概括?
GeneID 960
Symbol CD44
Synonyms cdw44 | cspg8 | ecmr-iii | hcell | hutch-i | in | lhr | mc56 | mdu2 | mdu3 | mic4 | pgp1
Description CD44molecule (Indian blood group)
Reference MIM:107269|HGNC:HGNC:1681|Ensembl:ENSG00000026508|HPRD:00115|Vega:OTTHUMG00000044388
基因类型 protein-coding
地图位置 11P13
Pascal p-value 0.914
Sherlock P值 0.468
Fetal beta -1.661
DMG 2 (# studies)
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description Info
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
DMG:JAFFE_2016 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 2
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 2
表达 基因表达的荟萃分析 P价值:2.296
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.3948

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 染色体 位置 Nearest gene P (dis) beta(dis) FDR (dis) Study
CG08530414 11 35160400 CD44 5.85E-5 -0.381 0.023 DMG:Wockner_2014
cg18652941 11 35160892 CD44 7.87E-10 -0.033 1.03E-6 DMG:JAFFE_2016

@eQTL annotation

SNP ID 染色体 位置 eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS4592237 CHR1 4280629 CD44 960 0.05 反式
rs2997198 CHR1 80760865 CD44 960 0.16 反式
rs16846456 CHR3 172757337 CD44 960 0.02 反式
rs16873760 CHR6 45729388 CD44 960 0.15 反式
RS16873861 CHR6 45752854 CD44 960 0.16 反式
rs6922618 CHR6 49625289 CD44 960 0.12 反式
rs2254468 Chr9 16804196 CD44 960 0.09 反式
RS11186149 CHR10 82340706 CD44 960 0.07 反式
rs1952851 CHR13 30183178 CD44 960 0.01 反式

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
RHOC 0.69 0.67
ggy 0.68 0.66
DBI 0.67 0.67
MTCP1NB 0.67 0.65
PXMP3 0.66 0.60
MYL12A 0.65 0.63
C2orf76 0.64 0.57
NMI 0.63 0.64
serpinb6 0.63 0.65
BBOX1 0.63 0.62
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SPTBN2 -0.51 -0.54
PRDM2 -0.49 -0.54
PHACTR3 -0.48 -0.49
myo18a -0.48 -0.49
HNRNPUL2 -0.48 -0.50
NDRG1 -0.47 -0.52
TULP4 -0.47 -0.55
myt1l -0.47 -0.52
brsk2 -0.47 -0.51
SSBP3 -0.46 -0.56

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0004872 receptor activity IEA -
去:0003674 molecular_function ND -
GO:0005540 透明质酸结合 IEA -
GO:0005540 透明质酸结合 nas 1991450
去:0005488 binding IEA -
GO:0005518 collagen binding nas 2471973
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007160 cell-matrix adhesion nas 1922057|8640758
GO:0007155 细胞粘附 IEA -
GO:0016337 cell-cell adhesion nas 1922057|8640758
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005794 高尔基体 IDA 18029348
GO:0005575 cellular_component ND -
GO:0005737 cytoplasm IDA 18029348
GO:0016020 IEA -
去:0005925 focal adhesion IDA 18029348
GO:0009986 cell surface IDA 16809613
去:0005886 质膜 IDA 18029348
去:0005887 integral to plasma membrane nas 1991450
GO:0031012 extracellular matrix IDA 18029348

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b Experimental Source PubMed ID
Arhgef1 GEF1 | LBCL2 | LSC | P115-RHOGEF | SUB1.5 Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 - HPRD,Biogrid 12748184
CD4 CD4MUT CD4molecule - HPRD 7539755
CD74 dhlag |hladg |IA-Gamma CD74molecule, major histocompatibility complex, class II invariant chain - HPRD 8343954
Col14a1 UND collagen, type XIV, alpha 1 - HPRD,Biogrid 8986622
COL1A1 OI4 collagen, type I, alpha 1 - HPRD 1730778
COL1A2 OI4 collagen, type I, alpha 2 - HPRD 1730778
CSK MGC117393 C-SRC酪氨酸激酶 - HPRD 11084024
DMP1 DMP-1 牙本质基质酸性磷蛋白1 - HPRD 11825898
EGFR ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian) CD44与EGFR相互作用。 绑定 12093135
EGFR ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian) - HPRD,Biogrid 12093135
EPB41 4.1R | EL1 | HE erythrocyte membrane protein band 4.1 (elliptocytosis 1, RH-linked) - HPRD 12901833
EPB41L3 4.1B | DAL-1 | DAL1 | FLJ37633 | KIAA0987 erythrocyte membrane protein band 4.1-like 3 EPB41L3 (DAL-1) interacts with an unspecified isoform of CD44. 绑定 15688033
ERBB2 CD340 | HER-2 | HER-2/neu | HER2 | NEU | NGL | TKR1 v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) Affinity Capture-Western BioGRID 12093135
ERBB4 her4 |MGC138404 |P180ERBB4 v-erb-a erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 4 (avian) - HPRD,Biogrid 11825873
EZR CVIL | CVL | DKFZp762H157 | FLJ26216 | MGC1584 | VIL2 ezrin - HPRD,Biogrid 12032545|12370738
FGF2 BFGF | FGFB | HBGF-2 fibroblast growth factor 2 (basic) - HPRD 7532176
FN1 CIG | DKFZp686F10164 | DKFZp686H0342 | DKFZp686I1370 | DKFZp686O13149 | ED-B | FINC | FN | FNZ | GFND | GFND2 | LETS | MSF fibronectin 1 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 1730778
FYN MGC45350 | SLK | SYN Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 - HPRD,Biogrid 9573028
HBEGF DTR | DTS | DTSF | HEGFL 肝素结合EGF样生长因子 - HPRD,Biogrid 7532176
IGFBP3 BP-53 | IBP3 insulin-like growth factor binding protein 3 - HPRD,Biogrid 12127836
LCK YT16 | p56lck | pp58lck lymphocyte-specific protein tyrosine kinase - HPRD,Biogrid 8576267
MADCAM1 MACAM1 mucosal vascular addressin cell adhesion molecule 1 - HPRD 2474557
MMP7 MMP-7 | MPSL1 | PUMP-1 基质金属肽酶7(子宫素,子宫) - HPRD,Biogrid 11825873
MMP9 clg4b |凝胶|MMP-9 matrix metallopeptidase 9 (gelatinase B, 92kDa gelatinase, 92kDa type IV collagenase) - HPRD 10652271
NF2 ACN | BANF | SCH 神经纤维蛋白2(Merlin) - HPRD 12356905
PTPRC B220 | CD45 | CD45R | GP180 | LCA | LY5 | T200 protein tyrosine phosphatase, receptor type, C Co-fractionation BioGRID 9573028
SELE CD62E |Elam |ELAM1 |Esel |lecam2 selectin E - HPRD 11402070
SPP1 BNSP |BSPI |ETA-1 |MGC110940 |OPN secreted phosphoprotein 1 - HPRD 10657301|12377945
SRC ASV | SRC1 | c-SRC | p60-Src v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian) Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 11084024
SRGN FLJ12930 |MGC9289 |ppg |prg |PRG1 Serglycin - HPRD 9334256
TGFBR1 AAT5 | ACVRLK4 | ALK-5 | ALK5 | LDS1A | LDS2A | SKR4 | TGFR-1 反式forming growth factor, beta receptor 1 - HPRD,Biogrid 12145287
TGFBR2 AAT3 | FAA3 | LDS1B | LDS2B | MFS2 | RIIC | TAAD2 | TGFR-2 | TGFbeta-RII 转化生长因子,β受体II(70/80KDA) - HPRD 12145287
TIAM1 FLJ36302 T-cell lymphoma invasion and metastasis 1 - HPRD,Biogrid 10636882
VAV2 - VAV 2鸟嘌呤核苷酸交换因子 - HPRD,Biogrid 11606575
VCAN CSPG2 |DKFZP686K06110 |Ervr |PG-M |WGN |WGN1 versican - HPRD,Biogrid 10950950


V.途径注释

路径名 Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG ECM RECEPTOR INTERACTION 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG HEMATOPOIETIC CELL LINEAGE 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta单核细胞途径 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA MMP CYTOKINE CONNECTION 15 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Hyaluronan摄取和降解 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Hyaluronan代谢 14 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素伽马信号传导 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON SIGNALING 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING UP 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WATANABE RECTAL CANCER RADIOTHERAPY RESPONSIVE UP 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗雷索莫昔芬反应 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS UP 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KHSV miRNAS DN的Samols目标 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水DN抑制 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA UP 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NOJIMA SFRP2 TARGETS DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES DCC TARGETS DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ODONNELL TARGETS OF MYC AND TFRC UP 83 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS UP 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUMMEL BURKITTS LYMPHOMA DN 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA UP 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SABATES COLORECTAL ADENOMA UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGASHIMA NRG1 SIGNALING DN 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML DIVIDING VS NORMAL QUIESCENT DN 95 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BARIS THYROID CANCER DN 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OZANNE AP1 TARGETS UP 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF SIGNALING NOT VIA AKT1 6HR 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF信令不通过Akt1 48hr向上 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SNIJDERS AMPLIFIED IN HEAD AND NECK TUMORS 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIRMEIER LMP1 RESPONSE LATE UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAN从Anoikis逃脱 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLESINGER METHYLATED DE NOVO IN CANCER 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Khetchoumian Trim24靶向 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 DN 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 AND HIF1A UP 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOCKWOOD AMPLIFIED IN LUNG CANCER 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUENTHER GROWTH SPHERICAL VS ADHERENT DN 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS POORLY DN 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN SENESCENCE UP 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASQUALUCCI LYMPHOMA BY GC STAGE UP 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SUZ12 TARGETS 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETRETTO CARDIAC HYPERTROPHY 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 UP 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTROEM CORRELATED WITH IL5 DN 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASSO B LYMPHOCYTE NETWORK 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标 108 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEMETH INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABRAHAM ALPC VS MULTIPLE MYELOMA UP 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND UP 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG IMMORTALIZED BY TERT DN 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova Prox1靶向DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dorsey GAB2目标 31 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHURINGA STAT5A TARGETS DN 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASSO CD40 SIGNALING UP 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 24HR DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERRECCHIA RESPONSE TO TGFB1 C1 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAJATE RESPONSE TO TRABECTEDIN UP 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERRECCHIA EARLY RESPONSE TO TGFB1 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 18HR DN 178 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
盖斯对dsrna的响应 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 7 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 8HR 39 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURCHDEWALD SKIN CARCINOGENESIS DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HILLION HMGA1B TARGETS 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T4 94 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG BOUND BY FOXP3 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM APC TARGETS 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM WNT PATHWAY REQUIRE MYC 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 8G 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1 TARGETS DN 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG FOXA2 TARGETS DN 36 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER WITH H3K27ME3 DN 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Le滑雪目标 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE UP 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON AND RECTAL CANCER UP 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA METASTASIS MODEL DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
podar对Apaphostin的反应 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu肿瘤血管生成 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATTHEWS AP1 TARGETS 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA D DN 78 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOLDRATH ANTIGEN RESPONSE 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUIZ TNC TARGETS DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee早期T淋巴细胞DN 57 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Hepatoblast 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN IPS ICP WITH H3K4ME3 AND H327ME3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3 TARGETS UP 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI DNAJB4 TARGETS DN 6 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI PROSTATE CANCER EPIGENETIC 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN ES ICP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 12 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KARLSSON TGFB1 TARGETS UP 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌的王转移ESR1 DN 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR UP 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP B 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEGER ADIPOGENESIS DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮德森转移由ERBB2同种型7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
他611年目标CTF ISOFORM OF ERBB2 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang Gata2靶向 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong TNF靶向 63 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 PARTIAL 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLEMAN VINCRISTINE RESISTANCE B ALL DN 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性所有DN 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-27 1795年 1801 1A HSA-MIR-27Abrain UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
HSA-MIR-27Bbrain UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
mir-381 2953 2959 1A hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU