基因页面:OPN4
总结吗?
| GeneID | 94233年 |
| 象征 | OPN4 |
| 同义词 | 拖把 |
| 描述 | 视蛋白4 |
| 参考 | MIM: 606665|HGNC: HGNC: 14449|运用:ENSG00000122375|HPRD: 05977|织女:OTTHUMG00000018654 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10的时候 |
| 帕斯卡假定值 | 0.008 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10994209 | chr10 | 61877705 | OPN4 | 94233年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs11202088 | 10 | 88357967 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.965 e-6 | 0.05 | -56347年 | gtex_brain_ba24 |
| rs11202088 | 10 | 88357967 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.155 e-8 | 0 | -56347年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7068794 | 10 | 88359713 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 5.039 e-8 | 0 | -54601年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7098712 | 10 | 88370239 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 4.925 e-8 | 0 | -44075年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202094 | 10 | 88372163 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.077 e-8 | 0 | -42151年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78183655 | 10 | 88372884 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.599 e-8 | 0 | -41430年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7895667 | 10 | 88373279 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.377 e-8 | 0 | -41035年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12359813 | 10 | 88373843 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.089 e-8 | 0 | -40471年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10887627 | 10 | 88378754 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 7.56 e-9 | 0 | -35560年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9731459 | 10 | 88379834 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 6.145 e-9 | 0 | -34480年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs112798330 | 10 | 88381693 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 4.364 e-9 | 0 | -32621年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7086606 | 10 | 88381941 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 4.181 e-9 | 0 | -32373年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7071212 | 10 | 88381951 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 4.169 e-9 | 0 | -32363年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7071315 | 10 | 88381960 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 4.169 e-9 | 0 | -32354年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7908321 | 10 | 88383716 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.085 e-9 | 0 | -30598年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7917872 | 10 | 88386179 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -28135年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10887630 | 10 | 88387574 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -26740年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7079720 | 10 | 88390237 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -24077年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7900564 | 10 | 88392181 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.069 e - | 0 | -22133年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202101 | 10 | 88392435 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -21879年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs61051286 | 10 | 88400731 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -13583年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs17106898 | 10 | 88401040 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -13274年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs78881073 | 10 | 88404726 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -9588年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2803546 | 10 | 88407055 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.61 e-6 | 0 | -7259年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7089582 | 10 | 88407326 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.314 e-11 | 0 | -6988年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10887637 | 10 | 88410462 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.944 e-9 | 0 | -3852年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2007599 | 10 | 88413707 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 5.469 e - | 0 | -607年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs200372100 | 10 | 88414009 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 7.578 e - | 0 | -305年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34439028 | 10 | 88414011 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 5.469 e - | 0 | -303年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202105 | 10 | 88414255 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.314 e-11 | 0 | -59年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3740332 | 10 | 88418535 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.332 e-11 | 0 | 4221年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3740334 | 10 | 88419012 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.314 e-11 | 0 | 4698年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3740335 | 10 | 88419641 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.314 e-11 | 0 | 5327年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202111 | 10 | 88424506 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.327 e-11 | 0 | 10192年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3740341 | 10 | 88426042 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.666 e-11 | 0 | 11728年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs397897206 | 10 | 88426614 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.875 e-11 | 0 | 12300年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11812601 | 10 | 88428167 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.36 e - | 0 | 13853年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3740342 | 10 | 88428718 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.926平台以及 | 0 | 14404年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71016147 | 10 | 88428793 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.713 e-6 | 0 | 14479年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10887639 | 10 | 88429154 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.954平台以及 | 0 | 14840年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10887640 | 10 | 88429356 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 4.089平台以及 | 0 | 15042年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202117 | 10 | 88431526 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 6.157 e - | 0 | 17212年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202118 | 10 | 88431782 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 1.168 e - | 0 | 17468年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202119 | 10 | 88431823 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.642 e - | 0 | 17509年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34677208 | 10 | 88431848 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.444 e - | 0 | 17534年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11202121 | 10 | 88432328 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.444 e - | 0 | 18014年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs67431774 | 10 | 88432491 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.072 e - | 0 | 18177年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2354362 | 10 | 88432697 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.444 e - | 0 | 18383年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2354361 | 10 | 88432698 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.444 e - | 0 | 18384年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2354360 | 10 | 88432743 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.503 e - | 0 | 18429年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2354359 | 10 | 88432875 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.444 e - | 0 | 18561年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7895178 | 10 | 88433146 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 3.444 e - | 0 | 18832年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7894381 | 10 | 88433203 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.067 e - | 0 | 18889年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12771857 | 10 | 88434059 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.072 e - | 0 | 19745年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11592193 | 10 | 88434284 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.072 e - | 0 | 19970年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7475311 | 10 | 88434380 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 4.48平台以及 | 0 | 20066年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10887643 | 10 | 88435215 | OPN4 | ENSG00000122375.7 | 2.065 e - | 0 | 20901年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME胃泌激素分子通过PKC和MAPK信号通路 | 205年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GαQ信号事件 | 184年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多亏尤文和NFKB目标了 | 43 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多亏尤文和病毒GPCR信号 | 86年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |