概括
基因 9508
象征 Adamts3
同义词 Adamts-4
描述 Adam金属肽酶,具有血小板素1型基序3
参考 MIM:605011|HGNC:HGNC:219|ENSEMBL:ENSG00000156140|HPRD:06893|Vega:Otthumg00000129912
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q13.3
Pascal P值 0.037
TADA P值 0.017
胎儿β -0.658
DMG 2(#研究)
主持人 额叶皮质BA9
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
Adamts3 CHR4 73156717 C t NM_014243 p.929r> h 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13643796 4 73434209 Adamts3 -0.022 0.27 DMG:Nishioka_2013
CG19475535 4 73434780 Adamts3 1.18e-8 -0.014 4.88e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
USP48 0.94 0.95
ZNF638 0.94 0.95
ZNF655 0.93 0.93
SENP6 0.92 0.94
ZC3H11A 0.91 0.94
ZC3H7A 0.91 0.93
RBL2 0.91 0.92
TOPBP1 0.91 0.93
UBA6 0.91 0.94
MORC3 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.79 -0.83
MT-CO2 -0.78 -0.82
ifi27 -0.77 -0.83
AF347015.21 -0.77 -0.84
AF347015.27 -0.76 -0.79
AF347015.8 -0.76 -0.81
FXYD1 -0.75 -0.80
higd1b -0.75 -0.82
AF347015.33 -0.74 -0.77
mt-cyb -0.74 -0.78

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome细胞外基质组织 87 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胶原蛋白形成 58 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤区域 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)由tert dn永生 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng DNA损坏紫外线 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mir15a和mir16 1的Bonci目标 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向成纤维细胞 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因