基因页:Med27
概括?
基因 | 9442 |
象征 | Med27 |
同义词 | CRAP34 | CRSP34 | CRSP8 | MED3 | TRAP37 |
描述 | 中介复合体亚基27 |
参考 | MIM:605044|HGNC:HGNC:2377|ENSEMBL:ENSG00000160563|HPRD:05438|Vega:Otthumg00000020833 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q34.13 |
Pascal P值 | 0.01 |
Sherlock P值 | 0.504 |
胎儿β | -0.084 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26228569 | 9 | 134955334 | Med27 | 1.23e-8 | -0.011 | 5.01E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MED27_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
UHRF2 | 0.95 | 0.95 |
ZNF227 | 0.95 | 0.96 |
luc7l2 | 0.95 | 0.96 |
SF3B1 | 0.95 | 0.97 |
SFRS11 | 0.94 | 0.95 |
SNW1 | 0.94 | 0.95 |
DHX15 | 0.94 | 0.95 |
UIMC1 | 0.93 | 0.93 |
KIAA0020 | 0.93 | 0.93 |
ZCCHC7 | 0.93 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.88 |
ifi27 | -0.70 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.87 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.86 |
HLA-F | -0.69 | -0.79 |
FXYD1 | -0.68 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.85 |
AIFM3 | -0.67 | -0.78 |
pth1r | -0.67 | -0.78 |
mt-cyb | -0.67 | -0.84 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Ppara激活基因表达 | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM对TSA和Decitabine DN的反应 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chung水泡细胞毒性 | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质癌与腺瘤 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |