基因页:Rock2
概括?
基因 | 9475 |
象征 | Rock2 |
同义词 | 岩石 |
描述 | RHO相关的卷线圈含有蛋白激酶2 |
参考 | MIM:604002|HGNC:HGNC:10252|ENSEMBL:ENSG00000134318|HPRD:04922|Vega:Otthumg00000149916 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P24 |
Pascal P值 | 0.568 |
Sherlock P值 | 0.77 |
胎儿β | -0.403 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1257641 | CHR14 | 99480394 | Rock2 | 9475 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ROCK2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Dennd5a | 0.84 | 0.87 |
LAMP1 | 0.84 | 0.82 |
NPC1 | 0.83 | 0.81 |
CNTN2 | 0.81 | 0.81 |
jam3 | 0.80 | 0.84 |
endod1 | 0.80 | 0.76 |
USP54 | 0.80 | 0.80 |
IPO13 | 0.79 | 0.77 |
PTPDC1 | 0.79 | 0.79 |
AP006216.1 | 0.79 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RP9P | -0.47 | -0.53 |
ST20 | -0.44 | -0.47 |
Spdya | -0.43 | -0.46 |
IL32 | -0.42 | -0.50 |
Sycp3 | -0.42 | -0.44 |
FAM159B | -0.42 | -0.55 |
AC087071.1 | -0.40 | -0.36 |
AL050337.1 | -0.39 | -0.37 |
纳米3 | -0.39 | -0.42 |
NOX1 | -0.39 | -0.37 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg wnt信号通路 | 151 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG轴突指导 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG致病性大肠杆菌感染 | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CCR3途径 | 23 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG趋化性 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rho GTPases对肌动蛋白细胞骨架的SIG调节 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST整合素信号通路 | 82 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St GA13途径 | 37 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid rhoa途径 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ER非原始组途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AVB3 OPN途径 | 31 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PLK1途径 | 46 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID凝血酶PAR4途径 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID凝血酶PAR1途径 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FAK PATHWAY | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Semaphorin信号中的Reactome SemA4D | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Smaphorin相互作用 | 68 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SemA4D诱导细胞迁移和生长锥塌陷 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合单核细胞DN的TONKS目标 | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LastOwska与MYCN二式增长 | 43 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应20 Hela | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aprelikova BRCA1目标 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成9 | 92 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a靶向DN | 213 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |