Gene Page:Qki

概括？
GeneID 9444
象征 Qki
Synonyms hqk | qk | qk1 | qk3 | hqki
Description Qki, KH domain containing, RNA binding
Reference MIM：609590|HGNC:HGNC:21100|Ensembl:ENSG00000112531|HPRD：06691|Vega:OTTHUMG00000015977
基因类型 蛋白质编码
Map location 6q26
Pascal p-value 9.852E-5
胎儿β -1.131
DMG 1(# studies)
Support Darnell FMRP targets

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@Differentially methylated gene

Probe 染色体 位置 Nearest gene p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
cg09854653 6 163834903 Qki 4.107E-4 -0.212 0.044 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
NDE1 0.80 0.78
sall1 0.79 0.78
jam3 0.78 0.82
GAB1 0.78 0.83
TRIM59 0.77 0.76
TTF2 0.76 0.77
MYBL1 0.75 0.79
BBX 0.75 0.82
DUSP10 0.75 0.68
mobkl2b 0.74 0.84
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
IL32 -0.32 -0.48
ST20 -0.32 -0.51
C16orf14 -0.31 -0.38
SYCP3 -0.30 -0.41
DUSP23 -0.30 -0.38
AC044839.2 -0.28 -0.27
TTC9B -0.28 -0.37
AC087071.1 -0.28 -0.47
cldnd2 -0.27 -0.34
AC016757.1 -0.27 -0.38

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0003723 RNA结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 16713569
GO：0017124 SH3域结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0006397 mRNA processing IEA -
去：0006417 regulation of translation IEA -
GO:0008380 RNA剪接 IEA -
GO:0006810 transport IEA -
GO:0007275 multicellular organismal development IEA -
GO:0030154 细胞分化 IEA -
GO：0051028 mRNA运输 IEA -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 nucleus IEA -
去：0005737 细胞质 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN DN 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BORCZUK MALIGNANT MESOTHELIOMA UP 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER ADVANCED VS EARLY UP 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌2小时DN 88 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌6小时DN 167 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis乳腺癌进展DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO ROCK SIGNALING NOT VIA RHOA DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS ERBB2 BREAST TUMORS 324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN 137 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EBAUER TARGETS OF PAX3 FOXO1 FUSION UP 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP63 TARGETS 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TCGA GLIOBLASTOMA COPY NUMBER DN 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO UP 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BECKER TAMOXIFEN RESISTANCE DN 52 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruan对Troglitazone的反应 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APRELIKOVA BRCA1 TARGETS 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA PITUITARY FETAL VS ADULT UP 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D6 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV HIGH DOSE DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD UV RESPONSE CLUSTER G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1 ONCOGENIC SIGNATURE 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOUGLAS BMI1 TARGETS UP 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN OLIGODENDROCYTE MARKERS 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE UP 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE TGFB1 TARGETS UP 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOOKER GEMCITABINE RESISTANCE DN 122 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH 11Q23 REARRANGED 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标1 DN 63 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL UP 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

mirna家族 Target position miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 2437 2444 1A，M8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa-miR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
hsa-miR-613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
mir-101 3672 3678 1A HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
miR-103/107 418 424 1A HSA-MIR-103brain agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107brain AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA
mir-124.1 619 626 1A，M8 HSA-MIR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 618 625 1A，M8 hsa-miR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-125/351 3244 3250 1A hsa-miR-125bbrain ucccugagacccuaacuuguga
hsa-miR-125abrain UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG
mir-128 1369 1375 1A HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-130/301 111 117 M8 hsa-miR-130abrain cagugcaauguaaaaggggau
hsa-miR-301 cagugcaauaugucaaagc
hsa-miR-130bbrain CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa-miR-454-3p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
hsa-miR-130abrain cagugcaauguaaaaggggau
hsa-miR-301 cagugcaauaugucaaagc
hsa-miR-130bbrain CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa-miR-454-3p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
mir-132/212 3557 3563 1A hsa-miR-212SZ UAACAGUCUCCAGUCACGGCC
HSA-MIR-132brain UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG
mir-133 3567 3573 1A hsa-miR-133a uugguccccuucaaccagcugu
hsa-miR-133b UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA
mir-137 4146 4153 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
miR-141/200a 3944 3950 M8 HSA-MIR-141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa-miR-200a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
miR-142-5p 3661 3667 M8 hsa-miR-142-5p cauaaaguagaaagcacuac
miR-144 494 501 1A，M8 HSA-MIR-144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
HSA-MIR-144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
miR-145 4002 4009 1A，M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-148/152 3428 3435 1A，M8 hsa-miR-148a ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152brain UCAGUGCAUGACACUUGGG
hsa-miR-148b ucagugcaucacacaacuuugu
mir-15/16/195/424/497 1479年 1486 1A，M8 HSA-MIR-15Abrain UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
hsa-miR-16brain UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
HSA-MIR-15Bbrain UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
hsa-miR-424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
miR-17-5p/20/93.mr/106/519.d 113 119 M8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
hsa-miR-20abrain UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-106a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa-miR-106bSZ UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20bSZ CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
miR-181 3770 3776 1A HSA-MIR-181Abrain aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
HSA-MIR-181Cbrain AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181Dbrain AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
miR-19 119 126 1A，M8 HSA-MIR-19A UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
miR-200bc/429 3808 3814 1A HSA-MIR-200B UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
HSA-MIR-200C UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa-miR-429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
mir-208 15 21 1A hsa-miR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
hsa-miR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-214 416 422 M8 hsa-miR-214brain ACAGCAGGCACAGACAGGCAG
hsa-miR-214brain ACAGCAGGCACAGACAGGCAG
mir-223 2868 2874 M8 HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-224 102 109 1A，M8 HSA-MIR-224 CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA
miR-23 3588 3594 M8 HSA-MIR-23Abrain AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
HSA-MIR-23Bbrain AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-24 1305 1311 1A hsa-miR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-25/32/92/363/367 561 567 1A hsa-miR-25brain Cauugcacuugucucggucuga
hsa-miR-32 uauugcacauacuaaguugc
hsa-miR-92 UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG
HSA-MIR-367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
hsa-miR-92bSZ uauugcacucgucccgcgcuc
miR-27 1369 1376年 1A，M8 HSA-MIR-27Abrain uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27Bbrain UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
mir-30-5p 3947 3954 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30cbrain uguaaacauccuacucucucucucagc
hsa-miR-30dSZ uguaaacauccccgacuggaag
hsa-miR-30bSZ uguaaacauccuaccucucagcu
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir-323 3588 3594 1A hsa-miR-323brain GCACAUUACACGGUCGACCUCU
miR-33 559 565 1A hsa-miR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA
mir-330 3815 3821 1A hsa-miR-330brain GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
mir-370 3765 3771 1A HSA-MIR-370brain GCCUGCUGGGGUGGAACCUGG
miR-485-5p 66 72 M8 hsa-miR-485-5p AGAGGCUGGCCGUGAUGAAUUC
mir-496 2747 2753 M8 HSA-MIR-496 AUUACAUGGCCAAUCUC
mir-499 3539 3546 1A，M8 HSA-MIR-499 UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA
HSA-MIR-499 UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA
mir-503 1480 1486 1A hsa-miR-503 UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG
mir-505 3530 3536 1A hsa-miR-505 gucaacuugcugguuccuc
mir-9 799 805 M8 hsa-miR-9SZ UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA
hsa-miR-9SZ UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA