基因页面:ATG5

总结吗?
GeneID 9474年
象征 ATG5
同义词 APG5 | APG5-LIKE | APG5L | ASP | hAPG5
描述 自噬相关5
参考 MIM: 604261|HGNC: HGNC: 589|运用:ENSG00000057663|HPRD: 16051|织女:OTTHUMG00000016193
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 6温度系数
帕斯卡假定值 0.319
夏洛克假定值 0.607
胎儿β -0.676
DMG 1(#研究)

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
表达式 荟萃分析的基因表达 P值:1.799
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg10566763 6 106773518 ATG5 4.34 e-5 -0.248 0.021 DMG: Wockner_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
TUBB 0.95 0.72
MARCKSL1 0.95 0.83
HN1 0.94 0.73
PAFAH1B3 0.94 0.81
C6orf134 0.93 0.71
IGFBP2 0.93 0.80
EIF4A1 0.93 0.73
TUBB2B 0.93 0.88
TUBB3 0.93 0.71
DBN1 0.93 0.71
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.70 -0.68
C5orf53 -0.69 -0.67
HLA-F -0.68 -0.63
CCNI2 -0.67 -0.73
AF347015.27 -0.66 -0.72
LDHD -0.65 -0.61
AIFM3 -0.65 -0.57
ALDOC -0.65 -0.59
2英镑 -0.64 -0.73
RGS5 -0.64 -0.69

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 9852036|11096062
去:0005515 蛋白结合 国际空间站 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000045 自噬小体的形成 国际空间站 - - - - - -
去:0006915 细胞凋亡 国际能源机构 - - - - - -
去:0006914 自噬 国际能源机构 - - - - - -
去:0006914 自噬 国际空间站 - - - - - -
去:0043687 翻译后的蛋白质修饰 国际空间站 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际空间站 - - - - - -
去:0005776 自噬小体 艾达 15292400
去:0043231 细胞内面上细胞器 国际空间站 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG调节自噬 35 30. 所有SZGR 2.0基因通路
我喜欢KEGG钻机受体信号通路 71年 51 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME钻机的负调控我MDA5信号 31日 19 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME钻机我MDA5介导的诱导干扰素αβ通路 73年 57 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME先天免疫系统 279年 178年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME免疫系统 933年 616年 所有SZGR 2.0基因通路
GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞DN 493年 298年 所有SZGR 2.0基因通路
PUIFFE入侵被腹水DN 145年 91年 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯曼膀胱癌了 404年 246年 所有SZGR 2.0基因通路
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 1278年 748年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌 722年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群3 329年 196年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
乳腺癌基底VS LULMINAL农民 330年 215年 所有SZGR 2.0基因通路
SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 261年 153年 所有SZGR 2.0基因通路
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN 584年 395年 所有SZGR 2.0基因通路
任肺泡横纹肌肉瘤DN 408年 274年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染14小时血巨细胞病毒DN 298年 200年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染48小时血巨细胞病毒DN 504年 323年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯应对TRABECTEDIN DN 271年 175年 所有SZGR 2.0基因通路
AGUIRRE胰腺癌拷贝数DN 238年 145年 所有SZGR 2.0基因通路
SHEDDEN肺癌生存A6差 456年 285年 所有SZGR 2.0基因通路
比COHESIN目标了 33 19 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒30分钟DN 150年 99年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN 254年 158年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
水岛自噬体的形成 19 15 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 153 546年 552年 1 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir - 181 1271年 1277年 m8 hsa - mir - 181 a大脑 AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 b深圳 AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa - mir - 181 c大脑 AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 d大脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
mir - 299 - 5 - p 492年 498年 m8 hsa - mir - 299 - 5 - p UGGUUUACCGUCCCACAUACAU
miR-30-5p 525年 532年 1、m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir - 448 546年 552年 1 hsa - mir - 448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU