概括
基因 9588
象征 PRDX6
同义词 1-cys | aop2 | hel-s-128m | nsgpx | prx | aipla2 | p29
描述 过氧蛋白6
参考 MIM:602316|HGNC:HGNC:16753|Ensembl:ENSG00000117592|HPRD:03817|Vega:Otthumg0000000034804
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q25.1
Sherlock P值 0.173
TADA P值 6.16e-4
胎儿β -0.78
支持 G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA
G2CDB.HUMANNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
PRDX6 CHR1 173450463 一种 n NM_004905
NM_004905

内含子
剪接-Ceppector-In2
精神分裂症 DNM:XU_2012


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ntrk3 0.86 0.86
megf9 0.85 0.89
SEL1L 0.85 0.91
DMD 0.85 0.87
clcn4 0.84 0.89
SLC4A8 0.84 0.88
ABHD2 0.84 0.89
PCNX 0.83 0.86
Tex2 0.82 0.92
CPEB4 0.82 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.56 -0.62
higd1b -0.56 -0.61
C1orf54 -0.55 -0.69
MT-CO2 -0.55 -0.61
Rhoc -0.55 -0.63
AF347015.31 -0.54 -0.59
DBI -0.53 -0.64
FXYD1 -0.53 -0.58
CSAG1 -0.52 -0.55
AF347015.8 -0.51 -0.57

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004623 磷脂酶A2活性 艾达 10893423
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
GO:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
去:0051920 过氧化物活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016042 脂质分解代谢过程 IEA -
去:0009395 磷脂分解代谢过程 艾达 10893423
去:0006979 对氧化应激的反应 艾达 10893423
GO:0045454 细胞氧化还原稳态 IEA -
GO:0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 nas 9497358
去:0005634 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005764 溶酶体 IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG苯丙氨酸代谢 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Houstis Ros 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展G2 G3 UP 28 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 87 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马后产后 63 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫星对干扰素βdn的响应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成2 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧癌 83 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Burton脂肪形成峰在8小时 39 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein星形胶质细胞标记 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Ros 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
raghavachari血小板特异性基因 70 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因