基因页面:RIN1
总结吗?
| GeneID | 9610年 |
| 象征 | RIN1 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | Ras和Rab关联1 |
| 参考 | MIM: 605965|HGNC: HGNC: 18749|运用:ENSG00000174791|HPRD: 05813|织女:OTTHUMG00000167085 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q13.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.049 |
| 夏洛克假定值 | 0.202 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10490123 | chr2 | 49124701 | RIN1 | 9610年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs2215912 | chr2 | 49124804 | RIN1 | 9610年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs1445550 | chr13 | 64202211 | RIN1 | 9610年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 新的高度 | 0.74 | 0.74 |
| MFSD2 | 0.73 | 0.78 |
| CDH5 | 0.73 | 0.81 |
| 英格 | 0.71 | 0.78 |
| NOS3 | 0.70 | 0.76 |
| TIE1 | 0.69 | 0.75 |
| CXorf36 | 0.68 | 0.74 |
| ROBO4 | 0.68 | 0.74 |
| DOCK6 | 0.67 | 0.72 |
| TNFRSF1B | 0.67 | 0.73 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MTIF3 | -0.54 | -0.54 |
| C8orf59 | -0.48 | -0.55 |
| MRPS18C | -0.47 | -0.51 |
| VRK2 | -0.46 | -0.48 |
| BXDC1 | -0.46 | -0.47 |
| UQCRB | -0.45 | -0.48 |
| RWDD1 | -0.45 | -0.49 |
| CRYZL1 | -0.44 | -0.46 |
| ATP5J | -0.44 | -0.49 |
| C11orf51 | -0.43 | -0.46 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABL1 | ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 | ABL1与和磷酸化RIN1。 | 绑定 | 15886098 |
| ABL1 | ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 | - - - - - - | HPRD | 9144171 |
| ABL2 | ARG ABLL | | FLJ22224 | FLJ31718 | FLJ41441 | v-abl Abelson小鼠白血病病毒致癌基因同族体2 (arg Abelson-related基因) | ABL2与和磷酸化RIN1。 | 绑定 | 15886098 |
| 极品 | C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 | v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 7862125|15031288 |
| 极品 | C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 | v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 | - - - - - - | HPRD | 7862125|9144171 |
| MLLT4 | AF-6 | AF6 | AFADIN | FLJ34371 | rp3 - 431 p23.3 | 骨髓/淋巴或mixed-lineage白血病(trithorax同系物,果蝇);转移到4 | 2台混合动力 | BioGRID | 10545207 |
| RAB5A | RAB5 | RAB5A, RAS致癌基因家族成员 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11703925 |
| RAB5B | - - - - - - | RAB5B, RAS致癌基因家族成员 | 2台混合动力 | BioGRID | 11703925 |
| RALGDS | FLJ20922 | RGF | RalGEF | 、鸟嘌呤核苷酸分解刺激器 | 2台混合动力 | BioGRID | 10545207 |
| RRAS2 | TC21 | RAS相关病毒(r-ras)致癌基因同族体2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11788587 |
| YWHAB | GW128 | HS1 | KCIP-1 | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,β多肽 | - - - - - - | HPRD | 9144171|11784866 |
| YWHAE | 14-3-3E | FLJ45465 | KCIP-1 | MDCR | MDS | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,ε多肽 | - - - - - - | HPRD | 9144171|11784866 |
| YWHAZ | KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、ζ多肽 | - - - - - - | HPRD | 9144171 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID ERBB1下游通路 | 105年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID RAS途径 | 30. | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HUMMERICH皮肤癌症恶化 | 88年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAIRKEE叔目标了 | 380年 | 213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRUETZMANN胰腺癌起来 | 358年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛佩兹MBD的目标 | 957年 | 597年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌11 q12 Q14扩增子 | 158年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 霍夫曼细胞淋巴瘤DN | 39 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN TAVOR CEBPA目标 | 30. | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI了多发性骨髓瘤 | 412年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆衰老的大脑了 | 262年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒6小时DN | 160年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒12小时DN | 101年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN | 254年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 经典VERHAAK胶质母细胞瘤 | 162年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |