基因页面:GAL3ST1
总结吗?
| GeneID | 9514年 |
| 象征 | GAL3ST1 |
| 同义词 | 中科 |
| 描述 | galactose-3-O-sulfotransferase 1 |
| 参考 | MIM: 602300|HGNC: HGNC: 24240|运用:ENSG00000128242|HPRD: 03806|织女:OTTHUMG00000151200 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 22 q12.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.003 |
| 夏洛克假定值 | 0.345 |
| 胎儿β | -2.369 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.031 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs5003961 | chr7 | 78072443 | GAL3ST1 | 9514年 | 0 | 反式 | ||
| rs4515471 | chr7 | 78072585 | GAL3ST1 | 9514年 | 0 | 反式 | ||
| rs7830259 | chr8 | 14087643 | GAL3ST1 | 9514年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs17137051 | chr16 | 4521748 | GAL3ST1 | 9514年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF710 | 0.89 | 0.88 |
| ABL1 | 0.88 | 0.88 |
| TCF3 | 0.87 | 0.82 |
| ZNF618 | 0.87 | 0.83 |
| GYS1 | 0.87 | 0.88 |
| DLL1 | 0.86 | 0.82 |
| NUP210 | 0.86 | 0.83 |
| RAVER1 | 0.86 | 0.86 |
| RCC2 | 0.86 | 0.80 |
| LRP5 | 0.86 | 0.81 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.55 | -0.65 |
| AF347015.31 | -0.52 | -0.67 |
| AF347015.27 | -0.50 | -0.63 |
| MT-CO2 | -0.49 | -0.65 |
| IFI27 | -0.49 | -0.61 |
| MYL3 | -0.49 | -0.64 |
| AF347015.21 | -0.49 | -0.72 |
| HIGD1B | -0.48 | -0.63 |
| S100B | -0.48 | -0.59 |
| B2M | -0.48 | -0.58 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0001733 | galactosylceramide sulfotransferase活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008146 | sulfotransferase活动 | 助教 | 9030544 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0042552 | 髓鞘形成 | 国际能源机构 | 大脑神经元,轴突,少突细胞(术语层面:13) | - - - - - - |
| 去:0006487 | 蛋白质氨基酸N-linked糖基化 | 助教 | 9030544 | |
| 去:0007283 | 精子发生 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006682 | galactosylceramide生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009058 | 生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0000139 | 高尔基体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005624 | 膜分数 | 助教 | 9030544 | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 9030544 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG鞘脂类代谢 | 40 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME鞘糖脂代谢 | 38 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME磷脂代谢 | 198年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME鞘脂类代谢 | 69年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN BASAKI YBX1目标 | 384年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡 | 552年 | 347年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦纳VHL DN的目标 | 18 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江缺氧正常 | 311年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤EZH2的目标 | 245年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精母细胞 | 72年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究人类MITODB 6 2002 | 429年 | 260年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王MLL目标 | 289年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |