基因页：apobec3b
概括？
| 基因 | 9582 |
| 象征 | apobec3b |
| 同义词 | a3b | apobec1l | arcd3 | arp4 | dj742c19.2 | phrbnl | bk150c2.2 |
| 描述 | 载脂蛋白B mRNA编辑酶催化亚基3B |
| 参考 | MIM：607110|HGNC：HGNC：17352|Ensembl：ENSG00000179750|HPRD：06169|Vega：Otthumg00000151085 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22Q13.1-Q13.2 |
| Pascal P值 | 0.745 |
| 胎儿β | 1.481 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26000393 | 22 | 39378224 | apobec3b | 4E-5 | -0.583 | 0.02 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BRD1 | 0.97 | 0.96 |
| LDB1 | 0.96 | 0.93 |
| NUP62 | 0.96 | 0.94 |
| Smarca4 | 0.96 | 0.95 |
| EHMT1 | 0.96 | 0.94 |
| ILF3 | 0.96 | 0.95 |
| DHX34 | 0.96 | 0.95 |
| DHX38 | 0.96 | 0.96 |
| GTF2IDD1 | 0.95 | 0.95 |
| RBM10 | 0.95 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.72 | -0.78 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.87 |
| AF347015.27 | -0.69 | -0.85 |
| B2M | -0.68 | -0.80 |
| S100B | -0.68 | -0.80 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.86 |
| ifi27 | -0.67 | -0.82 |
| COPZ2 | -0.67 | -0.78 |
| FXYD1 | -0.67 | -0.82 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.81 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sotiriou乳腺癌1级vs 3 | 151 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Horiuchi WTAP目标DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham CML静止与正常静止 | 87 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham正常静止与正常分裂DN | 87 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗斯蒂宫颈癌增殖簇 | 140 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM MYCN扩增靶向DN | 103 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath增殖 | 147 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheok对伏硫嘌呤DN的反应 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| flt3的大风apl突变 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedenfalk乳腺癌bracx | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 营地结肠癌拷贝编号DN | 74 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SAGIV CD24目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 浆细胞与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 67 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 | 65 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ceribelli启动子不活跃，受NFY的约束 | 44 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Duan PRDM5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hecker IFNB1目标 | 95 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |