基因页:CIR1
概括?
基因 | 9541 |
象征 | CIR1 |
同义词 | CIR |
描述 | CorePressor与RBPJ相互作用,1 |
参考 | MIM:605228|HGNC:HGNC:24217|ENSEMBL:ENSG00000138433|HPRD:05568|Vega:Otthumg00000132338 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q31.1 |
Pascal P值 | 0.027 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1570589 | Chr9 | 116874354 | CIR1 | 9541 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CIR1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATF2 | 0.94 | 0.94 |
ZFR | 0.94 | 0.93 |
KPNA4 | 0.93 | 0.94 |
rad23b | 0.93 | 0.93 |
FBXO38 | 0.93 | 0.92 |
ZBTB11 | 0.93 | 0.94 |
IARS | 0.92 | 0.93 |
COPB2 | 0.92 | 0.92 |
TBC1D23 | 0.92 | 0.92 |
Golph3 | 0.92 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.77 | -0.80 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.77 |
higd1b | -0.74 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.74 | -0.75 |
ifi27 | -0.74 | -0.77 |
AF347015.31 | -0.73 | -0.76 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.73 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.75 |
AC021016.1 | -0.71 | -0.71 |
mt-cyb | -0.70 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Notch信号通路 | 47 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shiraishi PLZF靶向 | 10 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheok对伏硫嘌呤DN的反应 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
URS脂肪细胞分化 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng DNA损坏紫外线 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |