基因页面:FXR2
总结吗?
| GeneID | 9513年 |
| 象征 | FXR2 |
| 同义词 | FMR1L2 | FXR2P |
| 描述 | FMR1常染色体同族体2 |
| 参考 | MIM: 605339|HGNC: HGNC: 4024|运用:ENSG00000129245|HPRD: 05629|织女:OTTHUMG00000178237 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 p13.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.468 |
| 夏洛克假定值 | 0.136 |
| 胎儿β | -0.439 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10168927 | chr2 | 129503970 | FXR2 | 9513年 | 0.19 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CDKN2AIP | 0.91 | 0.93 |
| TRA2B | 0.91 | 0.92 |
| SF3A3 | 0.91 | 0.91 |
| HNRNPK | 0.91 | 0.90 |
| TIAL1 | 0.90 | 0.91 |
| WDR33 | 0.90 | 0.90 |
| SUZ12 | 0.90 | 0.91 |
| DHX15 | 0.90 | 0.91 |
| ELP2 | 0.90 | 0.91 |
| H2AFY | 0.90 | 0.90 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.79 | -0.88 |
| AF347015.27 | -0.78 | -0.86 |
| AF347015.33 | -0.78 | -0.86 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.86 |
| MT-CYB | -0.78 | -0.87 |
| AF347015.8 | -0.78 | -0.87 |
| AF347015.15 | -0.76 | -0.86 |
| AF347015.2 | -0.74 | -0.85 |
| FXYD1 | -0.74 | -0.86 |
| AF347015.21 | -0.73 | -0.86 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AMOTL2 | LCCP | angiomotin像2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| AP1M1 | AP47 | CLAPM2 | CLTNM | MU-1A | adaptor-related蛋白复合物1μ1亚基 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| AP2M1 | AP50 | CLAPM1 | mu2 | adaptor-related蛋白复合物2μ1亚基 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| ARL6IP1 | AIP1 | ARL6IP |武装者| KIAA0069 | ADP-ribosylation因子6相互作用蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| C10orf62 | bA548K23.1 | 开放阅读框62号染色体 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| C19orf50 | FLJ25480 | MGC2749 | MST096 | MSTP096 | 19号染色体50开放阅读框 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| C1orf149 | CDABP0189 | Eaf6 | FLJ11730 |纽约- sar - 91 | 染色体1 149年开放阅读框 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| CALCOCO2 | MGC17318 | NDP52 | 钙绑定和卷曲螺旋域2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| 哥伦比亚广播公司 | HIP4 | cystathionine-beta-synthase | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| CCDC33 | FLJ23168 | FLJ32855 | MGC34145 | 卷曲螺旋域包含33 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| CCDC85B | DIPA | 卷曲螺旋域包含85 b | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| CYFIP1 | FLJ45151 | P140SRA-1 | SHYC | SRA1 | 细胞质FMR1相互作用蛋白1 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 11438699 |
| DPPA2 | PESCRG1 | 发展多能性相关2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| FBP1 | 出口押汇 | 的特性,6-bisphosphatase 1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| FMR1 | FMRP | FRAXA | MGC87458 | | POF POF1 | 脆性X智力迟钝1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7489725|8668200 |10567518 |
| FTH1 | FHC | FTH | FTHL6 | MGC104426 | PIG15 | PLIF | 铁蛋白,多肽1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| FXR1 | - - - - - - | 脆性X智力迟钝,常染色体同族体1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7489725|8668200 |
| FXR2 | FMR1L2 | 脆性X智力迟钝,常染色体同族体2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7489725 |
| GKAP1 | FKSG21 | FLJ25469 | GKAP42 | G激酶锚定蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| HNRNPC | C1 | C2 | HNRNP | HNRPC | MGC104306 | MGC105117 | MGC117353 | MGC131677 | SNRPC | 异构核核糖核蛋白C (C1、C2) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| KCNRG | DLTET | 钾通道调节器 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| KCTD4 | bA321C24.3 | 钾通道tetramerisation域包含4 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| KIAA1217 | DKFZp761L0424 | MGC31990 | sk电讯 | KIAA1217 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| KRT20 | CD20 | CK20 |甘蓝型| KRT21 | MGC35423 | 角蛋白20 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| LCMT1 | cgi - 68 | LCMT | PPMT1 | 白氨酸羧基甲基转移酶1 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
| LDOC1 | BCUR1 | Mar7 | Mart7 | 亮氨酸拉链,抑制癌症的1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| MBIP | - - - - - - | 抑制蛋白质1 MAP3K12绑定 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| MCRS1 | ICP22BP | INO80Q | MCRS2 | MSP58 |只有 | microspherule蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| MED7 | CRSP33 | CRSP9 | MGC12284 | 中介复杂单元7 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| NCK2 | GRB4 | NCKbeta | NCK适配器蛋白2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| NECAB2 | EFCBP2 | 氨基类ef - hand钙结合蛋白2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| 禁忌 | NMT55 | NRB54 |意味着| P54NRB | octamer-binding non-POU域包含 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| NT5C2 | GMP | NT5B | PNT5 | cN-II | 5核苷酸酶,胞质二世 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| PAICS | 现ADE2 | ADE2H1 | | DKFZp781N1372 | MGC1343 | MGC5024 |《国家 | phosphoribosylaminoimidazole羧化酶,phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide合成酶 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| PCBD1 | DCOH | PCBD金刚石| |小灵通 | pterin-4 alpha-carbinolamine脱水酶/二聚代数余子式的肝细胞的核因子1α | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| PSME3 | Ki | PA28-gamma | PA28G | REG-GAMMA | 蛋白酶体(prosome macropain)激活单元3 (PA28伽马;Ki) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RABAC1 | PRA1 | PRAF1 | YIP3 | Rab受体1 (prenylated) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RALYL | HNRPCL3 | 日RNA结合蛋白质像 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RBBP8 | CTIP |边缘 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白8 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RBMX | HNRPG | RBMXP1 | RBMXRT | RNMX | hnRNP-G | 蛋白质、RNA结合图案x连锁 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RBPMS | 爱马仕 | 与多个拼接RNA结合蛋白 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RPIA | 零售物价指数 | 核糖5-phosphate异构酶一 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RTN3 | ASYIP | HAP | NSPL2 | NSPLII | RTN3-A1 | reticulon 3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| RTN4 | 容易| NI220/250 |勿动蛋白| NOGO-A | NOGOC NSP | | NSP-CL | Nbla00271 | Nbla10545 | Nogo-B | Nogo-C | RTN-X | RTN4-A | RTN4-B1 | RTN4-B2 | RTN4-C | reticulon 4 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| SNAP23 | HsT17016 | SNAP23A | SNAP23B | synaptosomal-associated蛋白质,23 kda | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| SSSCA1 | p27 | 干燥综合征/硬皮病自身抗原1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| THAP1 | FLJ10477 | MGC33014 | THAP域包含细胞凋亡相关蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| TNNT1 | TNT ANM | FLJ98147 | MGC104241 | STNT | | TNT | 肌钙蛋白T 1型(骨骼、缓慢) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| TRAF2 | 德国:45012 |陷阱| TRAP3 | TNF receptor-associated因子2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| TRIM29 | ATDC | FLJ36085 | 三方motif-containing 29 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| TRIM37 | KIAA0898 | MUL | POB1 | TEF3 | 三方motif-containing 37 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| TSC22D4 | THG-1 | THG1 | TSC22域家族成员4 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| ZBTB8 | BOZF1 | FLJ90065 | MGC17919 | 锌指和BTB域包含8 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| ZNF451 | 过山车| FLJ23421 | FLJ53246 | FLJ90693 | KIAA0576 | KIAA1702 | MGC26701 | dJ417I1.1 | 锌指蛋白451 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 多恩对雄激素 | 184年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过SMAD4 JAZAG TGFB1信号 | 108年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AMIT EGF响应480海拉 | 164年 | 118年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 与17个p13 HASLINGER B CLL删除 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN TAVOR CEBPA目标 | 30. | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒20小时 | 240年 | 152年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒16人力资源 | 225年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| S3 HOSHIDA肝癌子类 | 266年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |