基因页：sec22b
概括？
| 基因 | 9554 |
| 象征 | sec22b |
| 同义词 | ERS-24 | SEC22L1 |
| 描述 | Sec22同源物B，囊泡运输蛋白（基因/假元） |
| 参考 | MIM：604029|HGNC：HGNC：10700|HPRD：04939| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21.1 |
| Sherlock P值 | 0.288 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| dyrk1a | 0.97 | 0.97 |
| ADNP2 | 0.96 | 0.97 |
| FOXJ3 | 0.95 | 0.96 |
| AP003115.1 | 0.95 | 0.97 |
| polr3a | 0.95 | 0.96 |
| PDE12 | 0.95 | 0.95 |
| FAM115A | 0.95 | 0.97 |
| USP22 | 0.95 | 0.97 |
| AP1G1 | 0.95 | 0.96 |
| NUP153 | 0.94 | 0.97 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.80 | -0.86 |
| MT-CO2 | -0.79 | -0.86 |
| AF347015.31 | -0.79 | -0.85 |
| higd1b | -0.76 | -0.86 |
| AF347015.33 | -0.76 | -0.81 |
| S100B | -0.76 | -0.82 |
| ifi27 | -0.75 | -0.82 |
| AC021016.1 | -0.75 | -0.82 |
| AF347015.8 | -0.74 | -0.84 |
| mt-cyb | -0.74 | -0.81 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15272311 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006888 | ER到高尔基体介导的运输 | 塔斯 | 9094723 | |
| GO：0016192 | 囊泡介导的运输 | IEA | - | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0033116 | er-golgi中间室膜 | IEA | - | |
| GO：0042470 | 黑色素体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 囊泡运输中的kegg圈圈相互作用 | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌Znf217扩增 | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 | 137 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheok对高清MTX DN的响应 | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 抗原表现中的Pellicciotta HDAC | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-1/206 | 455 | 461 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
| mir-19 | 621 | 627 | 1a | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
| mir-23 | 530 | 536 | 1a | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-378 | 54 | 60 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |