基因页：polr1c
概括？
| 基因 | 9533 |
| 象征 | polr1c |
| 同义词 | AC40 | HLD11 | RPA39 | RPA40 | RPA5 | RPAC1 | RPC40 | TCS3 |
| 描述 | 聚合酶（RNA）I亚基C |
| 参考 | MIM：610060|HGNC：HGNC：20194|ENSEMBL：ENSG00000171453|HPRD：09661|Vega：Otthumg0000000014739 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.1 |
| Pascal P值 | 3.739E-5 |
| Sherlock P值 | 0.454 |
| 胎儿β | 0.225 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04433 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14490972 | 6 | 43484812 | polr1c | 8.75e-10 | -0.019 | 1.09E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CNTNAP1 | 0.93 | 0.88 |
| KCNJ9 | 0.91 | 0.88 |
| gabarapl3 | 0.90 | 0.89 |
| NPTN | 0.90 | 0.87 |
| CAMTA2 | 0.90 | 0.92 |
| EHD3 | 0.90 | 0.87 |
| SYNGR1 | 0.90 | 0.85 |
| SLC12A5 | 0.90 | 0.90 |
| rph3a | 0.89 | 0.82 |
| ptprn | 0.89 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bcl7c | -0.54 | -0.62 |
| C9orf46 | -0.49 | -0.50 |
| RPL23A | -0.47 | -0.53 |
| RPL35 | -0.47 | -0.54 |
| RPL18 | -0.47 | -0.55 |
| rps19p3 | -0.47 | -0.57 |
| RPS18 | -0.46 | -0.48 |
| RPS8 | -0.46 | -0.48 |
| RPLP1 | -0.46 | -0.50 |
| RPS6 | -0.46 | -0.49 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| 去：0003899 | DNA指导的RNA聚合酶活性 | IEA | - | |
| 去：0003899 | DNA指导的RNA聚合酶活性 | 塔斯 | 9540830 | |
| GO：0046983 | 蛋白质二聚活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0006360 | RNA聚合酶I启动子的转录 | 塔斯 | 9540830 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005654 | 核质 | 经验 | 9582279|12393749|12646563 |
|
| 去：0005736 | DNA指导的RNA聚合酶I复合物 | 塔斯 | 9540830 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg Purine代谢 | 159 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG嘧啶代谢 | 98 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG RNA聚合酶 | 29 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg胞质DNA感应途径 | 56 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta ARF途径 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 2型启动子的Reactome RNA Pol III转录启动 | 23 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录终止 | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol III转录 | 33 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol III转录启动来自3型启动子 | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol III转录终止 | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol III链伸长 | 17 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I转录启动 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanharanta子宫肌瘤，带7Q缺失DN | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Grasemann视网膜细胞瘤，具有6p扩增 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahajan对IL1A DN的反应 | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莫迪海马产前 | 42 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 | 73 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |