概括
基因 9406
象征 Zranb2
同义词 zis | zis1 | zis2 | znf265
描述 锌指ranbp2型包含2个
参考 MIM:604347|HGNC:HGNC:13058|ENSEMBL:ENSG00000132485|HPRD:09185|Vega:Otthumg00000009660
基因类型 蛋白质编码
地图位置 131
Pascal P值 0.125
Sherlock P值 0.788
胎儿β 0.204

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ifi27 0.84 0.88
CST3 0.81 0.88
PLA2G5 0.81 0.88
MT3 0.80 0.89
Plac9 0.79 0.83
CLDN10 0.79 0.89
Metrn 0.78 0.81
AC044839.2 0.78 0.84
FXYD1 0.78 0.87
myl3 0.78 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MCM3AP -0.74 -0.83
rnasen -0.74 -0.85
ube4b -0.74 -0.81
COPG2 -0.73 -0.85
heatr5b -0.73 -0.82
Ankrd17 -0.73 -0.79
PDXDC1 -0.73 -0.81
CSDE1 -0.73 -0.87
C10orf76 -0.73 -0.82
ZKSCAN5 -0.73 -0.84

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 塔斯 9931435
去:0003723 RNA结合 塔斯 9931435
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17620599
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006397 mRNA处理 IEA -
去:0008380 RNA剪接 塔斯 9931435
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 塔斯 9931435

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
咖啡馆对THC的反应 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Caffarel对THC 24小时5 DN的响应 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
切斯勒大脑最高表达 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 528 534 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 527 534 1A,M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-135 179 186 1A,M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-139 1700 1707年 1A,M8 HSA-MIR-139 ucuacagugcacgugucu
mir-19 1447 1453 1a HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-203.1 1681年 1687年 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-30-5p 1623年 1629年 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-33 1594年 1600 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-496 1711年 1717年 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-500 104 110 M8 HSA-MIR-500 augcaccuggggaggagauucug
mir-539 1046 1053 1A,M8 HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu