概括
基因 9442
象征 Med27
同义词 CRAP34 | CRSP34 | CRSP8 | MED3 | TRAP37
描述 中介复合体亚基27
参考 MIM:605044|HGNC:HGNC:2377|ENSEMBL:ENSG00000160563|HPRD:05438|Vega:Otthumg00000020833
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9Q34.13
Pascal P值 0.01
Sherlock P值 0.504
胎儿β -0.084
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG26228569 9 134955334 Med27 1.23e-8 -0.011 5.01E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
UHRF2 0.95 0.95
ZNF227 0.95 0.96
luc7l2 0.95 0.96
SF3B1 0.95 0.97
SFRS11 0.94 0.95
SNW1 0.94 0.95
DHX15 0.94 0.95
UIMC1 0.93 0.93
KIAA0020 0.93 0.93
ZCCHC7 0.93 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.70 -0.88
ifi27 -0.70 -0.89
MT-CO2 -0.69 -0.87
AF347015.27 -0.69 -0.86
HLA-F -0.69 -0.79
FXYD1 -0.68 -0.87
AF347015.33 -0.68 -0.85
AIFM3 -0.67 -0.78
pth1r -0.67 -0.78
mt-cyb -0.67 -0.84

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM对TSA和Decitabine DN的反应 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质癌与腺瘤 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因