基因页：BCAR1

概括?
基因 9564
Symbol BCAR1
同义词 CAS|CAS1|CASS1|CRKAS|P130Cas
描述 乳腺癌抗雌激素抵抗1
参考 MIM:602941|HGNC：HGNC：971|Ensembl:ENSG00000050820|HPRD:04248|Vega：Otthumg00000137604
Gene type protein-coding
地图位置 16Q23.1
Pascal P值 0.13
Sherlock P值 0.531
Fetal beta -0.467
DMG 2（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 2
Expression 基因表达的荟萃分析 P价值：2.094

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg04914057 16 75283093 BCAR1 1.729E-4 -0.306 0.033 DMG:Wockner_2014
cg02438653 16 75285726 BCAR1 2.66E-8 -0.012 8.45e-6 DMG:Jaffe_2016

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs9592471 CHR13 34989794 BCAR1 9564 0.1 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004871 signal transducer activity 塔斯 8070403
GO:0005515 protein binding IEA -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 9748234|10339567|10587647
|11782456|14688263
|16105984
GO:0017124 SH3 domain binding IEA -
GO:0019903 protein phosphatase binding 新闻学会 9285683
GO:0019901 蛋白激酶结合 新闻学会 8070403|8649368|9020138
|9472046|10026197
|16245368
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0001558 regulation of cell growth 塔斯 11607844
去：0007186 G-protein coupled receptor protein signaling pathway ISS -
去：0007186 G-protein coupled receptor protein signaling pathway NAS 10092204
去：0007173 表皮生长因子受体信号通路 ISS -
去：0007155 细胞粘附 IEA -
去：0007229 整联蛋白介导的信号通路 艾达 8649368
去：0007229 整联蛋白介导的信号通路 ISS -
去：0008283 细胞增殖 塔斯 10639512
去：0008286 insulin receptor signaling pathway ISS -
GO:0048011 nerve growth factor receptor signaling pathway ISS -
GO:0048008 血小板来源的生长因子受体信号通路 ISS -
去：0007015 肌动蛋白细丝组织 艾达 16105984
去：0007015 肌动蛋白细丝组织 ISS -
GO:0042981 regulation of apoptosis 塔斯 11607844
GO：0050852 T细胞受体信号通路 NAS 9295052
GO:0051301 细胞分裂 NAS 10675905
GO:0030335 细胞迁移的阳性调节 艾达 9472046
GO:0030335 细胞迁移的阳性调节 ISS -
GO：0050853 B cell receptor signaling pathway 艾达 9020138
GO：0050853 B cell receptor signaling pathway ISS -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0001726 荷叶边 艾达 9472046
去：0001726 荷叶边 ISS -
GO:0005624 膜分数 艾达 8070403
GO:0005624 膜分数 ISS -
GO:0005737 细胞质 艾达 8070403
GO:0005737 细胞质 ISS -
GO：0030027 薄片 IEA -
去：0005925 focal adhesion ISS -
GO：0030054 细胞连接 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ABL1 ABL | JTK7 | bcr/abl | c-ABL | p150 | v-abl c-abl oncogene 1, receptor tyrosine kinase - HPRD，Biogrid 7780740
BCAR3 KIAA0554 | NSP2 | SH2D3B 乳腺癌抗雌激素抵抗3 Affinity Capture-Western BioGRID 12517963
CD2AP CMS |DKFZP586H0519 CD2-associated protein - HPRD，Biogrid 10339567
CRK CRKII V-CRK肉瘤病毒CT10 ONCOGENE同源物（Avian） Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 9581808|9920935
|10085298|10329689
|11369773|12615911
|14657239|15492270
CRKL - V-CRK肉瘤病毒CT10癌基因同源物（Avian）类似 - HPRD，Biogrid 10753828
CSPG4 HMW-MAA |MCSP |MCSPG |mel-cspg |MSK16 |NG2 chondroitin sulfate proteoglycan 4 - HPRD 10587647
DOCK1 DOCK180| ced5 dedicator of cytokinesis 1 - HPRD，Biogrid 12615911
E2F2 E2F-2 E2F转录因子2 两个杂交 BioGRID 16169070
EFS CAS3 | CASS3 | EFS1 | EFS2 | HEFS | SIN embryonal Fyn-associated substrate 两个杂交 BioGRID 16169070
费斯 FPS 猫科动物肉瘤 Affinity Capture-Western
Biochemical Activity
Reconstituted Complex		 BioGRID 8999909
FXYD6 - FXYD domain containing ion transport regulator 6 两个杂交 BioGRID 16169070
FYN MGC45350 |SLK |syn FYN oncogene related to SRC, FGR, YES - HPRD，Biogrid 9188452
GRB2 ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD 8649368|8700507
GRB2 ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 10085298|10822386
GSN DKFZp313L0718 凝胶素（淀粉样变性，芬兰类型） - HPRD 11577104
HCK JTK9 hemopoietic cell kinase - HPRD，Biogrid 9020138
HSPA5 bip |FLJ26106 |GRP78 |mif2 heat shock 70kDa protein 5 (glucose-regulated protein, 78kDa) 两个杂交 BioGRID 16169070
ID2 gig8 |ID2A |ID2H |MGC26389 |BHLHB26 inhibitor of DNA binding 2, dominant negative helix-loop-helix protein Affinity Capture-Western BioGRID 10502414
inppl1 SHIP2 inositol polyphosphate phosphatase-like 1 - HPRD，Biogrid 11158326
JUB Ajuba |MGC15563 Jub，Ajuba同源物（Xenopus laevis） - HPRD 15728191
LCK yt16 |p56lck |pp58lck 淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶 - HPRD，Biogrid 9020138
LYN FLJ26625 |JTK8 v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral related oncogene homolog - HPRD，Biogrid 9581808
MAPK8 jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 mitogen-activated protein kinase 8 Affinity Capture-Western BioGRID 11432831
NCK1 MGC12668 | NCK | NCKalpha NCK适配器蛋白1 - HPRD，Biogrid 12135674
nedd9 CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 - HPRD 8668148|9366405
nedd9 CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 Affinity Capture-Western BioGRID 10502414
NPHP1 FLJ97602 |JBTS4 |nph1 |SLSN1 肾植物1（少年） - HPRD，Biogrid 10739664|11493697
PIK3R1 grb1 |P85 |p85-alpha phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 1 (alpha) - HPRD，Biogrid 10799562
PKD1 PBP 多囊肾脏病1（常染色体显性症） - HPRD 11113628
PPP1R15A GADD34 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基15A 两个杂交 BioGRID 16169070
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 - HPRD 11514617
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 8649427|8810278
|11577104|12135674
|12615911
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 - HPRD 7479864|11514617
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 CAS interacts with FAK. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human CAS and mouse FAK. BIND 9148935
ptk2b CADTK | CAKB | FADK2 | FAK2 | FRNK | PKB | PTK | PYK2 | RAFTK PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β - HPRD，Biogrid 8995252
PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1 - HPRD，Biogrid 8940134
PTPN11 BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型 Affinity Capture-Western BioGRID 9188452
PTPN12 PTP-PEST | PTPG1 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体12型 Affinity Capture-Western
Biochemical Activity
Reconstituted Complex		 BioGRID 8887669|9285683
|9748319|12714323
PTPN12 PTP-PEST | PTPG1 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体12型 - HPRD 8887669|9285683
|9748319|9920935
|12714323
ptprf FLJ43335 |FLJ45062 |FLJ45567 |拉尔 protein tyrosine phosphatase, receptor type, F - HPRD 10822386
ptprh FLJ39938 |MGC133058 |MGC133059 |SAP-1 protein tyrosine phosphatase, receptor type, H - HPRD，Biogrid 11278335
PXN FLJ16691 帕西林 Affinity Capture-Western BioGRID 8810278|11577104
RAPGEF1 C3G |DKFZP781P1719 |GRF2 RAP鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）1 - HPRD，Biogrid 9748234
RICS GC-GAP | GRIT | KIAA0712 | MGC1892 | p200RhoGAP | p250GAP Rho GTPase-activating protein - HPRD，Biogrid 12446789|12819203
SFN 是的 stratifin 亲和力捕获ms BioGRID 15778465
SH2D3A NSP1 SH2 domain containing 3A - HPRD，Biogrid 10187783
SH2D3C 聊天|FLJ39664 |NSP3 |Pro34088 SH2 domain containing 3C Affinity Capture-Western BioGRID 10692442
SH3KBP1 CIN85 |gig10 |MIG18 SH3核蛋白激酶结合蛋白1 Affinity Capture-Western BioGRID 11071869
SNIP KIAA1684 SNAP25相互作用蛋白 - HPRD，Biogrid 14657239
SRC ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian) C-SRC与CAS相互作用。 BIND 9148935
SRC ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian) Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 10085298|10487518
|10739664|11514617
|12397603|12615911
TNS1 DKFZp586K0617 | MGC88584 | MST091 | MST122 | MST127 | MSTP122 | MSTP127 | MXRA6 | TNS Tensin 1 Affinity Capture-Western BioGRID 8810278
TRIP6 MGC10556 | MGC10558 | MGC29959 | MGC3837 | MGC4423 | OIP1 | ZRP-1 thyroid hormone receptor interactor 6 - HPRD，Biogrid 11782456|14688263
VCL CMD1W | MVCL vinculin Affinity Capture-Western BioGRID 11577104
VPS11 end1 |pep5 |RNF108 |HVPS11 液泡蛋白排序11个同源物（S. cerevisiae） 两个杂交 BioGRID 16169070
ywhaz KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，Zeta多肽 - HPRD，Biogrid 10026197
ZYX ESP-2 | HED-2 zyxin Affinity Capture-Western BioGRID 11782456


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LEUKOCYTE TRANSENDOTHELIAL MIGRATION 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Cell2Cell途径 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CXCR4 PATHWAY 24 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA INTEGRIN PATHWAY 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PYK2 PATHWAY 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Pten途径 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST INTEGRIN SIGNALING PATHWAY 82 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PRL SIGNALING EVENTS PATHWAY 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ER非原始组途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID遇到了路径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42 PATHWAY 70 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RET PATHWAY 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NETRIN PATHWAY 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素A9B1途径 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IGF1 PATHWAY 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid upa upar途径 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB途径 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHA2 FWD PATHWAY 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素A4B1途径 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Rac1途径 54 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAK PATHWAY 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTEGRIN CELL SURFACE INTERACTIONS 79 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P130CAS连接到整合素的MAPK信号传导 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome整合素alphaiib beta3信号传导 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游信号转导 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET AGGREGATION PLUG FORMATION 36 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧 92 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由D GRAESSMANN细胞凋亡OXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL AND PROGENITOR 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D DN 64 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
替代孕激素靶标 36 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因