基因页面:ORMDL3
总结吗?
GeneID | 94103年 |
象征 | ORMDL3 |
同义词 | - - - - - - |
描述 | ORMDL鞘脂类生物合成调节3 |
参考 | MIM: 610075|HGNC: HGNC: 16038|运用:ENSG00000172057|HPRD: 17803|织女:OTTHUMG00000133249 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 17日12 |
帕斯卡假定值 | 0.044 |
夏洛克假定值 | 0.002 |
胎儿β | -0.01 |
DMG | 2(#研究) |
eGene | 尾状基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg04308185 | 17 | 38084377 | ORMDL3 | 2.909的军医 | -0.531 | 0.039 | DMG: Wockner_2014 |
cg09155575 | 17 | 38084037 | ORMDL3 | 7.13 e-9 | -0.01 | 3.59 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ORMDL3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NSUN5C | 0.80 | 0.82 |
SCNN1D | 0.79 | 0.84 |
NOXA1 | 0.76 | 0.80 |
ACCN3 | 0.76 | 0.78 |
AC011511.1 | 0.76 | 0.77 |
NSUN5B | 0.75 | 0.73 |
CPT1B | 0.75 | 0.78 |
NEIL1 | 0.75 | 0.77 |
ZNF692 | 0.74 | 0.74 |
AP1G2 | 0.73 | 0.79 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SEPT7 | -0.50 | -0.52 |
GMFB | -0.50 | -0.55 |
ZMPSTE24 | -0.48 | -0.52 |
ABCD2 | -0.48 | -0.50 |
ACTR2 | -0.47 | -0.53 |
RAP1A | -0.47 | -0.53 |
LMBRD2 | -0.47 | -0.52 |
PJA2 | -0.46 | -0.51 |
PNPLA8 | -0.45 | -0.52 |
OSGIN2 | -0.45 | -0.50 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌17 q11扩增子对方篮里 | 133年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞和大脑QTL反式 | 185年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KUMAR MLL AF9融合的目标 | 405年 | 264年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伯顿脂肪生成5 | 126年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
埃尔伍德MYC DN的目标 | 40 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒙特罗甲状腺癌穷人生存DN | 11 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DUTERTRE雌二醇响应24小时DN | 505年 | 328年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA绑定与H4K20ME1马克 | 145年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |