基因页：FAM189A2
概括？
| 基因 | 9413 |
| 象征 | FAM189A2 |
| 同义词 | c9orf61 | x123 |
| 描述 | 具有序列相似性的家庭189成员A2 |
| 参考 | MIM：607710|HGNC：HGNC：24820|Ensembl：ENSG00000135063|HPRD：16255|Vega：Otthumg0000000019979 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9Q21.11 |
| Pascal P值 | 0.012 |
| Sherlock P值 | 0.559 |
| 胎儿β | -1.941 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Guipponi_2014 | 整个外显子组测序分析 | 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FAM189A2 | C | t | NM_001127608 | P.P160S | 错过 | 0.09 | 1 | 精神分裂症 | DNM：Guipponi_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2059867 | CHR5 | 31765789 | FAM189A2 | 9413 | 0.18 | 反式 | ||
| RS17111364 | Chr10 | 97901813 | FAM189A2 | 9413 | 0.01 | 反式 | ||
| RS1344430 | CHR20 | 60099390 | FAM189A2 | 9413 | 0.03 | 反式 | ||
| RS7888404 | Chrx | 20508308 | FAM189A2 | 9413 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC026691.1 | 0.98 | 0.97 |
| tra2b | 0.95 | 0.93 |
| th1l | 0.95 | 0.90 |
| USP39 | 0.95 | 0.94 |
| bub3 | 0.94 | 0.94 |
| SFRS7 | 0.94 | 0.93 |
| hnrnpl | 0.94 | 0.95 |
| ube2i | 0.94 | 0.93 |
| LRRC42 | 0.94 | 0.91 |
| SSRP1 | 0.94 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.75 | -0.89 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.89 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.88 |
| AF347015.31 | -0.74 | -0.87 |
| AF347015.8 | -0.74 | -0.91 |
| mt-cyb | -0.73 | -0.88 |
| AF347015.15 | -0.72 | -0.89 |
| HLA-F | -0.70 | -0.77 |
| AF347015.2 | -0.69 | -0.88 |
| AF347015.26 | -0.69 | -0.89 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王前列腺癌雄激素独立 | 66 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iizuka肝癌进展L0 L1 UP | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向 | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acevedo肝癌，H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |