基因页:CD40LG
概括?
基因 | 959 |
象征 | CD40LG |
同义词 | CD154 | CD40L | HIGM1 | IGM | IMD3 | T-BAM | TNFSF5 | TRAP | GP39 | HCD40L |
描述 | CD40配体 |
参考 | MIM:300386|HGNC:HGNC:11935|ENSEMBL:ENSG00000102245|HPRD:02311|Vega:Otthumg0000000022512 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ26 |
胎儿β | -0.488 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02992767 | X | 135729973 | CD40LG | 0.003 | -5.026 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CD40LG_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg t细胞受体信号通路 | 108 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IGA生产的KEGG肠道免疫网络 | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg哮喘 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG同种异体拒绝 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG初级免疫缺陷 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG病毒心肌炎 | 73 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Asbcell途径 | 12 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CD40途径 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NKT途径 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Th1th2途径 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL4 2 Pathway | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD40途径 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid nfat tfpathway | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Integin2途径 | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCR钙途径 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
淋巴机与非淋巴样细胞之间的反应组免疫调节性相互作用 | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Baris甲状腺癌DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钙虹膜虹膜素敏感与抗性 | 5 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤DN | 45 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黑元对癌细胞病毒的反应 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黑元对癌细胞病毒和环状RGD的反应 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a Targets Group1 | 136 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |