总结吗?
GeneID 9592年
象征 IER2
同义词 ETR101
描述 即早期反应2
参考 HGNC: HGNC: 28871|运用:ENSG00000160888|HPRD: 09997|织女:OTTHUMG00000180790
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 p13.2
帕斯卡假定值 0.004
夏洛克假定值 0.325
胎儿β -0.099
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
IER2 chr19 13264208 C G NM_004907 p.70R > G 错义 精神分裂症 认为:Fromer_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs12059674 chr1 57630277 IER2 9592年 0.02 反式
snp_a - 4217300 0 IER2 9592年 0.04 反式
rs2189803 chr5 137684661 IER2 9592年 0.06 反式
rs6537944 chr9 137312827 IER2 9592年 0.17 反式
rs1344796 chr12 76397104 IER2 9592年 0.15 反式
rs1885073 chr14 104357181 IER2 9592年 0 反式
rs6504601 chr17 47278488 IER2 9592年 0.1 反式
rs8077603 chr17 47278642 IER2 9592年 0.06 反式
rs11868965 chr17 47279761 IER2 9592年 0.1 反式
rs6504603 chr17 47280651 IER2 9592年 0.1 反式
rs2056531 chr17 47283057 IER2 9592年 0.06 反式
rs8141327 chr22 48747918 IER2 9592年 0.2 反式
rs4823758 chr22 48766823 IER2 9592年 0.01 反式
rs4823760 chr22 48768195 IER2 9592年 0.05 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA2026 0.95 0.95
C5orf42 0.94 0.97
BIRC6 0.93 0.96
C10orf18 0.93 0.96
ZC3H7A 0.93 0.95
TTC17 0.93 0.95
ZNF318 0.92 0.95
HEATR5B 0.92 0.94
MGEA5 0.92 0.95
DOPEY1 0.92 0.94
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.79 -0.87
AF347015.31 -0.79 -0.86
FXYD1 -0.78 -0.84
IFI27 -0.77 -0.84
HIGD1B -0.76 -0.86
AF347015.33 -0.76 -0.82
AF347015.27 -0.75 -0.81
MT-CYB -0.74 -0.82
AF347015.8 -0.74 -0.84
AF347015.21 -0.74 -0.88

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
DAVICIONI分子武器VS erm DN 182年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
CHANDRAN转移TOP50 DN 45 26 所有SZGR 2.0基因通路
DN BASAKI YBX1目标 384年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯瓦尔德造血干细胞在胶原凝胶 233年 161年 所有SZGR 2.0基因通路
MULLIGHAN MLL签名2 DN 281年 186年 所有SZGR 2.0基因通路
长岛NRG1信号了 176年 123年 所有SZGR 2.0基因通路
长岛EGF信号了 58 40 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标了 214年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应角化细胞 530年 342年 所有SZGR 2.0基因通路
DELYS甲状腺癌DN 232年 154年 所有SZGR 2.0基因通路
BERENJENO岩石信号不是通过RHOA DN 48 34 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群1 DN 378年 231年 所有SZGR 2.0基因通路
VANHARANTA子宫肌瘤DN 67年 45 所有SZGR 2.0基因通路
兰迪斯ERBB2乳房肿瘤324 150年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
RASHI对电离辐射1 45 27 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群2 b 392年 251年 所有SZGR 2.0基因通路
DIRMEIER LMP1反应早期 66年 48 所有SZGR 2.0基因通路
AMUNDSON基因毒性的签名 105年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
汤姆林转移DN 20. 16 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN 514年 330年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌症发展和BOX4 DN 32 22 所有SZGR 2.0基因通路
GOTZMANN上皮间充质转变DN 206年 136年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH MYC最大目标 775年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT EGF响应40海拉 42 29日 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT 60 MCF10A EGF响应 39 24 所有SZGR 2.0基因通路
AMIT 60 MCF10A血清反应 57 42 所有SZGR 2.0基因通路
MORI小PRE BII淋巴细胞DN 76年 52 所有SZGR 2.0基因通路
白细胞介素6 BROCKE凋亡发生逆转 144年 98年 所有SZGR 2.0基因通路
罗斯AML AML1 ETO融合 76年 55 所有SZGR 2.0基因通路
NEMETH炎症反应有限合伙人 88年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
盖瑞CEBP目标 126年 90年 所有SZGR 2.0基因通路
高雄应对UVB辐射 86年 55 所有SZGR 2.0基因通路
萨莫拉NOS2目标了 69年 41 所有SZGR 2.0基因通路
击倒老化肌肉了 244年 165年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病了布莱洛克的 1691年 1088年 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线这些地方 244年 151年 所有SZGR 2.0基因通路
SARTIPY正常胰岛素抵抗 34 27 所有SZGR 2.0基因通路
周肿瘤坏死因子信号30分钟 54 36 所有SZGR 2.0基因通路
SESTO应对紫外线C1 72年 45 所有SZGR 2.0基因通路
击倒卡路里限制肌肉 95年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
《图片报》极品致癌签名 261年 166年 所有SZGR 2.0基因通路
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN 373年 196年 所有SZGR 2.0基因通路
CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 482年 296年 所有SZGR 2.0基因通路
西方肾上腺皮质肿瘤DN 546年 362年 所有SZGR 2.0基因通路
陈HOXA5目标6小时 10 8 所有SZGR 2.0基因通路
陈HOXA5目标9小时 223年 132年 所有SZGR 2.0基因通路
林NPAS4 DN的目标 68年 48 所有SZGR 2.0基因通路
王肿瘤侵袭性了 374年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
CROONQUIST基质刺激了 60 42 所有SZGR 2.0基因通路
CROONQUIST国家管制当局方面与基质刺激DN 99年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
党受MYC 1103年 714年 所有SZGR 2.0基因通路
黄成人组织干细胞模块 721年 492年 所有SZGR 2.0基因通路
CHANDRAN转移DN 306年 191年 所有SZGR 2.0基因通路
中村脂肪形成早期DN 38 27 所有SZGR 2.0基因通路
中村DN后期脂肪生成 38 25 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 756年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
赫希细胞转换签名 242年 159年 所有SZGR 2.0基因通路
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 448年 282年 所有SZGR 2.0基因通路
PLASARI TGFB1 10人力资源的目标 199年 143年 所有SZGR 2.0基因通路
德拉克洛瓦RAR绑定西文 462年 273年 所有SZGR 2.0基因通路
冯氏TNF的目标了 63年 43 所有SZGR 2.0基因通路
不是通过P38冯氏TNF响应 337年 236年 所有SZGR 2.0基因通路
RATTENBACHER受CELF1 467年 251年 所有SZGR 2.0基因通路
RAO受SALL4同种型B 517年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
斯米尔诺夫红外反应6小时DN 114年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG类1引起的暂时性的EGF 516年 308年 所有SZGR 2.0基因通路