概括
基因 9510
象征 Adamts1
同义词 C3-C5 | Meth1
描述 与血小板素1型基序1的亚当金属肽酶1
参考 MIM:605174|HGNC:HGNC:217|ENSEMBL:ENSG00000154734|HPRD:05530|Vega:Otthumg0000000078688
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q21.2
Pascal P值 0.723
TADA P值 0.018
胎儿β -2.47
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
Adamts1 CHR21 28214245 G 一个 NM_006988 p.381p> l 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01444578 21 28216559 Adamts1 2.43e-5 -0.422 0.017 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS798015 CHR1 117320906 Adamts1 9510 0.06 反式
RS3769467 CHR2 201205340 Adamts1 9510 0.03 反式
RS3769461 CHR2 201222657 Adamts1 9510 0.03 反式
RS17204557 CHR3 151166057 Adamts1 9510 0.04 反式
RS4256179 CHR3 169628328 Adamts1 9510 0.05 反式
RS9870311 CHR3 169641061 Adamts1 9510 0.05 反式
RS16891338 CHR8 119671196 Adamts1 9510 0.18 反式
RS1873825 Chr9 72591054 Adamts1 9510 0.08 反式
RS12685939 Chr9 72684033 Adamts1 9510 0.04 反式
RS2275750 Chr10 26800505 Adamts1 9510 0.15 反式
RS763641 Chr11 123846625 Adamts1 9510 0.04 反式
RS7107326 Chr11 131332566 Adamts1 9510 0.12 反式
RS2408301 CHR13 51808915 Adamts1 9510 0 反式
RS16995131 CHR20 48844881 Adamts1 9510 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ABCD4 0.86 0.82
AL161668.2 0.86 0.83
DHTKD1 0.86 0.85
Akt2 0.84 0.79
tulp3 0.84 0.84
TTC31 0.84 0.78
ARHGAP17 0.83 0.80
DDR1 0.83 0.82
ERBB2 0.82 0.78
Fanca 0.82 0.70
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PLA2G4A -0.48 -0.52
serpini1 -0.47 -0.44
chn1 -0.47 -0.45
C5orf53 -0.47 -0.48
CCDC85B -0.46 -0.57
cacna1f -0.46 -0.50
Arhgdig -0.46 -0.55
RGS4 -0.46 -0.50
tuba1 -0.45 -0.53
AF347015.27 -0.45 -0.50

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI PAX FOXO1融合的目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纽曼ERCC6靶向DN 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应灰色 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer PTHLH靶向DN 73 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI对肿瘤转移的耐药性 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌吸烟者 80 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
总ELK3靶向DN 32 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU细胞迁移 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF DN的响应 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郑对砷DN的反应 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall通过Tert Up永生 78 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Le滑雪目标 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK排卵前卵泡 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌DN 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Uzonyi对白三烯和凝血酶的反应 37 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因