基因页：H2afy
Summary？
| 基因ID | 9555 |
| Symbol | H2afy |
| 同义词 | h2a.y | h2a/y | h2af12m | macroh2a1.1 | mh2a1 | macroh2a1.2 |
| 描述 | H2A组蛋白家庭成员y |
| 参考 | MIM：610054|HGNC：HGNC：4740|ENSEMBL：ENSG00000113648|HPRD：13624|Vega：Otthumg00000129141 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5q31.1 |
| Pascal P值 | 0.63 |
| Sherlock P值 | 0.648 |
| 胎儿β | 0.569 |
| DMG | 1（＃研究） |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG15888087 | 5 | 134735104 | H2afy | 1.1E-8 | -0.01 | 4.65e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GCC2 | 0.90 | 0.86 |
| MAPK9 | 0.90 | 0.89 |
| EPS15 | 0.89 | 0.88 |
| DNAJC27 | 0.89 | 0.88 |
| SGTB | 0.89 | 0.86 |
| B4GALT6 | 0.89 | 0.89 |
| SAMD12 | 0.89 | 0.83 |
| DDHD2 | 0.88 | 0.86 |
| 钩1 | 0.88 | 0.88 |
| RIMS1 | 0.88 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bcl7c | -0.51 | -0.58 |
| AC006276.2 | -0.49 | -0.49 |
| NME4 | -0.48 | -0.57 |
| sigirr | -0.47 | -0.54 |
| RPLP1 | -0.46 | -0.50 |
| RPL36 | -0.45 | -0.51 |
| RPL28 | -0.45 | -0.54 |
| RPL23A | -0.45 | -0.48 |
| RPL35 | -0.45 | -0.50 |
| RPL18 | -0.44 | -0.51 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | nas | 9714746 | |
| 去：0003682 | 染色质结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006334 | nucleosome assembly | nas | 9714746 | |
| GO:0007549 | 剂量补偿 | 艾达 | 15053874 | |
| GO：0016568 | 染色质修饰 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001740 | 巴尔身体 | 艾达 | 11331621 | |
| 去：0000786 | nucleosome | nas | 9714746 | |
| 去：0000793 | 冷凝染色体 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005694 | chromosome | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-148/152 | 184 | 190 | 1a | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir-411 | 227 | 233 | M8 | HSA-MIR-411 | aacacgguccacuaacccucagu |