基因页面:CHST10
总结吗?
| GeneID | 9486年 |
| 象征 | CHST10 |
| 同义词 | HNK-1ST | HNK1ST |
| 描述 | 碳水化合物sulfotransferase 10 |
| 参考 | MIM: 606376|HGNC: HGNC: 19650|运用:ENSG00000115526|HPRD: 07332|织女:OTTHUMG00000130669 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q11.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.364 |
| 夏洛克假定值 | 0.509 |
| 胎儿β | 1.073 |
| eGene | 小脑半球 小脑 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0004 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GRAMD3 | 0.81 | 0.82 |
| ALDH6A1 | 0.78 | 0.75 |
| TPP1 | 0.77 | 0.76 |
| TMBIM1 | 0.76 | 0.78 |
| DTNA | 0.76 | 0.76 |
| SPARCL1 | 0.75 | 0.78 |
| MRO | 0.74 | 0.75 |
| ANXA4 | 0.74 | 0.76 |
| GALNTL2 | 0.74 | 0.78 |
| KCNJ10 | 0.73 | 0.78 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NKIRAS2 | -0.55 | -0.54 |
| HN1 | -0.53 | -0.57 |
| KIAA1949 | -0.52 | -0.51 |
| TUBB | -0.52 | -0.54 |
| NR2C2AP | -0.52 | -0.60 |
| ZNF821 | -0.52 | -0.53 |
| MED19 | -0.52 | -0.61 |
| PAFAH1B3 | -0.52 | -0.62 |
| TUBB2B | -0.52 | -0.51 |
| MPP3 | -0.52 | -0.51 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008146 | sulfotransferase活动 | 助教 | 9478973 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007155 | 细胞粘附 | 助教 | 9478973 | |
| 去:0005975 | 碳水化合物代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000139 | 高尔基体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 助教 | 9478973 | |
| 去:0005624 | 膜分数 | 助教 | 9478973 | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移了 | 344年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒20小时 | 240年 | 152年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MAHAJAN应对IL1A DN | 76年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN CHYLA CBFA2T3目标 | 242年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KASLER HDAC7目标1 | 194年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 137 | 1092年 | 1098年 | 1 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| mir - 182 | 1374年 | 1380年 | 1 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| miR-23 | 1348年 | 1355年 | 1、m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| mir - 323 | 1348年 | 1354年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 96 | 1373年 | 1380年 | 1、m8 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |