概括
基因 950
象征 Scarb2
同义词 AMRF | CD36L2 | EPM4 | HLGP85 | LGP85 | LIMP-2 | LIMPII | SR-BII
描述 清道夫受体B类成员2
参考 MIM:602257|HGNC:HGNC:1665|ENSEMBL:ENSG00000138760|HPRD:03772|Vega:Otthumg00000130099
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q21.1
Pascal P值 0.159
Sherlock P值 0.981
胎儿β 0.473
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12454419 4 77135195 Scarb2 6.31E-5 -0.195 0.023 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6829546 CHR4 12587664 Scarb2 950 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C2CD2L 0.91 0.91
NPTN 0.91 0.93
AP001107.1 0.90 0.91
PLD3 0.90 0.92
MAPRE3 0.89 0.90
DCTN1 0.88 0.87
ptprn 0.88 0.92
clstn3 0.88 0.89
prkar1b 0.88 0.90
grin1 0.88 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.47 -0.25
AF347015.21 -0.45 -0.21
NSBP1 -0.44 -0.40
Rab13 -0.43 -0.49
AP002478.3 -0.43 -0.34
AC010300.1 -0.42 -0.36
FAM159B -0.42 -0.57
AF347015.2 -0.41 -0.18
AL139819.3 -0.41 -0.35
GNG11 -0.40 -0.31

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg溶酶体 121 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
grabarczyk bcl11b目标 81 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN 90 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应20 MCF10A 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
叶中性粒细胞颗粒成分 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC的反应 123 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肿瘤场效应 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌与Epcam Up 53 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过VHL的江南缺氧 34 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因