基因页面:IER2
总结吗?
GeneID | 9592年 |
象征 | IER2 |
同义词 | ETR101 |
描述 | 即早期反应2 |
参考 | HGNC: HGNC: 28871|运用:ENSG00000160888|HPRD: 09997|织女:OTTHUMG00000180790 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 p13.2 |
帕斯卡假定值 | 0.004 |
夏洛克假定值 | 0.325 |
胎儿β | -0.099 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
IER2 | chr19 | 13264208 | C | G | NM_004907 | p.70R > G | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs12059674 | chr1 | 57630277 | IER2 | 9592年 | 0.02 | 反式 | ||
snp_a - 4217300 | 0 | IER2 | 9592年 | 0.04 | 反式 | |||
rs2189803 | chr5 | 137684661 | IER2 | 9592年 | 0.06 | 反式 | ||
rs6537944 | chr9 | 137312827 | IER2 | 9592年 | 0.17 | 反式 | ||
rs1344796 | chr12 | 76397104 | IER2 | 9592年 | 0.15 | 反式 | ||
rs1885073 | chr14 | 104357181 | IER2 | 9592年 | 0 | 反式 | ||
rs6504601 | chr17 | 47278488 | IER2 | 9592年 | 0.1 | 反式 | ||
rs8077603 | chr17 | 47278642 | IER2 | 9592年 | 0.06 | 反式 | ||
rs11868965 | chr17 | 47279761 | IER2 | 9592年 | 0.1 | 反式 | ||
rs6504603 | chr17 | 47280651 | IER2 | 9592年 | 0.1 | 反式 | ||
rs2056531 | chr17 | 47283057 | IER2 | 9592年 | 0.06 | 反式 | ||
rs8141327 | chr22 | 48747918 | IER2 | 9592年 | 0.2 | 反式 | ||
rs4823758 | chr22 | 48766823 | IER2 | 9592年 | 0.01 | 反式 | ||
rs4823760 | chr22 | 48768195 | IER2 | 9592年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IER2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA2026 | 0.95 | 0.95 |
C5orf42 | 0.94 | 0.97 |
BIRC6 | 0.93 | 0.96 |
C10orf18 | 0.93 | 0.96 |
ZC3H7A | 0.93 | 0.95 |
TTC17 | 0.93 | 0.95 |
ZNF318 | 0.92 | 0.95 |
HEATR5B | 0.92 | 0.94 |
MGEA5 | 0.92 | 0.95 |
DOPEY1 | 0.92 | 0.94 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.79 | -0.87 |
AF347015.31 | -0.79 | -0.86 |
FXYD1 | -0.78 | -0.84 |
IFI27 | -0.77 | -0.84 |
HIGD1B | -0.76 | -0.86 |
AF347015.33 | -0.76 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.81 |
MT-CYB | -0.74 | -0.82 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.84 |
AF347015.21 | -0.74 | -0.88 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
DAVICIONI分子武器VS erm DN | 182年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHANDRAN转移TOP50 DN | 45 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN BASAKI YBX1目标 | 384年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥斯瓦尔德造血干细胞在胶原凝胶 | 233年 | 161年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN MLL签名2 DN | 281年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
长岛NRG1信号了 | 176年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
长岛EGF信号了 | 58 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应角化细胞 | 530年 | 342年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DELYS甲状腺癌DN | 232年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BERENJENO岩石信号不是通过RHOA DN | 48 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群1 DN | 378年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANHARANTA子宫肌瘤DN | 67年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
兰迪斯ERBB2乳房肿瘤324 | 150年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RASHI对电离辐射1 | 45 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群2 b | 392年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DIRMEIER LMP1反应早期 | 66年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMUNDSON基因毒性的签名 | 105年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
汤姆林转移DN | 20. | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX4 DN | 32 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOTZMANN上皮间充质转变DN | 206年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMIT EGF响应40海拉 | 42 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMIT 60 MCF10A EGF响应 | 39 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMIT 60 MCF10A血清反应 | 57 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MORI小PRE BII淋巴细胞DN | 76年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
白细胞介素6 BROCKE凋亡发生逆转 | 144年 | 98年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗斯AML AML1 ETO融合 | 76年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NEMETH炎症反应有限合伙人 | 88年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
盖瑞CEBP目标 | 126年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
高雄应对UVB辐射 | 86年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萨莫拉NOS2目标了 | 69年 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
击倒老化肌肉了 | 244年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DAZARD应对紫外线这些地方 | 244年 | 151年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SARTIPY正常胰岛素抵抗 | 34 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周肿瘤坏死因子信号30分钟 | 54 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SESTO应对紫外线C1 | 72年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
击倒卡路里限制肌肉 | 95年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
《图片报》极品致癌签名 | 261年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN | 373年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 | 482年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
西方肾上腺皮质肿瘤DN | 546年 | 362年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈HOXA5目标6小时 | 10 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈HOXA5目标9小时 | 223年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林NPAS4 DN的目标 | 68年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CROONQUIST基质刺激了 | 60 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CROONQUIST国家管制当局方面与基质刺激DN | 99年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHANDRAN转移DN | 306年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
中村脂肪形成早期DN | 38 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
中村DN后期脂肪生成 | 38 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赫希细胞转换签名 | 242年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PLASARI TGFB1 10人力资源的目标 | 199年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RAR绑定西文 | 462年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
冯氏TNF的目标了 | 63年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4同种型B | 517年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯米尔诺夫红外反应6小时DN | 114年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |