基因页:PPP1R14A
概括?
基因 | 94274 |
象征 | PPP1R14A |
同义词 | CPI-17 | CPI17 | PPP1INL |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节抑制剂亚基14A |
参考 | MIM:608153|HGNC:HGNC:14871|ENSEMBL:ENSG00000167641|HPRD:16291|Vega:Otthumg00000181892 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.1 |
Pascal P值 | 0.202 |
Sherlock P值 | 0.837 |
胎儿β | -3.417 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22730305 | 19 | 38747292 | PPP1R14A | 2.968E-4 | -0.23 | 0.039 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11899693 | CHR2 | 64171418 | PPP1R14A | 94274 | 0.12 | 反式 | ||
RS6829546 | CHR4 | 12587664 | PPP1R14A | 94274 | 0.17 | 反式 | ||
RS6448932 | CHR4 | 12595798 | PPP1R14A | 94274 | 0.1 | 反式 | ||
RS6530123 | Chrx | 7951068 | PPP1R14A | 94274 | 0.19 | 反式 | ||
RS874294 | Chrx | 7957468 | PPP1R14A | 94274 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R14A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CSNK1A1 | CK1 |HLCDGP1 |Pro2975 | 酪蛋白激酶1,α1 | - | HPRD,Biogrid | 12062430 |
CSNK1A1 | CK1 |HLCDGP1 |Pro2975 | 酪蛋白激酶1,α1 | - | HPRD | 15003508 |
CSNK1D | hckid | 酪蛋白激酶1,三角洲 | - | HPRD | 15003508 |
CSNK1E | hckie |MGC10398 | 酪蛋白激酶1,Epsilon | - | HPRD | 15003508 |
CSNK1G1 | - | 酪蛋白激酶1,伽马1 | - | HPRD | 15003508 |
CSNK1G2 | CK1G2 | 酪蛋白激酶1,伽马2 | - | HPRD | 15003508 |
CSNK1G3 | - | 酪蛋白激酶1,伽马3 | - | HPRD | 15003508 |
prkca | AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca | 蛋白激酶C,α | - | HPRD | 15003508 |
prkce | MGC125656 |MGC125657 |PKCE |npkc-epsilon | 蛋白激酶C,Epsilon | - | HPRD | 15003508 |
Prkcg | MGC57564 |PKC-Gamma |PKCC |PKCG |SCA14 | 蛋白激酶C,伽玛 | - | HPRD | 15003508 |
Prkcz | PKC-Zeta |PKC2 | 蛋白激酶C,Zeta | - | HPRD | 15003508 |
PRKD1 | PKC-MU |PKCM |PKD |prkcm | 蛋白激酶D1 | - | HPRD | 15003508 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID幼稚园 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤LB | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSADA ASCL1靶向DN | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦加维因结肠癌的甲基化沉默 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |