基因页:EIF4E2
概括?
基因 | 9470 |
象征 | EIF4E2 |
同义词 | 4e-lp | 4ehp | eif4el3 | if4e |
描述 | 真核翻译起始因子4E家庭成员2 |
参考 | MIM:605895|HGNC:HGNC:3293|Ensembl:ENSG00000135930|HPRD:05798|Vega:Otthumg00000133256 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q37.1 |
Pascal P值 | 0.049 |
Sherlock P值 | 0.467 |
胎儿β | 0.572 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 皮质 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15779458 | 2 | 233415951 | EIF4E2 | 1.07E-8 | -0.024 | 4.57E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1190453 | 2 | 233417312 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 7.725e-7 | 0.01 | 1796年 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34854862 | 2 | 233417394 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 2.829E-6 | 0.01 | 1878年 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1190452 | 2 | 233417552 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.025E-6 | 0.01 | 2036 | gtex_brain_putamen_basal |
RS377195442 | 2 | 233417932 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.276E-6 | 0.01 | 2416 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1190451 | 2 | 233418288 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.746E-6 | 0.01 | 2772 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1190450 | 2 | 233418302 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.745E-6 | 0.01 | 2786 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11381056 | 2 | 233418578 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 5.455e-7 | 0.01 | 3062 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1190448 | 2 | 233419084 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.63E-6 | 0.01 | 3568 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1201451 | 2 | 233419396 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 3880 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1307667 | 2 | 233419972 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.52E-6 | 0.01 | 4456 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1190447 | 2 | 233420052 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 4536 | gtex_brain_putamen_basal |
RS201284540 | 2 | 233420652 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 5136 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1190445 | 2 | 233420827 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.516E-6 | 0.01 | 5311 | gtex_brain_putamen_basal |
RS397740637 | 2 | 233421284 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 5768 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1729245 | 2 | 233424891 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 9375 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1550096 | 2 | 233428385 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 12869 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13394993 | 2 | 233437268 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 21752 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2293338 | 2 | 233438786 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.782E-6 | 0.01 | 23270 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10185980 | 2 | 233439851 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.775E-6 | 0.01 | 24335 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12617363 | 2 | 233440296 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 7.74e-7 | 0.01 | 24780 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62191571 | 2 | 233440756 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 8.996E-7 | 0.01 | 25240 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7571154 | 2 | 233440924 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 7.24e-7 | 0.01 | 25408 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7571716 | 2 | 233441420 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 7.781E-7 | 0.01 | 25904 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13393692 | 2 | 233442016 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.07E-6 | 0.01 | 26500 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13393800 | 2 | 233442091 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 7.735E-7 | 0.01 | 26575 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3841083 | 2 | 233446259 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 7.587E-7 | 0.01 | 30743 | gtex_brain_putamen_basal |
RS72243817 | 2 | 233448850 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 7.883E-7 | 0.01 | 33334 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12620925 | 2 | 233450820 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.72E-7 | 0.01 | 35304 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12617649 | 2 | 233450824 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.72E-7 | 0.01 | 35308 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2276559 | 2 | 233451163 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 4.718e-7 | 0.01 | 35647 | gtex_brain_putamen_basal |
RS60029373 | 2 | 233456262 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 6.042E-7 | 0.01 | 40746 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4468805 | 2 | 233459663 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.601E-7 | 0.01 | 44147 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4555341 | 2 | 233459738 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.643E-7 | 0.01 | 44222 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10193553 | 2 | 233459862 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 1.739E-7 | 0.01 | 44346 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9808024 | 2 | 233462273 | EIF4E2 | ENSG00000135930.9 | 3.161E-6 | 0.01 | 46757 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mtor信号通路 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 | 66 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤,带7Q缺失DN | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
zamora nos2靶向 | 69 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |