基因页：GOSR1

Summary？
基因 9527
象征 GOSR1
Synonyms GOLIM2 | GOS-28 | GOS28 | GOS28/P28 | GS28 | P28
Description golgi SNAP receptor complex member 1
Reference MIM:604026|HGNC:HGNC:4430|ENSEMBL：ENSG00000108587|Vega：Otthumg00000132796
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q11
Pascal P值 2.499E-4
Sherlock p-value 0.533
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
皮质
Frontal Cortex BA9
Myers' cis & trans

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16965255 CHR17 28182193 GOSR1 9527 0.13 顺式
rs3764417 17 28705043 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -99337 gtex_brain_ba24
RS7220213 17 28709055 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -95325 gtex_brain_ba24
rs7222059 17 28709426 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -94954 gtex_brain_ba24
RS4794871 17 28713789 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -90591 gtex_brain_ba24
RS7209857 17 28728401 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.856E-6 0.01 -75979 gtex_brain_ba24
RS6505185 17 28734413 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.867E-6 0.01 -69967 gtex_brain_ba24
rs2191351 17 28759035 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -45345 gtex_brain_ba24
RS758722 17 28771495 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.728E-6 0.01 -32885 gtex_brain_ba24
RS4795553 17 28777324 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -27056 gtex_brain_ba24
RS2253256 17 28778720 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -25660 gtex_brain_ba24
RS6505188 17 28784382 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -19998 gtex_brain_ba24
RS9406 17 28794020 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -10360 gtex_brain_ba24
rs11080127 17 28797497 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.832E-6 0.01 -6883 gtex_brain_ba24
RS6505189 17 28801076 GOSR1 ENSG00000108587.10 7.006E-7 0.01 -3304 gtex_brain_ba24
rs8072409 17 28802359 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 -2021 gtex_brain_ba24
RS4795554 17 28804996 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.726E-6 0.01 616 gtex_brain_ba24
RS7223819 17 28814674 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 10294 gtex_brain_ba24
rs9896063 17 28815428 GOSR1 ENSG00000108587.10 8.912E-7 0.01 11048 gtex_brain_ba24
RS7212107 17 2882​​0047 GOSR1 ENSG00000108587.10 8.135E-7 0.01 15667 gtex_brain_ba24
RS7218912 17 2882​​1826 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.059E-6 0.01 17446 gtex_brain_ba24
RS2321857 17 28826560 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.369E-6 0.01 22180 gtex_brain_ba24
RS9896343 17 28831253 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 26873 gtex_brain_ba24
RS1434688 17 28840397 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.073E-6 0.01 36017 gtex_brain_ba24
RS6505191 17 28843030 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 38650 gtex_brain_ba24
RS9900343 17 28843190 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 38810 gtex_brain_ba24
RS9895966 17 28846054 GOSR1 ENSG00000108587.10 8.199E-7 0.01 41674 gtex_brain_ba24
RS12944483 17 28846162 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 41782 gtex_brain_ba24
RS82390 17 28860333 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.072E-6 0.01 55953 gtex_brain_ba24
rs216472 17 28864382 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 60002 gtex_brain_ba24
rs216473 17 28864910 GOSR1 ENSG00000108587.10 4.393E-6 0.01 60530 gtex_brain_ba24
rs428725 17 28865900 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.067E-6 0.01 61520 gtex_brain_ba24
rs216475 17 28865969 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 61589 gtex_brain_ba24
rs216476 17 28866646 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 62266 gtex_brain_ba24
rs216484 17 28871175 GOSR1 ENSG00000108587.10 1.071E-6 0.01 66795 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Stim1 0.84 0.88
AC105206.1 0.84 0.91
MAP2K1 0.83 0.89
NPTN 0.83 0.88
RP5-1187M17.1 0.83 0.88
ACTN1 0.83 0.83
RASGEF1A 0.83 0.89
C2orf55 0.83 0.82
SLC35F3 0.82 0.87
NCDN 0.82 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
BCL7C -0.43 -0.53
HEBP2 -0.40 -0.55
KIAA1949 -0.40 -0.28
tubb2b -0.39 -0.39
traf4 -0.39 -0.43
SH2B2 -0.38 -0.41
FABP7 -0.38 -0.47
AF186192.1 -0.38 -0.27
RBMX2 -0.38 -0.42
FADS2 -0.38 -0.32

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005484 SNAP受体活性 艾达 15215310
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006886 细胞内蛋白转运 IEA -
去：0006891 高尔基体囊泡介导的转运 TAS 8636227
GO：0016192 囊泡介导的运输 IEA -
GO：0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 艾达 15215310
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0031201 军鼓复合物 TAS 神经元，突触（GO期限：6） 15215310
GO:0000139 Golgi membrane IEA -
去：0005794 高尔基体 艾达 15215310
去：0016020 membrane IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
BET1 DKFZp781C0425 | HBET1 阻塞在运输1 homolog (S. cerevisiae) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11927603
bet1l bet1l1 |golim3 |GS15 |HSPC197 在运输1同源物（S. cerevisiae）的早期被阻塞 - 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11927603|12388752
EBI3 IL27B Epstein-Barr virus induced 3 - HPRD,BioGRID 12121660
gabarapl2 ATG8 |门16 |GATE16 |GEF-2 |GEF2 GABA（A）受体相关蛋白样2 - HPRD 10747018
IL27RA CRL1 |IL27R |TCCR |WSX1 |ZCYTOR1 白介素27受体，α 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12121660
纳帕 Snapa N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白，α - HPRD 9325254
NSF SKD2 N-乙基马来酰亚胺敏感因子 - HPRD 8636227|9325254
snap25 FLJ23079 |RIC-4 |Ric4 |sec9 |快照|Snap-25 |BA416N4.2 |DJ1068F16.2 突触小体相关蛋白，25KDA 重构的复合物 Biogrid 9325254
STX5 sed5 |STX5A 语法5 - HPRD,BioGRID 9094723
USO1 P115 |点击|VDP USO1同源物，囊泡对接蛋白（酵母） 共纯化
重构的复合物		 Biogrid 11927603
YKT6 - YKT6v-SNARE homolog (S. cerevisiae) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11927603


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG SNARE INTERACTIONS IN VESICULAR TRANSPORT 38 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOLLMANN APOPTOSIS VIA CD40 DN 267 178 All SZGR 2.0 genes in this pathway
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 70 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHLOSSER SERUM RESPONSE DN 712 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEI MYB目标 318 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NOUZOVA TRETINOIN AND H4 ACETYLATION 143 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JI对FSH的响应 74 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
促进耐受巨噬细胞 156 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN UP 439 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MIKKELSEN NPC ICP WITH H3K4ME3 445 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Alfano MYC目标 239 156 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 4285 4291 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
hsa-miR-20abrain UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-106a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa-miR-106bSZ UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20bSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-9 372 378 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga