基因页:Scarb2
概括?
基因 | 950 |
象征 | Scarb2 |
同义词 | AMRF | CD36L2 | EPM4 | HLGP85 | LGP85 | LIMP-2 | LIMPII | SR-BII |
描述 | 清道夫受体B类成员2 |
参考 | MIM:602257|HGNC:HGNC:1665|ENSEMBL:ENSG00000138760|HPRD:03772|Vega:Otthumg00000130099 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q21.1 |
Pascal P值 | 0.159 |
Sherlock P值 | 0.981 |
胎儿β | 0.473 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG12454419 | 4 | 77135195 | Scarb2 | 6.31E-5 | -0.195 | 0.023 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6829546 | CHR4 | 12587664 | Scarb2 | 950 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SCARB2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C2CD2L | 0.91 | 0.91 |
NPTN | 0.91 | 0.93 |
AP001107.1 | 0.90 | 0.91 |
PLD3 | 0.90 | 0.92 |
MAPRE3 | 0.89 | 0.90 |
DCTN1 | 0.88 | 0.87 |
ptprn | 0.88 | 0.92 |
clstn3 | 0.88 | 0.89 |
prkar1b | 0.88 | 0.90 |
grin1 | 0.88 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.47 | -0.25 |
AF347015.21 | -0.45 | -0.21 |
NSBP1 | -0.44 | -0.40 |
Rab13 | -0.43 | -0.49 |
AP002478.3 | -0.43 | -0.34 |
AC010300.1 | -0.42 | -0.36 |
FAM159B | -0.42 | -0.57 |
AF347015.2 | -0.41 | -0.18 |
AL139819.3 | -0.41 | -0.35 |
GNG11 | -0.40 | -0.31 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
grabarczyk bcl11b目标 | 81 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应20 MCF10A | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
叶中性粒细胞颗粒成分 | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肿瘤场效应 | 36 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期 | 125 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标 | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌与Epcam Up | 53 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过VHL的江南缺氧 | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 | 152 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 | 145 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |