基因页:ECEL1
概括?
基因 | 9427 |
象征 | ECEL1 |
同义词 | da5d | dine | ecex | xce |
描述 | 内皮素转化酶样1 |
参考 | MIM:605896|HGNC:HGNC:3147|ENSEMBL:ENSG00000171551|HPRD:07066|Vega:Otthumg00000133262 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q37.1 |
Pascal P值 | 0.033 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1320385 | CHR1 | 54064468 | ECEL1 | 9427 | 8.532E-4 | 反式 | ||
RS12036675 | CHR1 | 54066317 | ECEL1 | 9427 | 8.532E-4 | 反式 | ||
RS12062528 | CHR1 | 54070830 | ECEL1 | 9427 | 2.995E-4 | 反式 | ||
RS17131472 | CHR1 | 91962966 | ECEL1 | 9427 | 0.02 | 反式 | ||
RS1531089 | CHR1 | 219542971 | ECEL1 | 9427 | 0.14 | 反式 | ||
RS17026940 | CHR2 | 86342788 | ECEL1 | 9427 | 0.08 | 反式 | ||
RS1566993 | CHR2 | 117105059 | ECEL1 | 9427 | 0 | 反式 | ||
RS16825495 | CHR2 | 134234401 | ECEL1 | 9427 | 0.01 | 反式 | ||
RS6431415 | CHR2 | 236872104 | ECEL1 | 9427 | 0.05 | 反式 | ||
RS17077856 | CHR3 | 45504326 | ECEL1 | 9427 | 0.09 | 反式 | ||
RS11923953 | CHR3 | 64365756 | ECEL1 | 9427 | 0 | 反式 | ||
RS9309817 | CHR3 | 67540334 | ECEL1 | 9427 | 0.03 | 反式 | ||
RS9310319 | CHR3 | 75279988 | ECEL1 | 9427 | 0.18 | 反式 | ||
RS7651311 | CHR3 | 106820222 | ECEL1 | 9427 | 0.08 | 反式 | ||
RS6775866 | CHR3 | 144494756 | ECEL1 | 9427 | 0.13 | 反式 | ||
RS2579326 | CHR4 | 72131304 | ECEL1 | 9427 | 0.01 | 反式 | ||
RS13136254 | CHR4 | 184824883 | ECEL1 | 9427 | 0.2 | 反式 | ||
RS10513131 | CHR5 | 14087480 | ECEL1 | 9427 | 0.19 | 反式 | ||
RS7448349 | 0 | ECEL1 | 9427 | 0 | 反式 | |||
RS248049 | CHR5 | 126489320 | ECEL1 | 9427 | 5.38e-4 | 反式 | ||
RS816736 | CHR5 | 154271947 | ECEL1 | 9427 | 0.17 | 反式 | ||
RS7747217 | CHR6 | 3576943 | ECEL1 | 9427 | 0.12 | 反式 | ||
RS9381511 | CHR6 | 12931447 | ECEL1 | 9427 | 2.6e-6 | 反式 | ||
RS6940481 | CHR6 | 12936502 | ECEL1 | 9427 | 0.05 | 反式 | ||
RS6934246 | CHR6 | 35154494 | ECEL1 | 9427 | 0 | 反式 | ||
RS16871832 | CHR6 | 44348256 | ECEL1 | 9427 | 0.09 | 反式 | ||
RS4711782 | CHR6 | 44363229 | ECEL1 | 9427 | 0.02 | 反式 | ||
RS819517 | CHR6 | 47052415 | ECEL1 | 9427 | 0.04 | 反式 | ||
RS10948326 | CHR6 | 47062800 | ECEL1 | 9427 | 0.04 | 反式 | ||
RS6455226 | CHR6 | 67930295 | ECEL1 | 9427 | 0.03 | 反式 | ||
RS6461782 | CHR7 | 24181477 | ECEL1 | 9427 | 0.07 | 反式 | ||
RS2718035 | CHR7 | 36132888 | ECEL1 | 9427 | 0.13 | 反式 | ||
RS1381599 | CHR7 | 46340766 | ECEL1 | 9427 | 0.04 | 反式 | ||
RS11575557 | CHR7 | 50525899 | ECEL1 | 9427 | 0.01 | 反式 | ||
RS12543403 | CHR8 | 76128193 | ECEL1 | 9427 | 0.16 | 反式 | ||
RS12684541 | Chr9 | 127349811 | ECEL1 | 9427 | 0.07 | 反式 | ||
RS11006556 | Chr10 | 61287609 | ECEL1 | 9427 | 0.11 | 反式 | ||
RS1159612 | Chr10 | 85329057 | ECEL1 | 9427 | 2.848e-4 | 反式 | ||
RS17653230 | Chr10 | 120201621 | ECEL1 | 9427 | 0.19 | 反式 | ||
RS7920992 | Chr10 | 130402940 | ECEL1 | 9427 | 0.15 | 反式 | ||
RS2443436 | Chr11 | 57859737 | ECEL1 | 9427 | 0.19 | 反式 | ||
RS16912972 | Chr11 | 88931513 | ECEL1 | 9427 | 0.14 | 反式 | ||
RS2460047 | Chr11 | 93678935 | ECEL1 | 9427 | 0.19 | 反式 | ||
RS7311343 | CHR12 | 21228780 | ECEL1 | 9427 | 0.1 | 反式 | ||
RS7303819 | CHR12 | 33990776 | ECEL1 | 9427 | 0.03 | 反式 | ||
RS11174622 | CHR12 | 63125087 | ECEL1 | 9427 | 0.02 | 反式 | ||
RS9603986 | CHR13 | 113556356 | ECEL1 | 9427 | 5.511E-5 | 反式 | ||
RS1457420 | CHR14 | 66958675 | ECEL1 | 9427 | 0.19 | 反式 | ||
RS16956620 | CHR15 | 31496513 | ECEL1 | 9427 | 0.07 | 反式 | ||
RS17137819 | CHR16 | 5372534 | ECEL1 | 9427 | 0.03 | 反式 | ||
RS16958302 | CHR16 | 57647432 | ECEL1 | 9427 | 4.347E-4 | 反式 | ||
RS8085234 | CHR18 | 27920846 | ECEL1 | 9427 | 0.01 | 反式 | ||
RS8095378 | CHR18 | 49283781 | ECEL1 | 9427 | 0.04 | 反式 | ||
RS6508086 | CHR18 | 49297572 | ECEL1 | 9427 | 0.14 | 反式 | ||
RS6095741 | CHR20 | 48666589 | ECEL1 | 9427 | 0.02 | 反式 | ||
RS7265852 | CHR20 | 48823717 | ECEL1 | 9427 | 0.1 | 反式 | ||
RS16996939 | CHR20 | 51280566 | ECEL1 | 9427 | 0.03 | 反式 | ||
RS2826744 | CHR21 | 22606292 | ECEL1 | 9427 | 0.02 | 反式 | ||
RS5915713 | Chrx | 4077883 | ECEL1 | 9427 | 0.03 | 反式 | ||
RS5991662 | Chrx | 43335796 | ECEL1 | 9427 | 2.691E-4 | 反式 | ||
RS1545676 | Chrx | 93530472 | ECEL1 | 9427 | 6.66e-8 | 反式 | ||
RS1040449 | Chrx | 96283684 | ECEL1 | 9427 | 0 | 反式 | ||
RS1540914 | Chrx | 99840177 | ECEL1 | 9427 | 0.01 | 反式 | ||
RS242163 | Chrx | 132311662 | ECEL1 | 9427 | 0.05 | 反式 | ||
RS17340148 | Chrx | 138648246 | ECEL1 | 9427 | 0 | 反式 | ||
RS10521801 | Chrx | 138732866 | ECEL1 | 9427 | 0 | 反式 | ||
RS2772187 | Chrx | 138797781 | ECEL1 | 9427 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ECEL1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EHMT1 | 0.97 | 0.93 |
RBM15B | 0.96 | 0.94 |
BRD1 | 0.96 | 0.95 |
Smarca4 | 0.96 | 0.95 |
MAPK7 | 0.96 | 0.95 |
ZBTB12 | 0.96 | 0.92 |
NUP62 | 0.96 | 0.94 |
ZNF74 | 0.96 | 0.94 |
KDM6B | 0.96 | 0.94 |
ILF3 | 0.95 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.74 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.72 | -0.89 |
HLA-F | -0.72 | -0.72 |
AF347015.27 | -0.71 | -0.88 |
S100B | -0.70 | -0.81 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.88 |
AIFM3 | -0.69 | -0.70 |
aldoc | -0.69 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.85 |
B2M | -0.69 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004222 | 金属肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007218 | 神经肽信号通路 | 塔斯 | 神经递质(GO期限:8) | 9931490 |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9931490 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen滑膜肉瘤 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |