基因页：Sox13
概括？
| 基因 | 9580 |
| 象征 | Sox13 |
| 同义词 | ICA12 | SOX-13 |
| 描述 | Sry-Box 13 |
| 参考 | MIM：604748|HGNC：HGNC：11192|ENSEMBL：ENSG00000143842|Vega：Otthumg0000000036050 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q32 |
| Sherlock P值 | 0.142 |
| 胎儿β | -0.641 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG22337509 | 1 | 204093899 | Sox13 | 4.256E-4 | 0.332 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
| CG10507231 | 1 | 204459638 | Sox13 | 0.003 | -2.512 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6905929 | CHR6 | 13350245 | Sox13 | 9580 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名2向上 | 139 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Streicher LSM1靶向 | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TCGA胶质母细胞瘤副本编号 | 75 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein ESR1目标 | 85 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Noushmehr GBM种系突变 | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |