基因页:PRDX6
概括?
基因 | 9588 |
象征 | PRDX6 |
同义词 | 1-cys | aop2 | hel-s-128m | nsgpx | prx | aipla2 | p29 |
描述 | 过氧蛋白6 |
参考 | MIM:602316|HGNC:HGNC:16753|Ensembl:ENSG00000117592|HPRD:03817|Vega:Otthumg0000000034804 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q25.1 |
Sherlock P值 | 0.173 |
TADA P值 | 6.16e-4 |
胎儿β | -0.78 |
支持 | G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA G2CDB.HUMANNRC g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PRDX6 | CHR1 | 173450463 | 一种 | n | NM_004905 NM_004905 |
。 。 |
内含子 剪接-Ceppector-In2 |
精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRDX6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ntrk3 | 0.86 | 0.86 |
megf9 | 0.85 | 0.89 |
SEL1L | 0.85 | 0.91 |
DMD | 0.85 | 0.87 |
clcn4 | 0.84 | 0.89 |
SLC4A8 | 0.84 | 0.88 |
ABHD2 | 0.84 | 0.89 |
PCNX | 0.83 | 0.86 |
Tex2 | 0.82 | 0.92 |
CPEB4 | 0.82 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.56 | -0.62 |
higd1b | -0.56 | -0.61 |
C1orf54 | -0.55 | -0.69 |
MT-CO2 | -0.55 | -0.61 |
Rhoc | -0.55 | -0.63 |
AF347015.31 | -0.54 | -0.59 |
DBI | -0.53 | -0.64 |
FXYD1 | -0.53 | -0.58 |
CSAG1 | -0.52 | -0.55 |
AF347015.8 | -0.51 | -0.57 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004623 | 磷脂酶A2活性 | 艾达 | 10893423 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
去:0051920 | 过氧化物活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016042 | 脂质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0009395 | 磷脂分解代谢过程 | 艾达 | 10893423 | |
去:0006979 | 对氧化应激的反应 | 艾达 | 10893423 | |
GO:0045454 | 细胞氧化还原稳态 | IEA | - | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | nas | 9497358 | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005764 | 溶酶体 | IEA | - | |
GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG苯丙氨酸代谢 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Houstis Ros | 36 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iizuka肝癌进展G2 G3 UP | 28 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 | 87 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莫迪海马后产后 | 63 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卫星对干扰素βdn的响应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成2 | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Burton脂肪形成峰在8小时 | 39 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein星形胶质细胞标记 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Ros | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常衰老 | 93 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
raghavachari血小板特异性基因 | 70 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |