基因页:Adamts1
概括?
基因 | 9510 |
象征 | Adamts1 |
同义词 | C3-C5 | Meth1 |
描述 | 与血小板素1型基序1的亚当金属肽酶1 |
参考 | MIM:605174|HGNC:HGNC:217|ENSEMBL:ENSG00000154734|HPRD:05530|Vega:Otthumg0000000078688 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21q21.2 |
Pascal P值 | 0.723 |
TADA P值 | 0.018 |
胎儿β | -2.47 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Adamts1 | CHR21 | 28214245 | G | 一个 | NM_006988 | p.381p> l | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01444578 | 21 | 28216559 | Adamts1 | 2.43e-5 | -0.422 | 0.017 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS798015 | CHR1 | 117320906 | Adamts1 | 9510 | 0.06 | 反式 | ||
RS3769467 | CHR2 | 201205340 | Adamts1 | 9510 | 0.03 | 反式 | ||
RS3769461 | CHR2 | 201222657 | Adamts1 | 9510 | 0.03 | 反式 | ||
RS17204557 | CHR3 | 151166057 | Adamts1 | 9510 | 0.04 | 反式 | ||
RS4256179 | CHR3 | 169628328 | Adamts1 | 9510 | 0.05 | 反式 | ||
RS9870311 | CHR3 | 169641061 | Adamts1 | 9510 | 0.05 | 反式 | ||
RS16891338 | CHR8 | 119671196 | Adamts1 | 9510 | 0.18 | 反式 | ||
RS1873825 | Chr9 | 72591054 | Adamts1 | 9510 | 0.08 | 反式 | ||
RS12685939 | Chr9 | 72684033 | Adamts1 | 9510 | 0.04 | 反式 | ||
RS2275750 | Chr10 | 26800505 | Adamts1 | 9510 | 0.15 | 反式 | ||
RS763641 | Chr11 | 123846625 | Adamts1 | 9510 | 0.04 | 反式 | ||
RS7107326 | Chr11 | 131332566 | Adamts1 | 9510 | 0.12 | 反式 | ||
RS2408301 | CHR13 | 51808915 | Adamts1 | 9510 | 0 | 反式 | ||
RS16995131 | CHR20 | 48844881 | Adamts1 | 9510 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ADAMTS1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ABCD4 | 0.86 | 0.82 |
AL161668.2 | 0.86 | 0.83 |
DHTKD1 | 0.86 | 0.85 |
Akt2 | 0.84 | 0.79 |
tulp3 | 0.84 | 0.84 |
TTC31 | 0.84 | 0.78 |
ARHGAP17 | 0.83 | 0.80 |
DDR1 | 0.83 | 0.82 |
ERBB2 | 0.82 | 0.78 |
Fanca | 0.82 | 0.70 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PLA2G4A | -0.48 | -0.52 |
serpini1 | -0.47 | -0.44 |
chn1 | -0.47 | -0.45 |
C5orf53 | -0.47 | -0.48 |
CCDC85B | -0.46 | -0.57 |
cacna1f | -0.46 | -0.50 |
Arhgdig | -0.46 | -0.55 |
RGS4 | -0.46 | -0.50 |
tuba1 | -0.45 | -0.53 |
AF347015.27 | -0.45 | -0.50 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DAVICIONI PAX FOXO1融合的目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纽曼ERCC6靶向DN | 39 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer PTHLH靶向DN | 73 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SASAI对肿瘤转移的耐药性 | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
总ELK3靶向DN | 32 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU细胞迁移 | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF DN的响应 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森对雄激素的反应 | 86 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
郑对砷DN的反应 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindvall通过Tert Up永生 | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Le滑雪目标 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK排卵前卵泡 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌DN | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 DN | 170 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gyorffy阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Uzonyi对白三烯和凝血酶的反应 | 37 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |