基因页：TJP2
概括？
| 基因 | 9414 |
| 象征 | TJP2 |
| 同义词 | C9DUPQ21.11 | DFNA51 | DUP9Q21.11 | PFIC4 | X104 | ZO2 |
| 描述 | 紧密连接蛋白2 |
| 参考 | MIM：607709|HGNC：HGNC：11828|Ensembl：ENSG00000119139|HPRD：06369|Vega：Otthumg0000000019978 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9Q13-Q21 |
| Pascal P值 | 0.034 |
| Sherlock P值 | 0.897 |
| DEG P值 | DEG：SANDERS_2014：DS1_P = 0.149：DS1_BETA = 0.024600：DS2_P = 2.11E-01：DS2_BETA = -0.060：DS2_FDR = 4.59E-011 |
| 胎儿β | -0.631 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN g2cdb.human_synaptosom g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2914204 | CHR5 | 3470913 | TJP2 | 9414 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| UQCRQ | 0.92 | 0.84 |
| MDP1 | 0.92 | 0.78 |
| Med31 | 0.91 | 0.82 |
| MRPS28 | 0.91 | 0.83 |
| CMC1 | 0.90 | 0.76 |
| MRPL33 | 0.89 | 0.82 |
| myeov2 | 0.89 | 0.77 |
| UBL5 | 0.89 | 0.84 |
| MRPL54 | 0.89 | 0.74 |
| Hint1 | 0.89 | 0.82 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| myh9 | -0.55 | -0.56 |
| LRP1 | -0.50 | -0.50 |
| BAT2D1 | -0.49 | -0.44 |
| mtss1l | -0.48 | -0.60 |
| myo1c | -0.48 | -0.50 |
| podxl | -0.47 | -0.47 |
| RNF213 | -0.46 | -0.52 |
| ECE1 | -0.46 | -0.46 |
| ankrd11 | -0.46 | -0.41 |
| AC020763.2 | -0.46 | -0.58 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| 去：0004385 | 鸟苷酸激酶活性 | 塔斯 | 8824195 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005923 | 紧密连接 | IEA | 大脑（GO期限：10） | - |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | 艾达 | 18029348 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CGN | DKFZP779N1112 |FLJ39281 |KIAA1319 | 葡萄糖 | - | HPRD，Biogrid | 11042084 |
| CGN | DKFZP779N1112 |FLJ39281 |KIAA1319 | 葡萄糖 | - | HPRD | 10613913|12023291 | 11042084 |
| cldn1 | Cld1 |ilvasc |SEMP1 | 克劳丁1 | - | HPRD，Biogrid | 10601346 |
| CTNNA1 | CAP102 |FLJ36832 | Catenin（cadherin相关蛋白），α1，102KDA | - | HPRD，Biogrid | 10026224 |
| EPB41 | 4.1r |El1 |他 | 红细胞膜蛋白条带4.1（椭圆细胞增多症1，rh-c-链接） | - | HPRD，Biogrid | 10874042 |
| OCLN | - | occludin | - | HPRD，Biogrid | 10575001|14512431 |
| SAFB | DKFZP779C1727 |哈普|het |SAFB1 | 脚手架依恋因子B | - | HPRD，Biogrid | 12403786 |
| SFN | 是的 | Stratifin | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15778465 |
| SH3KBP1 | CIN85 |gig10 |MIG18 | SH3核蛋白激酶结合蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 12829691 |
| TJP1 | DKFZP686M05161 |MGC133289 |zo-1 | 紧密连接蛋白1（Zona occludens 1） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9792688|10026224 |10575001 |
| TJP1 | DKFZP686M05161 |MGC133289 |zo-1 | 紧密连接蛋白1（Zona occludens 1） | - | HPRD | 7542259 |
| traf6 | MGC：3310 |RNF85 | TNF受体相关因子6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| ywhab | GW128 |HS1 |KCIP-1 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，β多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| 是的 | 14-3-3-GAMMA | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，伽马多肽 | - | HPRD | 15324660 |
| 是的 | 14-3-3-GAMMA | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，伽马多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| ywhaq | 14-3-3 |1c5 |HS1 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，theta多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| ywhaz | KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，Zeta多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Vibrio霍乱感染 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid myc抑制道路 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组凋亡的细胞蛋白裂解 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 河马的Reactome信号传导 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 细胞粘附蛋白的反应组凋亡裂解 | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome凋亡执行阶段 | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoebeke淋巴干细胞DN | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola sezary综合征 | 98 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Baris甲状腺癌DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马尔基尼trabectedin抗性 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C1的反应 | 72 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| coates巨噬细胞M1与M2 DN | 78 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌晚期复发DN | 69 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BAE BRCA1靶向DN | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5a Targets Group1 | 136 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu Skil靶向DN | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ISSAEVA MLL2目标 | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 454 | 460 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-23 | 379 | 386 | 1A，M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||