概括
基因 94097
象征 SFXN5
同义词 BBG-TCC
描述 Sideroflexin 5
参考 MIM:615572|HGNC:HGNC:16073|ENSEMBL:ENSG00000144040|HPRD:18047|Vega:Otthumg00000129775
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P13
Pascal P值 1.181E-5
Sherlock P值 0.429
主持人 小脑
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.424

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005506 铁离子结合 IEA -
去:0008324 阳离子跨膜转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006826 铁离子运输 IEA -
去:0006812 阳离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0031966 线粒体膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
泰勒在急性淋巴细胞白血病中甲基化 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-15/16/195/424/497 1453 1459 M8 HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-203.1 194 200 M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-218 261 267 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-24 370 376 M8 HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag