基因页面:AKAP5
总结吗?
| GeneID | 9495年 |
| 象征 | AKAP5 |
| 同义词 | AKAP75 | AKAP79 | H21 |
| 描述 | 一种激酶锚定蛋白5 |
| 参考 | MIM: 604688|HGNC: HGNC: 375|运用:ENSG00000179841|HPRD: 05255|织女:OTTHUMG00000029634 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 14 q23.3 |
| 帕斯卡假定值 | 3.39的军医 |
| 胎儿β | -1.292 |
| DMG | 1(#研究) |
| 支持 | G2Cdb.humanNRC G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.1574 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg18807466 | 14 | 64932715 | AKAP5 | 5.061的军医 | 0.707 | 0.047 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TLN1 | 0.86 | 0.85 |
| TJP1 | 0.85 | 0.85 |
| DENND5A | 0.85 | 0.85 |
| PHLPP1 | 0.84 | 0.85 |
| PLEKHG3 | 0.83 | 0.84 |
| CLN8 | 0.83 | 0.83 |
| WNK1 | 0.83 | 0.84 |
| KIF13A | 0.82 | 0.84 |
| WWC3 | 0.81 | 0.85 |
| USP54 | 0.81 | 0.82 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PFDN5 | -0.51 | -0.55 |
| ST20 | -0.49 | -0.54 |
| RPL31 | -0.49 | -0.56 |
| COX16 | -0.48 | -0.51 |
| TIMM8B | -0.48 | -0.53 |
| C8orf59 | -0.48 | -0.46 |
| RPL35 | -0.48 | -0.55 |
| PFDN4 | -0.47 | -0.49 |
| PSMA6 | -0.46 | -0.49 |
| NDUFAF2 | -0.45 | -0.45 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005516 | 钙调蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0051018 | 蛋白激酶具有约束力 | 助教 | 1512224 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 1512224 |
| 去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007165 | 信号转导 | NAS | 1512224 | |
| 去:0006605 | 蛋白质的目标 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | NAS | 1512224 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID NFAT 3通路 | 54 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID细胞钙通道 | 29日 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在化学突触REACTOME传输 | 186年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME能量代谢的集成 | 120年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经递质受体结合和下游传播的突触后细胞 | 137年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胰高糖素像PEPTIDE1 REACTOME调节胰岛素分泌 | 43 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME贩卖AMPA受体 | 28 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME调节胰岛素分泌 | 93年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开回应前列腺素E2 DN | 391年 | 222年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多恩对雄激素 | 184年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 蔡对电离辐射的反应 | 149年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定 | 167年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张GATA6 DN的目标 | 64年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RIZKI肿瘤侵袭性的3 d | 210年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |