 | 0.85 |
PLXNB2 | 0.92 | 0.93 |
尼尔 | 0.92 | 0.92 |
AC145098.2 | 0.92 | 0.85 |
mical1 | 0.92 | 0.88 |
PLXNA3 | 0.91 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.65 | -0.74 |
FBXO2 | -0.64 | -0.64 |
HLA-F | -0.64 | -0.66 |
ACOT13 | -0.63 | -0.72 |
aldoc | -0.63 | -0.61 |
FAM162A | -0.62 | -0.73 |
ACYP2 | -0.62 | -0.70 |
LDHD | -0.62 | -0.58 |
AIFM3 | -0.62 | -0.58 |
CA4 | -0.62 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005070 | SH3/SH2适配器活动 | TAS | 9878555 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12359715 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007267 | 细胞细胞信号传导 | TAS | 9878555 | |
去:0007265 | RAS蛋白信号转导 | TAS | 9878555 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0005829 | 细胞质 | EXP | 11048639|11607830|17652306 |
|
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | cytoplasm | TAS | 9878555 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
Interactors | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BEND5 | C1orf165 | FLJ11588 | 包含5的本域 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
CCNDBP1 | dip1 |GCIP | cyclin D-type binding-protein 1 | - | HPRD,Biogrid | 10801854 |
CD28 | MGC138290 |TP44 | CD28molecule | - | HPRD,Biogrid | 10820259 |
CD28 | MGC138290 |TP44 | CD28molecule | grap2(网格)与CD28相互作用。 | 绑定 | 10820259 |
CSF1R | C-FMS |CD115 |CSFR |fim2 |FMS | 菌落刺激因子1受体 | 重构的复合物 | Biogrid | 9857184 |
DNM2 | cmtdi1 |cmtdib |di-cmtb |dyn2 |dynii | Dynamin 2 | DYN2的未指定同工型与GAD相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的人类Dyn2与GAD之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15696170 |
FASLG | APT1LG1 |CD178 |CD95L |fasl |TNFSF6 | FAS配体(TNF超家族,成员6) | - | HPRD,Biogrid | 11741599 |
GAB1 | - | GRB2相关的结合蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 9878555 |
GAB2 | KIAA0571 | GRB2相关的结合蛋白2 | - | HPRD | 11997510 |
GAB3 | - | GRB2相关的结合蛋白3 | - | HPRD | 11997510 |
GFAP | FLJ45472 | 胶质原纤维酸性蛋白 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | grap2(网格)与GNB2L1(RACK-1)相互作用。 | 绑定 | 10820259 |
GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | - | HPRD,Biogrid | 10820259 |
hnrnpk | CSBP |FLJ41122 |hnrpk |隧道 | 异质核核糖核蛋白K | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
KHDRBS1 | FLJ34027 | Sam68 | p62 | KH结构域含有RNA结合,信号转导相关1 | grap2(网格)与KHDRBS1(SAM68)相互作用。 | 绑定 | 10820259 |
KHDRBS1 | FLJ34027 | Sam68 | p62 | KH结构域含有RNA结合,信号转导相关1 | - | HPRD,Biogrid | 9872323|10820259 |
成套工具 | c-kit |CD117 |PBT |scfr | v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog | - | HPRD | 9872323 |
KRTAP4-12 | kap4.12 |KRTAP4.12 | 角蛋白相关蛋白4-12 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
拉特 | 拉特1 | pp36 | linker for activation of T cells | - | HPRD,Biogrid | 10021361 |
LAX1 | FLJ20340 |宽松 | 淋巴细胞跨膜适配器1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12359715 |
LCP2 | SLP-76 |SLP76 | 淋巴细胞胞质蛋白2 (SH2域包含ing leukocyte protein of 76kDa) | - | HPRD,Biogrid | 10021361|10224278 |
LCP2 | SLP-76 |SLP76 | 淋巴细胞胞质蛋白2 (SH2域包含ing leukocyte protein of 76kDa) | SLP-76与GADS相互作用。 | 绑定 | 10021361 |
MAP4K1 | HPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 | grap2,一种造血,GRB2相关的衔接蛋白与HPK1相互作用,HPK1是Ste20与Ste20相关的丝氨酸/苏氨酸激酶 | 绑定 | 11313918 |
MAP4K1 | HPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 11313918 |
PRPH2 | AOFMD | AVMD | PRPH | RDS | RP7 | TSPAN22 | rd2 | 外围蛋白2(视网膜变性,慢) | - | HPRD | 11641407 |
rbpms | 爱马仕 | RNA结合蛋白具有多个剪接 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
SHB | RP11-3J10.8 |BA3J10.2 | SRC同源性2含有衔接蛋白B的结构域 | - | HPRD | 12084069 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | - | HPRD | 9872323 |
SOS2 | FLJ25596 | 七个无果2(果蝇)的儿子 | - | HPRD,Biogrid | 10820259 |
SOS2 | FLJ25596 | 七个无果2(果蝇)的儿子 | grap2(网格)与SOS2相互作用。 | 绑定 | 10820259 |
斯坦普 | AMSH | MGC126516 | MGC126518 | Stam结合蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 10224278 |
是的 | 14-3-3e |FLJ45465 |KCIP-1 |MDCR |MDS | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,epsilon多肽 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
ZBTB7B | DKFZp686G01254 | THPOK | ZBTB15 | ZFP67 | ZNF857B | c-Krox | hcKrox | 锌指和包含7B的BTB结构域 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |