基因页面:SLC25A27

总结吗?
GeneID 9481年
象征 SLC25A27
同义词 UCP4
描述 溶质载体家庭25成员27
参考 MIM: 613725|HGNC: HGNC: 21065|运用:ENSG00000153291|HPRD: 15358|织女:OTTHUMG00000014786
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 6 p12.3
帕斯卡假定值 0.093
夏洛克假定值 0.695
胎儿β -0.531
eGene 前扣带皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马体
下丘脑
伏隔核基底神经节
硬膜基底神经节
迈尔斯的顺式和反式
元

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
协会 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 1 链接到SZGene
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) Psr: 0.04433
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs12192544 chr6 46620251 SLC25A27 9481年 0.06 独联体
rs17222843 chr10 109445830 SLC25A27 9481年 0.09 反式
rs952884 6 46613083 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.192 e - 0 -7595年 gtex_brain_ba24
rs61136694 6 46618415 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.77 e-8 0 -2263年 gtex_brain_ba24
rs13204743 6 46618456 SLC25A27 ENSG00000153291.11 8.939 e - 0 -2222年 gtex_brain_ba24
rs9349370 6 46619476 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.344 e-9 0 -1202年 gtex_brain_ba24
rs12192544 6 46620252 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.068 e-8 0 -426年 gtex_brain_ba24
rs8427 6 46621097 SLC25A27 ENSG00000153291.11 5.516 e-9 0 419年 gtex_brain_ba24
rs6900238 6 46624020 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.205 e-9 0 3342年 gtex_brain_ba24
rs6900121 6 46624079 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.122 e-8 0 3401年 gtex_brain_ba24
rs7739815 6 46624656 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.354 e-11 0 3978年 gtex_brain_ba24
rs9381468 6 46625274 SLC25A27 ENSG00000153291.11 5.471 e-9 0 4596年 gtex_brain_ba24
rs10807344 6 46625635 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.257 e-8 0 4957年 gtex_brain_ba24
rs6907892 6 46625886 SLC25A27 ENSG00000153291.11 6.652 e - 0 5208年 gtex_brain_ba24
rs953062 6 46626353 SLC25A27 ENSG00000153291.11 6.652 e - 0 5675年 gtex_brain_ba24
rs3778483 6 46627100 SLC25A27 ENSG00000153291.11 8.215 e - 0 6422年 gtex_brain_ba24
rs4144937 6 46628516 SLC25A27 ENSG00000153291.11 8.215 e - 0 7838年 gtex_brain_ba24
rs9296504 6 46629505 SLC25A27 ENSG00000153291.11 8.215 e - 0 8827年 gtex_brain_ba24
rs9296505 6 46629841 SLC25A27 ENSG00000153291.11 8.215 e - 0 9163年 gtex_brain_ba24
rs9381469 6 46630068 SLC25A27 ENSG00000153291.11 8.215 e - 0 9390年 gtex_brain_ba24
rs6901132 6 46631801 SLC25A27 ENSG00000153291.11 6.662 e - 0 11123年 gtex_brain_ba24
rs7753137 6 46635846 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.931 e-8 0 15168年 gtex_brain_ba24
rs9472817 6 46640992 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.216 e-9 0 20314年 gtex_brain_ba24
rs2270450 6 46644875 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.357 e-11 0 24197年 gtex_brain_ba24
rs34964632 6 46648129 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.357 e-11 0 27451年 gtex_brain_ba24
rs397812173 6 46651472 SLC25A27 ENSG00000153291.11 6.652 e - 0 30794年 gtex_brain_ba24
rs10948299 6 46653858 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.725 e-6 0 33180年 gtex_brain_ba24
rs13196132 6 46655603 SLC25A27 ENSG00000153291.11 5.27 e - 0 34925年 gtex_brain_ba24
rs9381472 6 46658905 SLC25A27 ENSG00000153291.11 5.557 e - 0 38227年 gtex_brain_ba24
rs974670 6 46667343 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.403 e-6 0 46665年 gtex_brain_ba24
rs12528857 6 46669936 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.257 e-8 0 49258年 gtex_brain_ba24
rs370368833 6 46672452 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.438 e-6 0 51774年 gtex_brain_ba24
rs2216465 6 46676019 SLC25A27 ENSG00000153291.11 5.549 e - 0 55341年 gtex_brain_ba24
rs4498351 6 46676783 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.392 e-9 0 56105年 gtex_brain_ba24
rs6899519 6 46681900 SLC25A27 ENSG00000153291.11 6.518 e-13 0 61222年 gtex_brain_ba24
rs41361844 6 46683978 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.366 e-9 0 63300年 gtex_brain_ba24
rs1805017 6 46684222 SLC25A27 ENSG00000153291.11 6.518 e-13 0 63544年 gtex_brain_ba24
rs12195701 6 46687419 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.478 e-9 0 66741年 gtex_brain_ba24
rs9472831 6 46689847 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.366 e-9 0 69169年 gtex_brain_ba24
rs34405250 6 46695911 SLC25A27 ENSG00000153291.11 8.43 e-8 0 75233年 gtex_brain_ba24
rs10948300 6 46696342 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.032 e-8 0 75664年 gtex_brain_ba24
rs9381474 6 46697380 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.002 e - 0 76702年 gtex_brain_ba24
rs9381475 6 46699292 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.001 e - 0 78614年 gtex_brain_ba24
rs9296509 6 46701037 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 80359年 gtex_brain_ba24
rs9381476 6 46701733 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 81055年 gtex_brain_ba24
rs9395208 6 46703319 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 82641年 gtex_brain_ba24
rs13210554 6 46704339 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 83661年 gtex_brain_ba24
rs10948301 6 46704467 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 83789年 gtex_brain_ba24
rs1421379 6 46705994 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 85316年 gtex_brain_ba24
rs1421380 6 46706271 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 85593年 gtex_brain_ba24
rs9349373 6 46706593 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 85915年 gtex_brain_ba24
rs9369631 6 46707519 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 86841年 gtex_brain_ba24
rs9381477 6 46707580 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 86902年 gtex_brain_ba24
rs60331073 6 46707818 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.483 e - 0 87140年 gtex_brain_ba24
rs9395209 6 46709014 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 88336年 gtex_brain_ba24
rs9381478 6 46709021 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 88343年 gtex_brain_ba24
rs11962772 6 46709601 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 88923年 gtex_brain_ba24
rs1862008 6 46710279 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 89601年 gtex_brain_ba24
rs9395210 6 46711962 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 91284年 gtex_brain_ba24
rs9369632 6 46713394 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.438 e-6 0 92716年 gtex_brain_ba24
rs9296510 6 46713805 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.19 e - 0 93127年 gtex_brain_ba24
rs9367255 6 46714466 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.232 e - 0 93788年 gtex_brain_ba24
rs9349374 6 46714598 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.248 e - 0 93920年 gtex_brain_ba24
rs1592704 6 46715761 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.324 e - 0 95083年 gtex_brain_ba24
rs1362932 6 46716079 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.015 e-6 0 95401年 gtex_brain_ba24
rs200787031 6 46717291 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.322 e-6 0 96613年 gtex_brain_ba24
rs9367256 6 46723267 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.609 e - 0 102589年 gtex_brain_ba24
rs9381480 6 46724131 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.861 e - 0 103453年 gtex_brain_ba24
rs12215229 6 46614439 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.799 e - 0 -6239年 gtex_brain_putamen_basal
rs61136694 6 46618415 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.497 e-6 0 -2263年 gtex_brain_putamen_basal
rs13204743 6 46618456 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.844 e - 0 -2222年 gtex_brain_putamen_basal
rs9349370 6 46619476 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.239 e-6 0 -1202年 gtex_brain_putamen_basal
rs12192544 6 46620252 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.508 e-8 0 -426年 gtex_brain_putamen_basal
rs8427 6 46621097 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.763 e - 0 419年 gtex_brain_putamen_basal
rs6900238 6 46624020 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.067 e-6 0 3342年 gtex_brain_putamen_basal
rs7739815 6 46624656 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.49 e-12 0 3978年 gtex_brain_putamen_basal
rs9381468 6 46625274 SLC25A27 ENSG00000153291.11 9.711 e - 0 4596年 gtex_brain_putamen_basal
rs10807344 6 46625635 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.51 e-8 0 4957年 gtex_brain_putamen_basal
rs6907892 6 46625886 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.261 e - 0 5208年 gtex_brain_putamen_basal
rs953062 6 46626353 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.261 e - 0 5675年 gtex_brain_putamen_basal
rs6901132 6 46631801 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.283 e - 0 11123年 gtex_brain_putamen_basal
rs9472817 6 46640992 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.071 e-6 0 20314年 gtex_brain_putamen_basal
rs2270450 6 46644875 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.966 e-12 0 24197年 gtex_brain_putamen_basal
rs34964632 6 46648129 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.966 e-12 0 27451年 gtex_brain_putamen_basal
rs397812173 6 46651472 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.261 e - 0 30794年 gtex_brain_putamen_basal
rs13196132 6 46655603 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.394 e - 0 34925年 gtex_brain_putamen_basal
rs9381472 6 46658905 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.244 e - 0 38227年 gtex_brain_putamen_basal
rs12528857 6 46669936 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.51 e-8 0 49258年 gtex_brain_putamen_basal
rs2216465 6 46676019 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.261 e - 0 55341年 gtex_brain_putamen_basal
rs4498351 6 46676783 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.698 e-6 0 56105年 gtex_brain_putamen_basal
rs6899519 6 46681900 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.966 e-12 0 61222年 gtex_brain_putamen_basal
rs41361844 6 46683978 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.879 e-6 0 63300年 gtex_brain_putamen_basal
rs1805017 6 46684222 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.966 e-12 0 63544年 gtex_brain_putamen_basal
rs12195701 6 46687419 SLC25A27 ENSG00000153291.11 2.574 e-8 0 66741年 gtex_brain_putamen_basal
rs9472831 6 46689847 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.879 e-6 0 69169年 gtex_brain_putamen_basal
rs71716873 6 46714134 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.299 e - 0 93456年 gtex_brain_putamen_basal
rs200787031 6 46717291 SLC25A27 ENSG00000153291.11 4.116 e - 0 96613年 gtex_brain_putamen_basal
rs9367256 6 46723267 SLC25A27 ENSG00000153291.11 1.33 e-6 0 102589年 gtex_brain_putamen_basal
rs9381480 6 46724131 SLC25A27 ENSG00000153291.11 3.461 e - 0 103453年 gtex_brain_putamen_basal

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
LGI3 0.92 0.88
ABCA2 0.92 0.89
TPPP 0.89 0.91
SEC14L5 0.89 0.90
ZFYVE28 0.88 0.88
ZBTB7A 0.88 0.90
TNK2 0.88 0.87
SEPT8 0.88 0.87
KNDC1 0.87 0.82
KLHL21 0.87 0.75
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C9orf46 -0.59 -0.75
EXOSC8 -0.56 -0.68
GTF3C6 -0.55 -0.63
RPS18 -0.55 -0.73
AC008073.1 -0.54 -0.65
RPS23 -0.54 -0.72
RPL32 -0.54 -0.73
RPL24 -0.54 -0.74
RPS3AP47 -0.54 -0.71
RPL27 -0.54 -0.72

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005488 绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005215 运输活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006839 线粒体运输 国际能源机构 谷氨酸(术语层面:6) - - - - - -
去:0006091 代的前体代谢物和能量 助教 10025957
去:0006810 运输 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005739 线粒体 国际能源机构 - - - - - -
去:0005739 线粒体 助教 10025957
去:0005743 线粒体内膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005743 线粒体内膜 NAS 10025957
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
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部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
DN BASAKI YBX1目标 384年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
JAATINEN造血干细胞 316年 190年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌DN 537年 339年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN NIPP1的目标了 769年 437年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH自行车基因 648年 385年 所有SZGR 2.0基因通路
CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 720年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
YAUCH刺猬信号旁分泌DN 264年 159年 所有SZGR 2.0基因通路
WHITFIELD细胞周期G1 147年 76年 所有SZGR 2.0基因通路
WHITFIELD细胞周期年代 162年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT核心少突细胞分化 40 28 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
let-7/98 84年 90年 m8 hsa-let-7a大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
hsa-let-7b大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
hsa-let-7c大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU
hsa-let-7d大脑 AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
hsa-let-7e大脑 UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU
hsa-let-7f大脑 UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU
hsa - mir - 98大脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
hsa-let-7g深圳 UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU
hsa-let-7i大脑 UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU
mir - 142 - 5 - p 137年 143年 m8 hsa - mir - 142 - 5 - p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d 135年 142年 1、m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
hsa-miR-20a大脑 UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 106 a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa - mir - 106 b深圳 UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20b深圳 CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 519 d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
miR-34/449 1401年 1408年 1、m8 hsa-miR-34a大脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
hsa-miR-34c AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
hsa - mir - 449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
hsa - mir - 449 b AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC