概括
基因 9470
象征 EIF4E2
同义词 4e-lp | 4ehp | eif4el3 | if4e
描述 真核翻译起始因子4E家庭成员2
参考 MIM:605895|HGNC:HGNC:3293|Ensembl:ENSG00000135930|HPRD:05798|Vega:Otthumg00000133256
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q37.1
Pascal P值 0.049
Sherlock P值 0.467
胎儿β 0.572
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
皮质
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15779458 2 233415951 EIF4E2 1.07E-8 -0.024 4.57E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1190453 2 233417312 EIF4E2 ENSG00000135930.9 7.725e-7 0.01 1796年 gtex_brain_putamen_basal
RS34854862 2 233417394 EIF4E2 ENSG00000135930.9 2.829E-6 0.01 1878年 gtex_brain_putamen_basal
RS1190452 2 233417552 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.025E-6 0.01 2036 gtex_brain_putamen_basal
RS377195442 2 233417932 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.276E-6 0.01 2416 gtex_brain_putamen_basal
RS1190451 2 233418288 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.746E-6 0.01 2772 gtex_brain_putamen_basal
RS1190450 2 233418302 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.745E-6 0.01 2786 gtex_brain_putamen_basal
RS11381056 2 233418578 EIF4E2 ENSG00000135930.9 5.455e-7 0.01 3062 gtex_brain_putamen_basal
RS1190448 2 233419084 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.63E-6 0.01 3568 gtex_brain_putamen_basal
RS1201451 2 233419396 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 3880 gtex_brain_putamen_basal
RS1307667 2 233419972 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.52E-6 0.01 4456 gtex_brain_putamen_basal
RS1190447 2 233420052 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 4536 gtex_brain_putamen_basal
RS201284540 2 233420652 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 5136 gtex_brain_putamen_basal
RS1190445 2 233420827 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.516E-6 0.01 5311 gtex_brain_putamen_basal
RS397740637 2 233421284 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 5768 gtex_brain_putamen_basal
RS1729245 2 233424891 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 9375 gtex_brain_putamen_basal
RS1550096 2 233428385 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 12869 gtex_brain_putamen_basal
RS13394993 2 233437268 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 21752 gtex_brain_putamen_basal
RS2293338 2 233438786 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.782E-6 0.01 23270 gtex_brain_putamen_basal
RS10185980 2 233439851 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.775E-6 0.01 24335 gtex_brain_putamen_basal
RS12617363 2 233440296 EIF4E2 ENSG00000135930.9 7.74e-7 0.01 24780 gtex_brain_putamen_basal
RS62191571 2 233440756 EIF4E2 ENSG00000135930.9 8.996E-7 0.01 25240 gtex_brain_putamen_basal
RS7571154 2 233440924 EIF4E2 ENSG00000135930.9 7.24e-7 0.01 25408 gtex_brain_putamen_basal
RS7571716 2 233441420 EIF4E2 ENSG00000135930.9 7.781E-7 0.01 25904 gtex_brain_putamen_basal
RS13393692 2 233442016 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.07E-6 0.01 26500 gtex_brain_putamen_basal
RS13393800 2 233442091 EIF4E2 ENSG00000135930.9 7.735E-7 0.01 26575 gtex_brain_putamen_basal
RS3841083 2 233446259 EIF4E2 ENSG00000135930.9 7.587E-7 0.01 30743 gtex_brain_putamen_basal
RS72243817 2 233448850 EIF4E2 ENSG00000135930.9 7.883E-7 0.01 33334 gtex_brain_putamen_basal
RS12620925 2 233450820 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.72E-7 0.01 35304 gtex_brain_putamen_basal
RS12617649 2 233450824 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.72E-7 0.01 35308 gtex_brain_putamen_basal
RS2276559 2 233451163 EIF4E2 ENSG00000135930.9 4.718e-7 0.01 35647 gtex_brain_putamen_basal
RS60029373 2 233456262 EIF4E2 ENSG00000135930.9 6.042E-7 0.01 40746 gtex_brain_putamen_basal
RS4468805 2 233459663 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.601E-7 0.01 44147 gtex_brain_putamen_basal
RS4555341 2 233459738 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.643E-7 0.01 44222 gtex_brain_putamen_basal
RS10193553 2 233459862 EIF4E2 ENSG00000135930.9 1.739E-7 0.01 44346 gtex_brain_putamen_basal
RS9808024 2 233462273 EIF4E2 ENSG00000135930.9 3.161E-6 0.01 46757 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mtor信号通路 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤,带7Q缺失DN 36 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
zamora nos2靶向 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因