概括
基因 9542
象征 NRG2
同义词 don1 | hrg2 | ntak
描述 Neuregulin 2
参考 MIM:603818|HGNC:HGNC:7998|ENSEMBL:ENSG00000158458|HPRD:04821|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q31.2
Pascal P值 0.032
胎儿β 0.448
DMG 2(#研究)
支持 神经营养蛋白信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15992535 5 139228150 NRG2 5.466E-4 1.142 0.049 DMG:Wockner_2014
CG27152280 5 139423077 NRG2 3.81E-9 -0.008 2.4e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
UNK 0.90 0.93
Men1 0.89 0.92
U2AF2 0.88 0.91
班普 0.88 0.90
NUP62 0.88 0.93
CCDC97 0.88 0.92
MTA1 0.88 0.90
DVL3 0.88 0.91
MAP3K7IP1 0.88 0.91
ttyh3 0.87 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.72 -0.87
MT-CO2 -0.71 -0.87
AF347015.27 -0.70 -0.86
AF347015.33 -0.69 -0.83
C5orf53 -0.69 -0.76
mt-cyb -0.69 -0.84
S100B -0.68 -0.79
FXYD1 -0.67 -0.81
AF347015.8 -0.67 -0.85
AF347015.21 -0.65 -0.88

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008083 生长因子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 塔斯 9168114|9168115
去:0009790 胚胎发展 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg erbb信号通路 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AGR途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB4途径 38 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB2 ERBB3途径 44 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB网络途径 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 ERBB3信号的反应组下调 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2信号中的Reactome GRB2事件 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4信号中的Reactome PI3K事件 38 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4信号中的Reactome SHC1事件 20 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2信号中的Reactome PI3K事件 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome核信号传导 38 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维萨拉衰老淋巴细胞DN 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黑川肝癌早期复发 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-129-5p 155 161 M8 HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-450 155 161 1a HSA-MIR-450 uuuuugcgauguuccuaaua