基因页：卡车
概括？
| 基因 | 9607 |
| 象征 | 卡车 |
| 同义词 | 大车 |
| 描述 | 购物车预肽 |
| 参考 | MIM：602606|HGNC：HGNC：24323|ENSEMBL：ENSG00000164326|HPRD：04006|Vega：Otthumg00000131261 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5q13.2 |
| Pascal P值 | 0.653 |
| 胎儿β | -4.48 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17472583 | CHR1 | 18340024 | 卡车 | 9607 | 0.16 | 反式 | ||
| RS7550971 | CHR1 | 244252164 | 卡车 | 9607 | 0 | 反式 | ||
| RS1371418 | CHR2 | 35830333 | 卡车 | 9607 | 0.17 | 反式 | ||
| RS1867683 | CHR5 | 53928375 | 卡车 | 9607 | 0.01 | 反式 | ||
| RS11063553 | CHR12 | 5287380 | 卡车 | 9607 | 0.11 | 反式 | ||
| RS1562121 | CHR13 | 43777113 | 卡车 | 9607 | 0.1 | 反式 | ||
| RS719089 | CHR18 | 55053775 | 卡车 | 9607 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| iqsec3 | 0.95 | 0.95 |
| CAMTA2 | 0.93 | 0.93 |
| tom1l2 | 0.93 | 0.90 |
| TTC7B | 0.93 | 0.93 |
| CNTNAP1 | 0.92 | 0.89 |
| MAP1A | 0.92 | 0.93 |
| ptprn | 0.92 | 0.92 |
| grin1 | 0.92 | 0.91 |
| SYN1 | 0.92 | 0.92 |
| RAD21L1 | 0.92 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C9orf46 | -0.52 | -0.53 |
| exosc8 | -0.51 | -0.46 |
| Bcl7c | -0.50 | -0.55 |
| C21orf57 | -0.50 | -0.50 |
| GTF3C6 | -0.49 | -0.48 |
| RBMX2 | -0.49 | -0.50 |
| RPL23A | -0.47 | -0.52 |
| RPS20 | -0.47 | -0.57 |
| RPS6 | -0.47 | -0.50 |
| RPS8 | -0.47 | -0.49 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0051971 | 神经冲动传播的积极调节 | 艾达 | 神经元（GO期限：8） | 11711504 |
| 去：0007268 | 突触传输 | IEA | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | - |
| 去：0007218 | 神经肽信号通路 | IEA | 神经递质（GO期限：8） | - |
| 去：0000186 | MAPKK活动的激活 | ISS | 15908120 | |
| 去：0001678 | 细胞葡萄糖稳态 | 艾达 | 11711504 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 8647455 | |
| 去：0008343 | 成人喂养行为 | ISS | - | |
| 去：0009267 | 细胞对饥饿的反应 | ISS | 15680948 | |
| GO：0032812 | 肾上腺素分泌的阳性调节 | 艾达 | 11711504 | |
| 去：0032099 | 食欲的负调节 | ISS | - | |
| 去：0032099 | 食欲的负调节 | 塔斯 | 11478874 | |
| GO：0032922 | 昼夜节律基因表达调节 | ISS | - | |
| GO：0045779 | 骨吸收负调节 | 小鬼 | 16614075 | |
| GO：0046850 | 调节骨头重塑 | IEA | - | |
| GO：0045671 | 破骨细胞分化的负调节 | 塔斯 | 16614075 | |
| GO：0045777 | 血压阳性调节 | 艾达 | 11711504 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | 艾达 | 11711504 | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | ISS | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 纳德里乳腺癌预后 | 50 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TSAI对电离辐射的响应 | 149 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kannan TP53目标 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MA垂体胎儿与成人DN | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-377 | 170 | 177 | 1A，M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |