概括
基因 9475
象征 Rock2
同义词 岩石
描述 RHO相关的卷线圈含有蛋白激酶2
参考 MIM:604002|HGNC:HGNC:10252|ENSEMBL:ENSG00000134318|HPRD:04922|Vega:Otthumg00000149916
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P24
Pascal P值 0.568
Sherlock P值 0.77
胎儿β -0.403
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞内信号转导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1257641 CHR14 99480394 Rock2 9475 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Dennd5a 0.84 0.87
LAMP1 0.84 0.82
NPC1 0.83 0.81
CNTN2 0.81 0.81
jam3 0.80 0.84
endod1 0.80 0.76
USP54 0.80 0.80
IPO13 0.79 0.77
PTPDC1 0.79 0.79
AP006216.1 0.79 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP9P -0.47 -0.53
ST20 -0.44 -0.47
Spdya -0.43 -0.46
IL32 -0.42 -0.50
Sycp3 -0.42 -0.44
FAM159B -0.42 -0.55
AC087071.1 -0.40 -0.36
AL050337.1 -0.39 -0.37
纳米3 -0.39 -0.42
NOX1 -0.39 -0.37

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg wnt信号通路 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg白细胞跨内皮迁移 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG致病性大肠杆菌感染 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CCR3途径 23 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG趋化性 45 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases对肌动蛋白细胞骨架的SIG调节 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST整合素信号通路 82 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St GA13途径 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid rhoa途径 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ER非原始组途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PLK1途径 46 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID凝血酶PAR4途径 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID凝血酶PAR1途径 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAK PATHWAY 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Semaphorin信号中的Reactome SemA4D 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Smaphorin相互作用 68 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SemA4D诱导细胞迁移和生长锥塌陷 27 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞DN的TONKS目标 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LastOwska与MYCN二式增长 43 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应20 Hela 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aprelikova BRCA1目标 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因