基因页:Zranb2
概括?
基因 | 9406 |
象征 | Zranb2 |
同义词 | zis | zis1 | zis2 | znf265 |
描述 | 锌指ranbp2型包含2个 |
参考 | MIM:604347|HGNC:HGNC:13058|ENSEMBL:ENSG00000132485|HPRD:09185|Vega:Otthumg00000009660 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 131 |
Pascal P值 | 0.125 |
Sherlock P值 | 0.788 |
胎儿β | 0.204 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02692 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZRANB2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ifi27 | 0.84 | 0.88 |
CST3 | 0.81 | 0.88 |
PLA2G5 | 0.81 | 0.88 |
MT3 | 0.80 | 0.89 |
Plac9 | 0.79 | 0.83 |
CLDN10 | 0.79 | 0.89 |
Metrn | 0.78 | 0.81 |
AC044839.2 | 0.78 | 0.84 |
FXYD1 | 0.78 | 0.87 |
myl3 | 0.78 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MCM3AP | -0.74 | -0.83 |
rnasen | -0.74 | -0.85 |
ube4b | -0.74 | -0.81 |
COPG2 | -0.73 | -0.85 |
heatr5b | -0.73 | -0.82 |
Ankrd17 | -0.73 | -0.79 |
PDXDC1 | -0.73 | -0.81 |
CSDE1 | -0.73 | -0.87 |
C10orf76 | -0.73 | -0.82 |
ZKSCAN5 | -0.73 | -0.84 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 9931435 | |
去:0003723 | RNA结合 | 塔斯 | 9931435 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17620599 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006397 | mRNA处理 | IEA | - | |
去:0008380 | RNA剪接 | 塔斯 | 9931435 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 9931435 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
咖啡馆对THC的反应 | 33 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Caffarel对THC 24小时5 DN的响应 | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
切斯勒大脑最高表达 | 40 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 528 | 534 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 527 | 534 | 1A,M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-135 | 179 | 186 | 1A,M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
mir-139 | 1700 | 1707年 | 1A,M8 | HSA-MIR-139脑 | ucuacagugcacgugucu |
mir-19 | 1447 | 1453 | 1a | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
mir-203.1 | 1681年 | 1687年 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-30-5p | 1623年 | 1629年 | 1a | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-33 | 1594年 | 1600 | 1a | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
HSA-MIR-33B | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
mir-496 | 1711年 | 1717年 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
mir-500 | 104 | 110 | M8 | HSA-MIR-500 | augcaccuggggaggagauucug |
mir-539 | 1046 | 1053 | 1A,M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |