基因页：CABP1
概括？
| 基因 | 9478 |
| 象征 | CABP1 |
| 同义词 | Calbrain | hcalb_br |
| 描述 | 钙结合蛋白1 |
| 参考 | MIM：605563|HGNC：HGNC：1384|Ensembl：ENSG00000157782|Vega：Otthumg00000156794 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12Q24.31 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| 胎儿beta | -2.222 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13504434 | 12 | 121088311 | CABP1 | 4.588e-4 | 0.434 | 0.046 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | tas | 9920909 | |
| 去：0004857 | 酶抑制剂活性 | tas | 9920909 | |
| 去：0048306 | 钙依赖性蛋白结合 | IPI | 15980432 | |
| 细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0014069 | 突触后密度 | 艾达 | 突触（GO期限：10） | 15140941 |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 康（Kang）因tert而永生 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的佐藤1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 受Foxp3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3束缚的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SAGIV CD24目标 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SAGIV CD24目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vandesluis正常胚胎DN | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 163 | 170 | 1A，M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-145 | 186 | 193 | 1A，M8 | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
| mir-27 | 164 | 171 | 1A，M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-96 | 225 | 231 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |